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NO WEDGE Sequencing Gels

I have been using an alternative to wedge gels that saves acrylamide cuts gel drying time to 20 min and gives as good or better band squashing at the bottom of the gel. It was published in BioTechniqu ...

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病毒DNA和RNA的简易纯化技术

生物通报道: EZ1病毒迷你试剂盒(EZ1 Virus Mini Kit)是一种能够用于生命科学研究中的病毒DNA和RNA提纯的新型试剂盒。这种试剂盒提供了一种全自动的同步纯化来自血清、血浆和无细胞体液中的病毒DNA和RNA的能力,并且能对下游分析提供高灵敏度的检测。BioRobot® EZ1工作区的自动化使研究人员能够一次完成1到6个样品的处理。高产出的特点(即使在低的病毒浓度下)使下游检测具有 ...

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DNA重组实验中常用的技术(一)

一、质粒DNA的提取及鉴定(一)质粒DNA的提取及鉴定  1.收获细菌  (1)将2ml含相应抗生素的LB液体培养基加入到通气良好的15ml的试管中,接入一单菌落,于37℃剧烈振荡培养过夜。  (2)将1.5ml培养物倒入1.5ml离心管中,用台式离心机于4℃以12000g离心5min,将剩余的培养物贮存于4℃。  (3)吸尽培养液,使细菌沉淀尽可能干燥。  2.碱裂解法小量抽提质粒  (1)将细 ...

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DNA重组实验中常用的技术(二)

DNA的重组  (一)DNA的酶切与连接  (1)酶切反应  同质粒DNA的鉴定,只不过是质粒DNA换为载体DNA。若大量酶切,则成比例增加。  (2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。  (3)15000rpm离心15min,弃上清。  (4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃上清,真空抽干。  (5)加入适量1×TE溶解。如此可得线性化载体DNA ...

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DNA回收纯化及重组体的构建

相关基础知识 1.DNA片段的纯化: DNA纯化的主要目的是回收得到纯的目的DNA片段,去除影响DNA连接酶活性的物质以及其它的DNA片段。纯化DNA片段的方法有多种,如:电洗脱法、从低熔点或普通琼脂糖凝胶中回收、玻璃珠纯化、柱层析以及硅胶吸附等方法。目前一些生物公司推出了直接从 PCR产物中或琼脂糖凝胶中回收DNA片段的试剂盒,有效地加快了DNA的纯化的速度。 2.DNA重组 DNA重组本 ...

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核酸提取 基因组DNA的提取

DNA是遗传信息的载体是最重要的生物信息分子是分子生物学研究的主要对象因此DNA的提取也应是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作,如不能有效的完成DNA提取方面的工作,那就根本谈不上进行分子生物学方面的实验。在DNA提取过程中应做到1根据不同研究需要,保证结构的相应完整性;2尽量排除其它大分子成分的污染(蛋白质、多糖及RNA等);3保证提取样品中不含对酶有抑制作用的有机溶剂及高浓度的 ...

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方法二:细菌基因组DNA的微量提取法

本方法通过SDS裂解细胞,蛋白酶降解蛋白,CTAB去除多糖成分一:仪器:同方法一 二:试剂:TE、TAE缓冲液;10%SDS;5MNaCL;20mg/ml蛋白酶K;CTAB/NaCL溶液(10% CTAB,0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中,缓慢加入10gCTAB,加热溶解);25/24/1酚/氯仿/异戊醇; 24/1氯仿/异戊醇;异丙醇;70%及100%乙醇三:操作 1.5 ...

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方法三:酵母菌基因组DNA的提取

方法三:酵母菌基因组DNA的提取一:仪器:同方法一 二:试剂:SE缓冲液(1M山梨醇,0.1MEDTA pH7.5);溶菌酶(50mg/ml);20%PVP;蛋白酶K缓冲液(10mM Tris pH7.6 0.5% SDS 1mM EDTA);其余同前三:操作 1.5ml 对数生长期细菌细胞 离心,12000rpm1-2min 沉淀 溶于590ul ...

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放射性同位素标记的DNA序列测定分析

放射性同位素标记的DNA序列测定分析 测定DNA的核苷酸序列是分析基因结构与功能关系的前提。从小片段重叠法到加减法、双脱氧链终止法、化学降解法、自动测序,DNA测序技术发展很快。目前在实验室手工测序常用Sanger双脱氧链终止法。Sanger法就是使用DNA聚合酶和双脱氧链终止物测定DNA核苷酸序列的方法。它要求使用一种单链的DNA模板或经变性的双链DNA模板和一种恰当的DNA合成引物。其基 ...

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放射性同位素标记的DNA序列测定分析

放射性同位素标记的DNA序列测定分析 测定DNA的核苷酸序列是分析基因结构与功能关系的前提。从小片段重叠法到加减法、双脱氧链终止法、化学降解法、自动测序,DNA测序技术发展很快。目前在实验室手工测序常用Sanger双脱氧链终止法。Sanger法就是使用DNA聚合酶和双脱氧链终止物测定DNA核苷酸序列的方法。它要求使用一种单链的DNA模板或经变性的双链DNA模板和一种恰当的DNA合成引物。其基 ...

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目的基因的亚克隆

目的基因的亚克隆 所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆,其目的在于对目的DNA进行进一步分析,或者进行重组改造等。 亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。 一、试剂准备1.LB液体培养基:胰化蛋白胨(细菌培养用)10g,酵母提取物(细菌培养用) 5g,NaCl 10g,加ddH2O 至 ...

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DNA分子的限制性内切酶消化

限制性内切酶可特异地结合于一段被称为限制酶识别序列的DNA序列位点上并在此切割双链DNA。绝大多数限制性内切酶识别长度为4、5或6个核苷酸且呈二重对称的特异序列,切割位点相对于二重对称轴的位置因酶而异。一些酶恰在对称轴处同时切割DNA双链而产生带平端的DNA片段,另一些酶则在对称轴两侧相对的位置上分别切断两条链,产生带有单链突出端(即粘端)的DNA片段。1个单位限制性内切酶是指在最适条件下,在50 ...

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目的基因的亚克隆

目的基因的亚克隆 所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆,其目的在于对目的DNA进行进一步分析,或者进行重组改造等。 亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。 一、试剂准备1.LB液体培养基:胰化蛋白胨(细菌培养用)10g,酵母提取物(细菌培养用) 5g,NaCl 10g,加ddH2O 至 ...

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PCR产物克隆

PCR克隆主要有TA克隆法 限制性酶切与连接法,杂交法和近期开发出来的特异性重组法等。但因为TA克隆法操作最简单,快速和高效的原因,成为Taq聚合酶PCR产物的最佳克隆方法。TA克隆法由Invitrogen发明,并拥有全球TA Cloning商标的专利权。TA克隆方法(Original TA Cloning Kit)利用Taq聚合酶同时具有的末端连接酶的功能,在每条PCR扩增产物的3`端自动添加一 ...

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PCR产物克隆

PCR克隆主要有TA克隆法 限制性酶切与连接法,杂交法和近期开发出来的特异性重组法等。但因为TA克隆法操作最简单,快速和高效的原因,成为Taq聚合酶PCR产物的最佳克隆方法。TA克隆法由Invitrogen发明,并拥有全球TA Cloning商标的专利权。TA克隆方法(Original TA Cloning Kit)利用Taq聚合酶同时具有的末端连接酶的功能,在每条PCR扩增产物的3`端自动添加一 ...

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Southern 杂交一般操作

一 基因组酶切和电泳在200 μl 微量离心管中加入:25 μl DNA样品(约10μg),3μl 限制性内切酶(MBI,10 U/ μl)5 μl 相应的10×buffer,补水到50μl。然后加一滴矿物油覆盖 稍微离心后放于37℃水浴8-12小时。酶切完后,取5μl 酶切DNA样品于0.8%的琼脂糖凝胶上检测酶是否充分。如果酶切充分,灌制0.8%的agrose胶,加入上样buffer后,在25 ...

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Southern 杂交一般操作

一 基因组酶切和电泳在200 μl 微量离心管中加入:25 μl DNA样品(约10μg),3μl 限制性内切酶(MBI,10 U/ μl)5 μl 相应的10×buffer,补水到50μl。然后加一滴矿物油覆盖 稍微离心后放于37℃水浴8-12小时。酶切完后,取5μl 酶切DNA样品于0.8%的琼脂糖凝胶上检测酶是否充分。如果酶切充分,灌制0.8%的agrose胶,加入上样buffer后,在25 ...

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Southern 杂交鉴定

1)取10ul待测DNA,于一定浓度的琼脂糖凝胶上进行电泳。(20mL1.0%凝胶)2) 凝胶用溴化乙锭染色,切掉凝胶四周多余部分,并在凝胶的一角作一记号 拍照记录电泳结果(拍照时 凝胶旁放一尺子)。3) 杂交用胶的制备 (做以下步骤两组合一)A.将凝胶浸没入30mL 0.25mol/L HCl溶液中15min,使DNA脱嘌呤。B.用蒸馏水短暂洗凝胶2次。C.将凝胶浸没入30mL变性液中3 ...

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Pyrosequencing DNA分析系统:基因甲基化研究的最佳工具

甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中,基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后,这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化,把健康人的大便与结肠癌患者的大便区分开。大便标本中SFRP2 甲基化的程度是诊断结肠癌最灵敏的标记。研究人员发现,肿瘤的 ...

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DNA序列测定技术

DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略  目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由 ...

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