组蛋白乙酰化在肿瘤发生中的作用 组蛋白乙酰化状态取决于组蛋白乙酰基转移酶(HAT)与组蛋白去乙酰化酶(HDAC)之间的活性竞争。HDAC异常结合到特定的启动子区,从而抑制正常功能基因的转录,可能是恶性肿瘤发生的机制之一。HDAC抑制剂在肿瘤治疗中具有一定作用,这也说明组蛋白的乙酰化与肿瘤之间存在一定关系。很多研究已经表明,癌基因和抑癌基因的异常表达与肿瘤的发生有关。 肿瘤发生时,组 ...
miRNA与肿瘤 miRNA对细胞的增殖、分化和凋亡有重要的调节作用,它们在正常组织和肿瘤组织中的表达显著不同,因此可以认为它们参与了肿瘤的发生、发展和预后。近期的研究发现,一些miRNA在肿瘤细胞中表达明显减少,提示着这些分子可能作为抑癌分子,如MiR―127可以诱导癌基因BCL6的下调。有些研究还显示,MIR的表达也受DNA甲基化和组蛋白修饰调节。这为肿瘤的治疗提示了一个新方向。 ...
DNA甲基化的研究方法 DNA甲基化的分析方法很多,可分为总基因组甲基化的检测和单基因序列特异性甲基化分析的研究。总基因组甲基化的检测又分为全基因组序列特异性甲基化分析和基因组非特异性甲基化水平的研究。前者包括甲基化差异性杂交显示(differential methylation hybridization,DMH)、寡核苷酸微阵列法和基因组限制性酶切扫描法(restriction lan ...
基因组限制性酶切扫描法(restriction landmark genome scanning,RLGS) 该方法是将基因组DNA放射性标记,首次电泳后原位消化,二维电泳成约2 000个离散片段。这些片段几乎包含了整个基因组序列,并且片段大小适合克隆和序列分析。RLGS能在凝胶中定量分析数千个CpG岛的结构和甲基化变化,而无需已知基因序列。 1)RLGS的基本步骤 (1)首 ...
亚硫酸氢钠测序法(bisulfite genomic sequencing) 直接测序法是建立在MSP基础上进一步深入研究CpG岛各个位点甲基化情况的方法。重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,行PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后,对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列 ...
结合亚硫酸氢钠处理和酶解分析(COBRA) 亚硫酸氢钠处理的DNA扩增后使甲基化的胞嘧啶残基成为胸腺嘧啶,而已经甲基化的胞嘧啶残基仍维持胞嘧啶。这种变化会产生新的酶切位点或保持原有的甲基化依赖位点。PCR反应的引物中不包含CpG二核苷酸,因此与模板和原来的甲基化位点不会混淆。在此之后,将PCR产物纯化、酶切、聚丙烯酰胺凝胶电泳、电印迹、单核苷酸杂交和磷图像定量。 COBRA是一个测 ...
DNA甲基化抑制剂和HDAC在肿瘤治疗中的应用 目前发现一些胞嘧啶类似物可以抑制DNMT活性,例如5―氮杂胞嘧啶核苷和它的脱氧类似物5―氮杂―2―脱氧胞嘧啶核苷,它们可以有效地抑制DNA甲基转移酶。通过在DNA复制过程中取代胞嘧啶及与DNMT,形成共价键后抑制DNMT的活性及抑制DNA甲基化,被广泛应用于研究DNA甲基化的生物过程和治疗急性粒细胞白血病。但这两种药物在水溶液中不稳定,且有毒 ...
细胞信号转导的概念 生物体是有一群具有特殊结构与功能的细胞组成的复杂有机体,生物物种的繁衍,遗传特性的保持,以及生物个体的发生、发展,机体各部分之间和生物体内外环境的统一等所有生命活动,都是在细胞信息传递和调控下进行的。因此多细胞生物对外界的刺激(包括物理、化学、生物因素),需要细胞间复杂的信号转导系统来传递,从而调控机体内每个功能各异细胞的新陈代谢和行为,以保证整个生命活动的正常进行。细 ...
甲基化荧光PCR检测 甲基化荧光检测(methylight)是利用荧光定量性PCR检测亚硫酸氢钠处理后的序列改变。在TaqManR技术中,可以使用3种不同的单核苷酸(正义引物、反义引物和荧光杂交探针),进行不同序列的检测。与已存在的技术相比,甲基化荧光检测最明显的优点就是能同时对几百甚至几千例样品迅速检测。 高敏感、快速是本方法最显著的特点,它可以在非甲基化等位基因超出10 ...
酶的区域性甲基化特异性分析(ERMA) 酶的区域性甲基化分析是一种定量区域性CpG甲基化密度研究方法。基因组DNA在亚硫酸氢钠处理后,感兴趣的区域由包含dam位点的引物扩增。扩增后的PCR产物与14C标记的SAM及dam甲基转移酶温育,作为标准DNA定量的内参照。之后将3H标记的SAM和M.SssI甲基转移酶温育。在每个检测中使用具有确定甲基化位点细胞系DNA的标准混合物,每个样品的3H/ ...
组蛋白乙酰化的研究方法 1.HAT活性的测定 HAT可以催化放射性标记的乙酰辅酶A掺人核心组蛋白(有的选用H4氨基末端的14个氨基酸短肽)底物,然后测定掺人的放射性强度可以确定HAT的活性。HAT的活性单位定义为30~C时,将1pmol醋酸在10rain内掺人小牛胸腺组蛋白所需的酶量。 2.HDAC活性的分析 HDAC活性的检测比较烦琐。 3.染色质免疫沉淀技术 ...
甲基化敏感的单核苷酸的扩增(Ms―SnuPE) Ms―SnuPE即甲基化特异的单核苷酸扩增,它能对不同甲基化特异位点进行快速定量,是一种快速估计特异性CpG位点甲基化不同情况的定量方法。 先用重亚硫酸盐处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶全部转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。进行PCR扩增,然后取等量扩增产物置于2管中,分别作为Ms―SnuPE单核苷酸引物延伸的模板。设计用于Ms― ...
DNA甲基化在肿瘤诊断中应用 表观遗传学吸引入的地方就是在肿瘤的早期检测中的应用,因为研究表明表观遗传的变化伴随肿瘤的发生与发展,使用表观遗传学方法可以有助于肿瘤的早期发现。现在肿瘤表观遗传治疗的主要研究方向包括DNA甲基转移酶和组蛋白去乙酰化酶抑制剂的研制及靶向诱导DNA甲基化等。 癌症的早期发现对癌症患者的有效治疗是非常重要的。目前对癌症的诊断主要依据临床症状、图像信号检测和组织 ...
细胞凋亡信号途径 细胞凋亡本质上是一种程序性细胞死亡,是机体在生理或病理条件下,启动自身内部机制,经过多途径的信号传递,结束其自身生命的过程。细胞凋亡具有特征性的形态学及生物化学改变。凋亡早期主要表现为胞质空泡,染色质浓缩并沿核膜排列;凋亡细胞与细胞外基质或周围细胞分离。随着凋亡过程的进展,胞质空泡与胞膜融合,导致膜发泡,随后空泡与细胞分离,引起水分丢失,细胞皱缩,同时染色质进行性固缩,并 ...
Ras信号通路 很多生长因子如EGF、PDGF、FGF等激活受体酪氨酸激酶后,通过中介分子可活化由原癌基因FaS编码的Ras蛋白,后者能进一步催化其底物蛋白的酪氨酸磷酸化反应,并引发蛋白磷酸化的级联反应,最终导致细胞的增殖效应。由于Ras蛋白为多种生长因子信号转导过程所共有,故把此信号转导途径称为Ras通路。 Ras蛋白是癌基因las的编码产物,人类有3种ras基因,即H―FaS、K ...
P38MAPK信号转导通路 分裂原激活的蛋白激酶(mitogen activated protein kinases,MAPK)家族是非常保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,是信号转导过程中一组主要的信号分子,在发育和疾病发生过程中起重要作用。该家族有4个成员,即细胞外信号调节激酶(extracellular regulated proteinhnase l/2,ERK 1/2),c―jun N ...
激光共聚焦法检测外源性TFPI-1与大鼠MsC膜上TF的结合情况外源性加入组织因子途径抑制物-1(tissue factor pathway inhibitor-1,TFPI-1)能够诱导大鼠肾小球系膜细胞发生凋亡。TFPI-1是组织因子(tissue factor,TF)的天然抑制物,TFPI-1的Kunitzl结构域能与TF-Ⅶa复合物结合。通过免疫荧光检测发现大鼠肾小球系膜细胞膜上有TF的 ...
免疫组织化学-体内原位检测信号分子表达变化 免疫组织化学染色是引入附有标记物的外源性抗体(或抗原),使之锚定于组织或细胞标本中相应的抗原(或抗体)部位,标记物经呈色反应而显示代检抗原(或抗体),因此,免疫组织化学可按标记物的种类以及定位方法分类。按标记物分为免疫荧光法、免疫酶法、免疫金银法、放射免疫自显影法等;按定位方法则分为一步法(又称直接法)、二步法(包括间接法、夹心法、补体法)和多步 ...
免疫印迹法检测MAPK信号通路表达改变 肾小球硬化的主要发病机制之一是细胞外基质(ECM)的异常沉积。转化生长因子p1(TGF-B1)在ECM沉积中起作用,并与MAPK信号通路有密切关系。醛糖还原酶(AR)是多元醇代谢通路中的限速酶,研究证实AR基因为大鼠肾小球肾炎及肾脏硬化过程中系膜细胞(MsC)的TGF-6l反应性基因之一。以蛋白质印迹检测正常MsC、AR转基因MsC、应用醛糖还原酶抑 ...
亲和免疫组织化学ABC法检测Thy-1肾炎过程中肾小球内TFPI-1的表达TFPI-1是体内主要的生理性抗凝物质,除具有抗凝作用外,还有抗炎、抗血管生成、 抗增殖及诱导细胞凋亡等多种功能。研究证明,系膜细胞能分泌TFPI-1。为研究TFPI- 1是否对肾小球肾炎具有一定的疗效,首先应用亲和免疫组织化学ABC法观察了在大鼠Thy-1肾炎过程中TFPI-1的表达情况。 1.方法 (1 ...