DNA基础知识

・ Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast two-hybrid system technique with introduction to its background. The following procedure ...

Carbohydrate Assay (Hancock Laboratory) (Accessible only by IE)This protocol is used to determine the relative amounts of LPS CHO present in a given strain. The assay can be done on one set of sample ...

Preparing Overnight Bacteria Culture (LaboratoryExperiments.com)This is a basic procedure for high school students and useful for those who are new to molecular biology. Bacteria Growth and Culture ...

Antibiotic Concentration in Media (Lazo Lab) ...

Gram Staining (+\-) (William H. Heidcamp) Gram-Staining Procedure (MEDIC U of Texas)Very nice and detailed method description for Gram staining Acid-Fast Stain (Putt's Method)To detect the presenc ...

Preparing Lawn Cells for M13 Cloning (Life Technologies)Lawn cells require the F' episome for M13 infection and may be prepared Streaking Lambda Phages (Donis Keller Lab)Phage are streaked onto a me ...

・ Lambda DNA Preparation (Stanford DNA Sequence & Technology Center)Detailed protocol for lambda DNA preparation with recipes・ Isolation of Lambda DNA: Quick Method (Molecular Genetics ...

Or gel mobility shift assay gel shift assay gel retardation electrophoretic mobility shift assay (EMSA) EMSA Using Oligos (Mike A. Dyer)Anneal two complementary oligos to make ds oligos as the probe ...

Footprinting Procedures・ DNase I Footprinting (Mike A. Dyer)・ DNase I footprintingDetermining the site of binding for a protein on a DNA sequence・ DNase I Footprinting (Bowtell ...

中文操作手册Access RT-PCR系统AluQuantDNAIQ系统（案例）DNAIQ系统（数据库）GenePrint® STR系统Matrix 310Matrix 3100NGF Emax免疫测试系统pGEM-T和pGEM-T Easy 载体系统Powerplex 16组织和毛发提取试剂盒siLentGene™ U6 盒 RNA 干扰系统 ...

edited by Bruce A. Roe Judy S. Crabtreeand Akbar S. KhanDepartment of Chemistry and Biochemistry The University of Oklahoma Norman Ok

PCR-SSCP法 PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上，短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象，一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构，这种二级结构依赖于其碱基组成，即使一个碱基的不同，也会形成不同的二级结构而出刺同的迁移率。由于该法简单快速，因而被广泛用于未知基因突变的检测。用PCR-SSCP法检测 ...

参考文献：［1］Donohoe GG et al. Clin Chem，1999，45(1)：143～146［2］Grossman PD. Nucleic Acids Res，1994，22：4527～4534［3］Barta C et al. J Chromatogr A，1998，817(1－2)： 281～286［4］Mitchell CE et al. Anal Biochem，1995， ...

制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤，通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素，以保证DNA的完整性，为后续的实验打下基础。一般真核细胞基因组DNA有107-9bp，可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取，常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞，随后用酚抽提而实现的。这一方法获得的DNA ...

细菌质粒是一类双链、闭环的DNA，大小范围从1kb至200kb以上不等。各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份，通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态，但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上，随着染色体的复制而复制，并通过细胞分裂传递到后代。 质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子，重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。目前已有许多方法可用 ...

λ噬菌体是最早使用的克隆载体，λ噬菌体的基因组是一长度约为50kb的双链DNA分子，它在宿主细胞有两种生活途径，其一是裂解生长，环状DNA分子在细胞内多次复制，合成大量噬菌体基因产物，装配成噬菌体颗粒，裂解宿主菌再进行下一次感染；其二是溶源性生长，即感染细胞内λ噬菌体DNA整合到宿主菌染色体DNA中与之一起复制，并遗传给子代细胞，宿主细胞不裂解。平板培养时，裂解生长形成噬斑。液体培养时，裂解 ...

质粒、噬菌体等经酶切，电泳；PCR产物经电泳后，常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化，用于亚克隆、探针标记等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等，也有现成的试剂盒供应。一、冻融法1. 紫外灯下仔细切下含待回收DNA的胶条，将切下的胶条（小于0.6g）捣碎，置于1.5ml离心管中；2. 加入等体积的Tris-HCl饱和酚（pH 7.6），振荡混匀；3. - ...

细胞凋亡中染色体DNA的断裂是个渐进的分阶段的过程，染色体DNA首先在内源性的核酸水解酶的作用下降解为50-300kb的大片段。然后大约30 �的染色体DNA在Ca ²+和Mg²+依赖的核酸内切酶作用下，在核小体单位之间被随机切断，形成180～200bp核小体DNA多聚体。DNA双链断裂或只要一条链上出现缺口而产生的一系列DNA的3’-OH末端可在脱氧核糖核苷酸末端转移酶（TdT）的作用下，将脱氧 ...

继分析DNA的Southern杂交方法出现后，1977年Alwine等人提出一种与此相类似的、用于分析细胞总RNA或含poly A尾的RNA样品中特定mRNA分子大小和丰度的分子杂交技术，这就是与Southern相对应而定名的Northern杂交技术。这一技术自出现以来，已得到广泛应用，成为分析mRNA最为常用的经典方法。 与Southern杂交相似，Northern杂交也采用琼脂糖凝胶电泳， ...

将克隆化基因插入合适载体后导入大肠杆菌用于表达大量蛋白质的方法一般称为原核表达。这种方法在蛋白纯化、定位及功能分析等方面都有应用。大肠杆菌用于表达重组蛋白有以下特点：易于生长和控制；用于细菌培养的材料不及哺乳动物细胞系统的材料昂贵；有各种各样的大肠杆菌菌株及与之匹配的具各种特性的质粒可供选择。但是，在大肠杆菌中表达的蛋白由于缺少修饰和糖基化、磷酸化等翻译后加工，常形成包涵体而影响表达蛋白的 ...