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经典遗传学实验

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传统 ES 打靶 VS TurboKnockout® 基因敲除

上个世纪 80 年代,随着基因重组技术的不断完善和小鼠胚胎干细胞(ES)体外培养技术的成熟,基于同源重组的 ES 打靶得以建立。ES 打靶基因敲除技术修饰准确、效果稳定、成功率极高,一直被认为是对模式动物进行特定基因修饰的金标准。但由于嵌合体阳性率低,且必须与工具鼠交配才能获得删除 Neo 的杂合子,使得构建周期长达 12-16 个月。20 世纪初,核酸酶基因编辑技术(TALEN、CRISPR/Cas9)出现,其周期短(6~8 个月)、无物种限制等优势迅速受到广 ...

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广州赛诚哺乳动物转录调控位点预测:Database介绍

相关专题 广州赛诚生物哺乳动物转录调控研究技术专题 主要是ENCODE这个数据库DNA元件百科全书(英语:Encyclopedia of DNA Elements,简称为ENCODE计划)是一个由美国国家人类基因组研究所在2003年9月发起的一项公共联合研究项目,旨在找出人类基因组中所有功能组件。这是既完成人类基因组计划后国家人类基因组研究所开始的最重要的项目之一。所有在该项目中产生的数据都会被迅速的在公共数据库中公开。 201 ...

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广州赛诚哺乳动物转录调控位点预测:数学方法介绍

相关专题 广州赛诚生物哺乳动物转录调控研究技术专题 HMM隐马科夫链的方法 1. 评估问题 给定观测序列 O=O1O2O3…Ot和模型参数λ=(A,B,π),怎样有效计算某一观测序列的概率,进而可对该HMM做出相关评估。例如,已有一些模型参数各异的HMM,给定观测序列O=O1O2O3…Ot,我们想知道哪个HMM模型最可能生成该观测序列。通常我们利用forward算法分别计算每个HMM产生给定观测序列O的概率,然后从中选出最优的HMM模型。 这 ...

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广州赛诚哺乳动物转录调控位点预测平台:Database介绍

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生物信息学预测哺乳动物转录调控作用位点

相关专题 转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA片断,长度通常在5~20 bp范围内,一个转录因子往往同时调控若干个基因,而它在不同基因上的结合位点具有一定的保守性,又不完全相同。 在UCSC genEnome Browser 数据库里面Regulation调控卡ENCODE TBBS 里面有1000多套转录因子的数据。基本可以满足医学科研的需求。 标签: 广州赛诚生物 哺乳动物转录 ...

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广州赛诚哺乳动物转录调控位点预测平台:数学方法介绍

相关专题 HMM隐马科夫链的方法 1. 评估问题 给定观测序列 O=O1O2O3…Ot和模型参数λ=(A,B,π),怎样有效计算某一观测序列的概率,进而可对该HMM做出相关评估。例如,已有一些模型参数各异的HMM,给定观测序列O=O1O2O3…Ot,我们想知道哪个HMM模型最可能生成该观测序列。通常我们利用forward算法分别计算每个HMM产生给定观测序列O的概率,然后从中选出最优的HMM模型。 这类评估的问题的一个经典例子是语音识别。在 ...

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广州赛诚生物推荐哺乳动物转录调控相关实验试剂

相关专题 哺乳动物转录调控的试剂种类繁多,广州赛诚生物科技有限公司经多年科研经验积累,在阅读大量高分文献的基础上,从试剂质量、效果、价格等方面考虑,向您推荐以下试剂:

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生物信息学的研究方向

相关专题 DNA和蛋白序列序列比对 基因的识别和鉴定 基因识别的基本问题是给定基因组序列后,正确识别基因的范围和在基因组序列中的精确位置。非编码区由内含子组成(introns),一般在形成蛋白质后被丢弃,但从实验中,如果去除非编码区,又不能完成基因的复制。显然,DNA序列作为一种遗传语言,既包含在编码区,又隐含在非编码序列中。分析非编码区 DNA序列没有一般性的指导方法。在人类基因组中,并非所有的序列均被编码,即是某种蛋白质的模 ...

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广州赛诚生物Luciferase核心实验技术:实验流程

相关专题 在调控位点分析中,Luciferase主要采用的方法为:片段缺失、定点突变,流程如下所示。 图1 片段缺失分析位点流程图 图2 定点突变分析位点流程图 荧光素酶报告基因检测法是转录调控研究中十分重要的实验手段。但其结果往往存在一定的误差。未解决这一问题,现普遍采用双荧光素酶报告基因检测法。在双荧光素酶报告基因测试中,将萤火虫荧光素酶作为实验报告基因,海肾荧光素酶作为对照报告基因。实验报告基因用于测试实验条件下基因的表达,而 ...

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广州赛诚生物Luciferase核心实验技术:实验原理

相关专题 荧光素酶(Luciferase)是自然界中能够产生生物发光的酶的统称,不同的能够控制发光的生物体用不同的荧光素酶来催化不同的发光反应。 萤光生成反应通常分为以下两步: 萤光素+ atp→萤光素化腺苷酸(luciferyladenylate)+ PPi 萤光素化腺苷酸+ O2→氧萤光素+ AMP +光 荧光素酶的基因可以被合成并插入到生物体中或转染到细胞中,将不同类型的细胞(骨髓干细胞、T细胞等)标记上(即表达)荧光素酶,就可以用高敏感度的CCD相 ...

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Luciferase实验注意事项及常见问题分析

相关专题 为取得最佳测定效果,在用单管的荧光测定仪测定时,样品和测定试剂混合后到测定前的时间应尽量控制在相同时间内,例如30秒内。 由于温度对酶反应有影响,所以测定时样品和试剂均需达到室温后再进行测定。 为保证荧光素酶检测试剂的稳定性,可以采取适当分装后避光保存的方法,以避免反复冻融和长时间暴露于室温。一般来说,如果不分装使用三次(期间冻融三次),对测定结果无明显影响。 样品和测定试剂混合后,必须等待1-2秒,再进行测定。测定时间 ...

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广州赛诚生物转录调控Luciferase标准结果与结论

相关专题 Luciferase片段缺失实验 经检测发现多次裁切对荧光素酶表达量产生的影响相同(即检测组与空白组有明显差异,但各裁切的检测组间没有明显差异),故可推断转录调控位点应位于-282~近启动子端区域。 Luciferase定点突变实验 对不同位点(生物信息学预测)分别进行点突变,LXRE2位点突变后的检测组与野生型的检测组间存在明显差异,而LXRE1位点突变后的检测组与野生型的检测组间没有明显差异,故可推断转录调控位 ...

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广州赛诚生物转录调控位点预测标准结果与结论

相关专题 经生物信息学方法预测可能调控位点为LXRE1、LEXR2。 标签: 广州赛诚生物 转录调控 位点预测 作者:广州赛诚生物 点击:次

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哺乳动物转录调控研究现状与展望

相关专题 不同细胞具有不同的表型,这是由于在这些细胞中基因的差异表达所导致的。因此,一定存在一些转录调控机制,去控制管理不同细胞各自所必需的转录方式。基因调控这一领域的研究正是迅速地揭示转录的机制。不过,我们也必须要同事意识到转录调控的无限的复杂性。 正常的细胞进行正常的转录。但由于转录是基因表达最基础的一级,所以当该转录调控出现异常时则很可能会出现不同的疾病。也正因如此,哺乳动物转录调控研究应用广泛于多种与人相关的 ...

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哺乳动物转录调控研究内容与方法

相关专题 转录调控研究包括启动子、增强子的研究,具体内容如下。 1 启动子——基因序列中决定转录起始的部位 1)转录起始位点(TSS)的确定 a)生物信息学预测TSS ①预测转录起始位点和启动子区域 ②预测CpG岛 b)5’-RAce初步确定TSS的大概位置 5'RLM-RACE c)引物延伸、核酸酶保护或S1作图精确定位TSS 引物延伸及s1核酸酶保护 2)启动子区域(顺式作用元件)的确定 a)生物信息学预测启动子区域 b)克隆5’-flanking sequence,并连接到 ...

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哺乳动物转录调控机制与原理

相关专题 目前,哺乳动物转录调控的机制主要有以下五种: 1 特异性因子:改变rna聚合酶对于特定启动子或一套启动子识别的特异性,使得RNA聚合酶更多或更少地结合到这些启动子上(如原核转录中用到的σ因子)。 2 阻遏因子:结合到DNA链上的靠近或覆盖启动子区域的那些非编码序列上,阻碍RNA聚合酶顺利进入此链,故阻碍了基因的表达。 3 通用转录因子:这些转录因子将RNA聚合酶安放至编码蛋白序列的起始位置,继而释放聚合酶以转录mRNA。 4 激活因子: ...

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哺乳动物转录调控激活方式

相关专题 在这里,我们对哺乳动物转录调控的激活方式进行讨论。以下为示意图 哺乳动物转录调控激活方式 • A factor is tissue-specific because it is synthesized only in a particular type of Cell. This is typical of factors that regulate development, such as homeodomain proteins. • The activity of a factor may be directly controlled by modif ...

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哺乳动物转录调控相关概念

相关专题 现代生物学研究表明,一个生物系统所有类型细胞具有相同的基因组。细胞分化主要是通过基因表达水平的变化,而不是基因序列改变而实现。我们可以看到,不同类型的细胞拥有相同的核心蛋白,比如染色体结构蛋白、RNA 聚合酶、DNA 修复酶、核糖体蛋白,一些参与重要代谢途径的酶等,这些不同类型的细胞也同时拥有各自特异性的蛋白,比如血红蛋白只在血红细胞中表达。 基因表达调控网络的机制很复杂。原核生物基因表达的调控主要发生在转录水平上。 ...

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气相色谱仪常规检修方法

相关专题 气相色谱仪由于结构复杂、条件设置多、恢复准备时间长等原因,在使用过程中经常会出现各种异常情况。如果不针对病因进行维护,会导致严重的后果。下面就简单介绍一下气相色谱仪在应用中易发生的异常情况及其检修办法。 一、气相色谱仪进样后不出色谱峰的故障: 气相色谱仪在进样后检测信号没有变化,也不出峰,输出仍为直线。遇到这种情况时,应从样品进样针、进样口。检测器至信号输出的顺序逐一检查。 1、首先检查注射器是否堵塞,如果没有问题, 2、再检 ...

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生物分子的有机溶剂沉淀分离法优缺点

相关专题 一、生物分子有机溶剂沉淀分离的原理: 有机溶剂对许多溶于水的生物小分子以及核酸、多糖、蛋白质等生物大分子都能发生沉淀作用。有机溶剂主要是降低溶液的介电常数,从而增强分子之间的相互作用使其溶解度降低而析出。对具有表面水层的生物大分子,有机溶剂可破坏溶质分子表面的水膜,使这些大分子脱水而相互聚集析出。不同溶质要求不同浓度的有机溶剂,可用有机溶剂进行分步沉淀。最后经离心机分离后获得沉淀物和上清液。 二、生物分子有机溶剂 ...

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