RNA实验技术

以下是常用的microRNA靶标数据库和软件资源列表，希望对microRNA的研究者有所帮助。（1） miRbase：众所周知的microRNA基因注释数据库。目前miRBase只提供了microRNA的靶标的预测软件的链接（如：PicTar）。 网址：http://mirbase.org/index.shtml（2） starBase：一个高通量实验数据CLIP-Seq（或称为HITS-CLIP）和mRNA降解组测序数据支持的mi ...

第一作者之一的宋尔卫(Erwei Song)是我们熟知的，他是中山大学附二院的医生，现在哈佛大学医学院血液研究中心Judy Lieberman教授组进行博士后研究。他曾发表用尾静脉快速大剂量法向小鼠体内输注siRNA成功实现耐受抗Fas单抗诱导的暴发性肝坏死。http://www.nature.com/nbt/journal/v23/n6/abs/nbt1101.html;jsessionid=EFF86FD58B3B573 ...

下载方法：登陆 www.56.com注册邮箱后登陆在【共享资源beta】里输入 gtett123 即可Table of Contents1. Ribozyme- and siRNA-Mediated mRNA Degradaion: A General Introduction2. Combination of Chemical and Enzymatic RNA Synthesis3. Determination of Kinetic Parameters for Hammerhead and Hairpin Ribo ...

大量实验表明，针对同一靶基因的不同siRNA序列具有不同的沉默效率，为了能够运用RNAi技术更有效地沉默靶基因，需要在RNAi的第一步，也是其成功与否的关键环节―siRNA序列的设计方面进行更多的改进。本文将在以下几个方面探讨siRNA序列设计方面的最新研究进展，作为应用RNAi技术时的参考。RNAi最终要通过siRNA片段与靶基因结合并使之降解，因此，确保高度同源于靶基因而绝无与其他基因同源的siRNA序 ...

RNAi GlossaryDicer - Dicer is a member of the RNase III family of nucleases that specifically cleave double-stranded RNAs. Dicer processes long dsRNA into siRNA of 21-23 nt.Interferon - A small and highly potent molecule that functions in an autocrine and paracrine manner, and that induces cel ...

siRNA Design1. Select siRNA 19-mersFirst, look around in the literature if any siRNA for your gene has been already made or have a look at siRNA Database (small though)There is a growing numbers of tools for selection of siRNA 19-mers based on a provided cDNA sequence. We use siRNA Selection Program devo ...

microRNA作用机制上海百传生物科技有限公司（Shanghai Bio-Tran Bio-Technology Ltd）是一家集研发，生产、销售和服务为一体的生物高科技企业，专业研发生产具有自主知识产权的分子生物学实验研究用产品，包括干扰核酸（siRNA）、微核酸（microRNA）、反义核酸（antisense RNA等）动物体内转染试剂盒、体外细胞株转染试剂盒、原代细胞转染试剂盒、DNA转染试剂盒、细胞凋亡检测试剂盒（TUN ...

复旦大学生化与分子生物学实验室黄伟达所率研究小组在Biochemical Journal的九月刊上报道了如题论文。哪位大侠能下载到全文，请在DXY里共享一下，以便大家交流学习。文摘如下：http://www.biochemj.org/bj/390/bj3900675.htmBiochem. J. (2005) 390 (675–679) (Printed in Great Britain)High doses of siRNAs induce eri-1 and adar-1 gene e ...

Ambion and Applied Biosystems have joined forces to provide a complete convenient, solution for performing gene silencing experiments and validating the results by real-time RT-PCR. Ambion's Silencer™ Validated and Silencer Pre-designed siRNAs eliminate the guesswork--and t ...

siRNA的设计要点一、体外合成siRNA的设计:如何设计有效的siRNA一直是当前RNAi研究的热点话题.基因抑制的有效性很大程度取决于目的基因序列的选择。目的序列可以随机选择也可以通过在目的基因的不同区域上测试不同的序列以决定何种序列是最有效的。以下所述几条对于siRNA设计的成功极为重要。1. 从转录本（mRNA）的AUG起始密码开始，寻找“AA”二连序列，并记下其3''端的19个碱基序列，作为潜在的siRNA ...

Nature Biotechnology 5年关于RNAi专题 :http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=3130708&sty=1&tpg=1&age=01 Synthetic shRNAs as potent RNAi triggers2 Synthetic dsRNA Dicer substrates enhance RNAi potency and efficacy.◎3 Knockdown by RNAi-proceed with caution4 Rati ...

RNAi，RNA interference，RNA干扰，是被认为最有前途的一种实验方法。下面是简介，然后是资源汇集。1995年，康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫（C. elegans）中的par-1基因时，发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达，而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA（sense RNA）以期观察到基因表达的增强。但得到的结果是二者都同样地切断了par-1 ...

全球各实验室如何进行RNAi实验？（3）病毒入侵者（Viral Invaders）使用者：南阿拉巴马州立大学微生物学和免疫学教授Sailen Barik项目：敲除编码呼吸融合病毒 (Respiratory Syncytial Virus，RSV) 功能亚基的基因，抑制病毒在小鼠体内繁殖问题：在确保草案全面试实施的同时，用化学修饰法和27mer链拧动以油脂为基础的传递方法：鼻内递送绑定阳离子脂质转染试剂递的siRNAs。Barik说：“对 ...

这个是应用feeding的方法在线虫中应用RNAi，据研究称这是应用于线虫高通量RNAi最佳的方法。不过这个library的价格不知道怎样，不知道国内有没有买到这个library的实验室，如果有不知道分享价格如何？我拟使用该方法进行线虫基因组范围内的RNAi，哪位有这方面的经验能否赐教一二 谢谢。http://www.hgmp.mrc.ac.uk/geneservice/reagents/products/descri ...

1 RNAi实验原理、方法和应用http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=1365323&sty=1&tpg=1&age=02 RNAi示意图http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=38&id=1181258&sty=3&keywords=RNAi3 挺不错的RNAi的作用机制 ( FLASH )http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=527666&s ...

组织和细胞RNA的制备一、 组织和细胞总RNA提取：异硫氰酸胍法（一）试剂准备1．CSB缓冲液：42mM柠檬酸钠；0.83% N-lauryl sarcosine(十二烷基，N甲基甘氨酸钠)；0.2 mM β-巯基乙醇。2．变性液：异硫氰酸胍（终浓度 4 M）25g、CSB缓冲液 33ml，混合直至完全溶解，可在65℃助溶。4℃保存备用。3．2 M乙酸钠：pH 4.0。4．异丙醇5．无水乙醇、70%乙醇6．酚：氯仿：异戊醇（25：24：1）7．DEPC H2O：100ml ddH2O中，加 ...

Cloningof miRNAs was performed as described (Elbashir et al., 2001; Llaveet al., 2002a). In brief, ;600 mg of RNA was resolved through two laneson a denaturing 15% polyacrylamide gel. Labeled DNA oligonucleotideswere used as size standards. A gel fragment spanning the size rangeof 15 to 26 nucleo ...

摘要：生物通 www.ebiotrade.com　　对于富含miRNA的样品，如大部分组织样品，TaqMan和miRCURY平台都很有可能产生好的结果。然而，在对低丰度miRNA样品（如血浆样品）进行图谱分析时，miRCURY平台的高灵敏度和线性似乎更胜一筹。生物通报道 为准确评估血浆中的miRNA水平，来自丹麦的研究人员对市场上常用的三个miRNA表达谱平台进行了比较。该研究成果发表在近期的《BMC Genomics》上。近几年 ...

生物通报道 为准确评估血浆中的miRNA水平，来自丹麦的研究人员对市场上常用的三个miRNA表达谱平台进行了比较。该研究成果发表在近期的《BMC Genomics》上。近几年来，microRNA（miRNA）的研究持续升温。在临床上，miRNA有潜力成为癌症的生物标志物。尽管miRNA在组织中很丰富，但它们在血浆中还是很稀少的。据报道，血浆中的总RNA水平大约在6-300 ng/ml，而miRNA只占了极小的一部分。因此，对于 ...

lncRNA专题讨论帖开始了！大家一起来交流与沟通吧！导语lncRNA在抗病毒天然免疫反应中具有重要调控功能。这一发现有助于深入了解病毒与宿主的相互作用，为新型抗病毒药物的研制提供新思路和重要的理论依据。该项研究成果于11月12日在国际学术期刊《细胞》子刊《细胞—宿主与微生物》（Cell Host &Microbe）上发表。流感病毒感染宿主后，病毒RNA被宿主的病原识别受体所识别，激活抗病毒天然免疫应答。一系列天然免疫相 ...