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转化子DNA的快速鉴定

快速细胞破碎法实验步骤: 1、 挑取转化平板上的单菌接种于含相应抗生素的2ml LB中,37℃振荡培养至A590值为0.6~0.8。 2、 取1ml菌液至1.5ml Eppendorf管中,9000rpm离心9min,去尽上清。 3、 加入70μl Cracking Gel缓冲液20%SDS 10ml,250mmol/L EDTA 1.6ml蔗糖27.2g,1.2%溴酚蓝1.67ml,加双 ...

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Qiagen MIDI protocol

1. Pick a single colony from a streak plate and inoculate 25 ml of LB with appropriate antibiotic. Incubate overnight. 2. Get an ice bucket ready and put buffer P3 (stored in 4℃) in it. Pour the cultu ...

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DNA重组技术常用酶

限制性核酸内切酶 :识别DNA特定序列,切断DNA链 ; DNA聚合酶Ⅰ: 或Klenow 1、缺口平移制作标记DNA探针; 2、合成cDNA的第二链; 3、填补双链DNA3’凹端; 4、DNA序列分析耐热DNA聚合酶(Taq DNA聚合酶等) 聚合酶链反应(PCR); DNA连接酶: 连接两个DNA分子 ; 多核苷酸激酶 :催化多核苷酸5’羟基末端磷酸化,制备末端标记探 ...

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DNA的限制性内切酶酶切分析

限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP的存在。Ⅰ类酶结合于识别位点并随机的切割识别位点不远处的DNA,而Ⅲ类酶在识别位点上切割DNA分子,然后从底物上解离。Ⅱ类由两种酶组成: 一种为限制性内切核酸酶(限制酶),它切割某一特异的核苷酸序列; 另一 ...

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分子克隆的常用工具酶(组图)

限制和修饰现象在上个世纪中期被人们所发现,到 2005年1月,已经发现4342 种限制酶和甲基化酶,其中限制酶有3681 种。限制性内切酶有特定的识别位点和切割位点,切割后可产生平末端或粘性末端。酶切有标准的反应体系,受末端长度的影响,有位点偏爱性,在极端非标准条件下会产生星星活性。通过酶切连接可以增减酶切位点,酶切位点在基因组中的分布是不均匀的。大肠杆菌有三种甲基化酶和三种依赖于甲基化的限制系统 ...

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功能基因cDNA3'末端的克隆

一.原理 (1) 以目的mRNA 为模板,使用Oligo dT-3sites Adaptor Primer 进行反转录反应,合成1st Strand cDNA。 (2) 使用含有KpnI、XbaI、BamH I 酶切位点的上游特异性引物和3sites Adaptor Primer进行PCR反应。 (3) 使用限制性酶(KpnI、XbaI或BamH I)对PCR产物进行酶切反应。 (4) 选用适当载 ...

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电穿孔技术在动物克隆及转基因中的应用

Application of Electroporation in Gene Transfer and Animal Embryo Cloning 郝新保 范清宇 Hao Xin-bao Fan Qing-yu 第四军医大学全军骨肿瘤研究所 西安 710038 Institute of Orthopedic Oncology Fourth Military Medical Universit ...

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Side directed mutagenesis with 17kb plasmid-Molecular Bi

Hey everybody I am working on a side-directed mutagenesis with the Stratagene℃ quickchange mutagenesis xl-kit. Here is my problem: My plasmid is 17kb big. Until now I have had no colonies on my plate. ...

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新的测序策略

对某文库全部片段进行末端序列测定中未测到的碱基数,即缺口(gap),与已测定的总碱基数相关。随着已测定碱基数的增加,缺口的总碱基数目会按照泊松公式的一个推论(P=e-m )迅速减小。其中P为中某个碱基未被测定的概率,m为所测定的碱基数与大小相比的倍数。m越大P值越小。当m值达到5(即随机测定的碱基数达到5倍时),基因组中未测定的碱基数为总碱基数的0.67%(e-5 =0.0067)。对流感嗜血杆菌 ...

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SSR GEL and Silver Staining Protocol

Paula Marquardt & Craig Echt Published in: Echt CS May-Marquardt P Hseih M Zahorchak R. 1996. Characterization of microsatellite markers in eastern white pine. Genome 39:1102-1108 . comments can b ...

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Cloning using ds Oligos-Molecular Biology

Hello group! I want to insert a small 30 bp sequence into a vector of mine using ds-oligo. I've created the oligos so that once annealed they have the correct overhangs of the restriction sites. As I' ...

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分子克隆载体

DNA片段的克隆需要合适的载体,载体或是质粒,或是噬菌体,或是病毒,通常大多经过人工改造一、质粒 常用的有pBR322,pUC系列质粒等。 (一)pBR322质粒是4362bp的环状双链DNA载体,有2个抗药性基因(四环素和氨苄青霉素),一个复制起始点和多个用于克隆的限制酶切点。当缺失抗药性基因的大肠杆菌被pBR322成功地转化时,它便从该质粒获得了抗生素抗性。两个抗生素基因中均含供插入外源DN ...

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Clean-up for Ethidium Bromide

Caution: EtBr is a powerful mutagen and is moderately toxic. Wear gloves when working. When EtBr conc. is >0.5 mg/ml: 1.Add sufficient water to reduce the concentration of EtBr to <0.5 mg/ml. ...

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表达基因克隆技术与图谱构建策略研究

人类基因组计划的主要任务之一就是要从大片段基因组区域或整条染色体DNA 上鉴定出基因表达序列(gene expressed sequences)或转录单位(transcription units)。在人类基因组30亿个碱基对中,发生转录的表达序列(即基因)仅占总序列的3~5%。基因组中 绝大部分是基因间隔序列(intergenic seguences)或 内含子(intron)和各种各样的重复序列 ...

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DNA extraction from blood-Molecular Biology

I am trying to extract DNA from mammalian blood but while doing the phenol extraction lot of Gelatinous material in aqeous phase creating problem in its separation. Can somebody tell me how to m ...

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基因治疗(Gene therapy)

基因治疗的概念:基因治疗(gene therapy)就是用正常或野生型(wild type)基因矫正或置换致病基因的一种治疗方法。在这种治疗方法中,目的基因被导入到靶细胞(target cells)内,他们或与宿主细胞(host cell)染色体整合成为宿主遗传物质的一部分,或不与染色体整合而位于染色体外,但都能在细胞中得到表达,起到治疗疾病的作用。目前基因治疗的概念了较大的扩展,凡是采用分子生物 ...

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连接反应的影响因素

1、连接缓冲液的影响:大体上缓冲液含有以下组分:20-100mmol/L的Tris-HCl,较多用50mmol/L,pH的范围在7.4-7.8,较多用7.8,目的是提供合适酸碱度的连接体系;10mmol/L的MgCl2,作用是激活酶反应;1-20mmol/L的DTT,较多用10mmol/L,作用是维持还原性环境,稳定酶活性,25-50ug/ml的BSA,作用是增加蛋白质的浓度,防止因蛋白浓度过稀而 ...

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平端DNA连接

T4噬菌体DNA连接酶不同于大肠杆菌DNA连接酶,它可以催化平端DNA片段的连接(Sgaramella和Khorana,1972;Sgaramella和Ehrlich,1978),由于DNA很容易成为平端,所以这是一个极为有用的酶学物性。有了这样的物性,才能使任何DNA分子彼此相连。 优点: 1、没有连不上的,只有切不开的。平末端连接不牵扯到粘性末端的碱基突出问题,所以,理论上任何两条DNA序列都 ...

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Ethanol vs Isopropanol for DNA precipitation-Molecular B

QUOTE julianne: been using sod acetate- isoprop precipiation with no problems all the while. QUOTE Turtle: my suggestion would be to ethanol precipitate QUOTE for PCR product purification used for clo ...

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酶切基础知识

酶切的原理: DNA酶切一般分为质粒直接酶切和PCR产物酶切。限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类、Ⅱ类、Ⅲ类。Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP的存在。Ⅰ类酶结合于识别位点并随机的切割识别位点不远处的DNA,而Ⅲ类酶在识别位点上切割DNA分子,然后从底物上解离。Ⅱ类由两 ...

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