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PCR常见问题总

PCR产物的电泳检测时间  一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消 化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失 ...

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PCR常见问题总

克隆PCR产物1)克隆PCR产物的最优条件是什么?最佳插入片段:载体比需实验确定。1:1(插入片段:载体)常为最佳比,摩尔数比1:8或8:1也行。应测定比值范围。连接用5ul 2X连接液 50ng质粒DNA1Weiss单位的T4连接酶,插入片段共10ul。室温保温1小时,或4℃过夜。在这2种温度下,缺T-凸出端的载体会自连,产生蓝斑。室温保温1小时能满足大多数克隆要求,为提高连接效率,需4℃过夜。 ...

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PCR常见问题总

PCR反应体系与反应条件标准的PCR反应体系:       10×扩增缓冲液   10ul       4种dNTP混合物   各200umol/L       引物        各10~100pmol        模板DNA      0.1~2ug        Taq DNA聚合酶   2.5u        Mg2+       1.5mmol/L       加双或三蒸水至  100 ...

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PCR常见问题总

PCR反应体系与反应条件标准的PCR反应体系:       10×扩增缓冲液   10ul       4种dNTP混合物   各200umol/L       引物        各10~100pmol        模板DNA      0.1~2ug        Taq DNA聚合酶   2.5u        Mg2+       1.5mmol/L       加双或三蒸水至  100 ...

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3’RACE 实验心得

引子:从06年12月份开始,断断续续做了一个多月的3’RACE,有了一些心得和体会。期间看了很多前辈们分享的经验,受益匪浅。在这里,我就自己的经历略作总结,希望能给像我一样的新人们有点启示,少走些弯路,不当之处欢迎指正。一、试剂盒的选择:3’RACE从原理上就能明白,它比5’RACE 要容易得多,所以并不一定需要用进口试剂盒。原来准备用Takara 3’RACE的试剂盒,可是看了一下它的原理和内容 ...

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SMARTTM 5-RACE PCR的原理

SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMAR ...

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RACE PCR简介

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends RACE)是一种基于PCR从低丰度的转录本中快速扩增cDNA的5'和3’末端的有效方法, ...

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mRNA差别显示技术

mRNA差别显示技术也称为差示反转录PCR(Differential Display of reverse Transcriptional PCR)简称为ddRT-PCR。它是将mRNA反转录技术与PCR技术二者相互结合发展起来的一种RNA指纹图谱技术。目前已广泛应用于分离鉴定组织特异性表达的基因。差别基因表达(differential gene express)是细胞分化的基础。mRNA差别显示 ...

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mRNA差别显示技术

mRNA差别显示技术也称为差示反转录PCR(Differential Display of reverse Transcriptional PCR)简称为ddRT-PCR。它是将mRNA反转录技术与PCR技术二者相互结合发展起来的一种RNA指纹图谱技术。目前已广泛应用于分离鉴定组织特异性表达的基因。差别基因表达(differential gene express)是细胞分化的基础。mRNA差别显示 ...

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聚合酶链式反应(PCR)扩增和扩增产物克隆

概 述   PCR(Polymerase Chain Reaction聚合酶链反应)是一种选择性体外扩增DNA或RNA的方法.它包括三个基本步骤: (1) 变性(Denature):目的双链DNA片段在94℃下解链; (2) 退火(Anneal):两种寡核苷酸引物在适当温度(50℃左右)下与模板上的目的序列通过氢键配对;(3) 延伸(Extension):在Taq DNA聚合酶合成DNA的最适温度 ...

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Rt-PCR经验总结

Rt-PCR实验步骤一、实验器具与材料:1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸头:1ml、200μl、20μl3、匀浆管:5ml4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,带盖)1个125ml的白色试剂瓶(放无水乙醇)7、量筒:50ml、250ml、500ml8、容量瓶: ...

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RAPD技术应用中的一些问题及对策

焦锋,楼程富(浙江大学蚕学系,杭州 310029)摘要:综述了RAPD技术的一些理论性问题,包括RAPD与其它分子标记技术相比的优点,影响结果重复性的因素,显性标记产生的原因,条带取舍的标准等。提出在实验中解决这些问题的一些方法:严格控制反应条件,采用单倍体和单剂量标记,系统学研究中要结合其它方法进行分析,定位基因时要选用合适的群体等。 1 RAPD技术原理及特点   1.1原理RAPD(Rand ...

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RAPD技术应用中的一些问题及对策

焦锋,楼程富(浙江大学蚕学系,杭州 310029)摘要:综述了RAPD技术的一些理论性问题,包括RAPD与其它分子标记技术相比的优点,影响结果重复性的因素,显性标记产生的原因,条带取舍的标准等。提出在实验中解决这些问题的一些方法:严格控制反应条件,采用单倍体和单剂量标记,系统学研究中要结合其它方法进行分析,定位基因时要选用合适的群体等。 1 RAPD技术原理及特点   1.1原理RAPD(Rand ...

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Primer Premier 引物设计

Primer Premier4.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计,评估的软件,和Plasmid Premier2.02一起是该公司推出的最新的软件产品。其主要界面同样也是分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和纹基分析窗口(Motif)。这里我们主要介绍其引 ...

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直接从PCR产物回收纯化DNA (Promega 公司试剂盒)

1)直接加90-100μl纯化缓冲液于1.5ml离心管,再加入30~300μl PCR反应物,Vortex混合;2)加入1ml树脂轻轻Vortex 3次,每次间隔1分钟;3)将取出拉杆的注射器筒(3ml)装在纯化柱上,加入上述DNA与树脂混合液,然后装上拉杆,慢慢将混合液推进纯化柱内;4)卸下注射器筒,拔出拉杆,再将注射器筒装上纯化柱,加2ml 80%的Isopropanol(异丙醇) 然后装上拉 ...

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直接从PCR产物回收纯化DNA (Promega 公司试剂盒)

1)直接加90-100μl纯化缓冲液于1.5ml离心管,再加入30~300μl PCR反应物,Vortex混合;2)加入1ml树脂轻轻Vortex 3次,每次间隔1分钟;3)将取出拉杆的注射器筒(3ml)装在纯化柱上,加入上述DNA与树脂混合液,然后装上拉杆,慢慢将混合液推进纯化柱内;4)卸下注射器筒,拔出拉杆,再将注射器筒装上纯化柱,加2ml 80%的Isopropanol(异丙醇) 然后装上拉 ...

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RT-PCR一些心得

从RNA到电泳鉴定一、RT-PCR原理:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA 作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA 为模板,用VI 型胶原蛋白的α1 链的编码序列的特异性引物进行PCR 扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR 使RNA 检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA 样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转 ...

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引物合成介绍

1.引物是如何合成的?目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法。DNA合成仪有很多种 主要都是由ABI/PE 公司生产,无论采用什么机器合成,合成的原理都相同,主要差别在于合成产率的高低,试剂消耗量的不同和单个循环用时的多少。申能博彩公司采用的合成仪主要机型为ABI3900高通量合成仪,合成长链主要采用Beckman 1000M和PE8909 DNA合成仪,引物修饰和高OD数合成采用ABI394等。 ...

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引物合成介绍

5.需要什么级别的引物?答:引物常用的纯化方式C18脱盐,OPC纯化,PAGE纯化,HPLC纯化。根据实验需要,确定订购引物的纯度级别。应用 引物长度要求 纯度级别要求一般PCR扩增 OPC 45 base PAGE诊断PCR扩增 OPC PAGEDNA测序 20base左右 OPC亚克隆,点突变等 根据实验要求定 ...

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引物合成介绍

11.引物(含修饰)的分子量是如何确定的?答:非修饰的引物的Molecular Weight在随引物提供的报告单上都有明确的标示。如果需要估计一个引物的分子量按每个碱基的平均分子量为324.5,引物的分子量=碱基数 x 碱基的平均分子量。或按下列公式计算MW= (NA * WA) + (NC * WC) + (NG * WG) + (NT * WT) +(Nmod * Wmod) +(Nx * W ...

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