RNA实验技术

longytu NCBI上面查到了BAX的mRNA的几种序列，有αβγ三种类型。。。。为什么BAX基因序列相同，且都是人源的，mRNA为什么序列不同呢？？zjubell 大多数真核基因转录产生的mRNA前体是按一种方式剪接产生出一种mRNA，因而只产生一种蛋白质。但有些基因产生的mRNA前体可按不同的方式剪接，产生出两种或更多种mRNA，即可变剪接（alternative splicing）。人们发现，越是高等的动物，涉及mR ...

lily1218 请问哪位做过关于MTDH的干涉,求助能发挥干涉作用的siRNA序列,十分感谢!freecell 自己在文献里面找，或者dharmacon或者ambion的库里面找。majian0064 5
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可以交流一下你的实验吗？我的邮箱majian10@mails.jlu.edu.cn本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙 ...

lbqlxy 我的目的基因是 人 rab23 约2000bp请公司设计了3个siRundefined*段 位置分别在200 600 800处 本打算用来筛选出一个干涉效果好的片段在复习文献中发现 单个片段可能因为脱靶效应 影响实验准确性现在的问题是 能否用我现有的3个片段 组合成pool（三者各取三分之一的量组成一份）转染细胞？？ 有无组合的原则？？lmnsmu 一般不这样做。单个片段可能因为脱靶效应而无干扰作用，所以才设计数个片段，通过预实验检测它们哪一个干涉效果好，再用于 ...

霍一刀hxs 各位高手：对于某一特定的RNA，通过何种方法判断其所在细胞内的位置？多谢。zoeru2007 原位杂交吧。。。sbch1532 霍一刀hxs wrote:各位高手：对于某一特定的RNA，通过何种方法判断其所在细胞内的位置？多谢。原位杂交可以霍一刀hxs 多谢zoeru2007和sbch1532的帮助。呵呵hyjtb 免疫荧光能看出来么？霍一刀hxs hyjtb wrote:免疫荧光能看出来么？试试此方法，谢谢。bigbang_0_0 hy ...

gzlaotouzi 我想知道，经过芯片或者其它手段确认了的，与某一类肿瘤或者某一特定疾病相关的所有差异表达有意义的microRNA群，我可以借助哪些手段得知？shilei5794749 http://www.mir2disease.org/ —— “search by disease name”路得自己走 shilei5794749 wrote:http://www.mir2disease.org/ —— “search by disease name”这个不错！shen ...

Y03013 请问XDJM，如何获得未知miRNA 的表的情况呢freecell 现在比较流行的做法是进行deep sequencing。权威的miRNA公共数据库Sanger miRBase已升级至最新的13.0版，发布的microRNA序列信息已接近10000条。由于越来越多的miRNA正在被发现，miRBase数据库每隔4~5个月就会发布新的数据版本。尽管如此，我们仍然对大量的物种miRNA信息一无所知，它们的重要生物学 ...

深空明月 大侠同志们：请教一下PCR检测出mRNA的表达量是升高的，能否说明那它的蛋白质的表达量也是升高的呢？如果蛋白质量是升高的，那它的机理是什么样的？如果不一定是升高的，其缘由又是什么样的啊？还有一个问题：受体分子在细胞中是有限的，当受体处于饱和状态时，受体mRNA的表达量会是什么情况呢？关于分子机制这方面的我不是很明白，请赐教。急freecell mRNA表达量升高，不一定会说明蛋白质表达量升高。这是因为在翻译过 ...

太峰之巅 目前，对小RNA的研究进展的相当迅速，小RNA的功能蛋白如Ago，Dicer等也有相当的研究。就对小RNA新的功能作用蛋白大研究方法，高手进来畅聊。版主freecell留言:你所知道的有哪些方法？只有先提出自己的见解，才能抛砖引玉，引来更多的讨论。freecell see this post:http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=16504126&sty=1&tpg=1&age=0太峰 ...

huangaiyou 看了一篇文章，说是用锁核酸技术大大提高了northern blot检测miRNA表达水平的灵敏度。请问各位站友，这个锁核酸技术用在northern blot上，如何检测的？也是用放射性同位素吗？似乎这个锁核酸只是增加了稳定性，跟最后的检测没什么关系吧？我现在想用northern blot验证预测的miRNA，又不能用同位素标记，请问有什么可以替代的吗？我曾经看到帖子说miRNA的检测要求灵敏度高，不用放 ...

freedegree release 14和release 13整个数据全变了，同一条miRNA，基因组中的位置变了，是什么原因？是基因组数据还是miRNA数据的变了？举一个例子：ID Chromosome Start End Strand releasehsa-let-7a-1 9 95978060 95978139 + 13.0hsa-let-7a-1 9 96938239 96938318 + 14.0zhujoker 楼主真是细心，但是你关心他们的位置有什么作用？我个人认为应该是 ...

shidingwen 请问 加载控制是么，为什么要选用肌动蛋白？谢谢freecell 请给出“加载控制”的英文说法。shidingwen 英文是这样表达的β-actin mRNA was used as a loading controlfreecell 晕。这里的意思就是将β-actin mRNA作为对照（或者内参）。loading是“上样，加样”的意思。β-Actin中文名叫做β-肌动蛋白，是横纹肌肌纤维中的一种主要蛋白质成分，也是肌肉细丝及细胞骨架微丝的主要成分 ...

xiaoxiaoyu0329 查了很多资料都没有查出来，请您赐教，谢谢bigbang_0_0 帮顶：）jiajin 叫5'UTR，5'非翻译区song333 5' Un-Translated Regionpro2004 5'UTRxiaoxiaoyu0329 好的 谢谢各位的回复bigbang_0_0 不客气。zhuhoushun KAZARK吧吴佰霖 我想称为 转录非翻译区 更确切UTR的含义比较含糊，也可以指5'promoter 调控不转录的序列，也可以指转录了 但不翻译的 ...

syn2767 各位师兄，小弟做miRNA 的microdowm，但realtime检测antisence转染后，miRNA的表达并没用下调，问试剂公司的人说 antisence不能下调目的miRNA的表达，只有上调的质粒才能影响miRNA的表达，是这样吗，多谢！！slytjiaofei 我个人认为公司说的不太准确。利用反义核酸或siRNA抑制microRNA表达是一个很成熟的技术，当然效果如何取决于当初反义核酸或siRN ...

霍一刀hxs 不同的miRNAs可以靶定同一个基因，或同一位点或不同位点，那么，他们之间存在竞争性结合吗？弱弱地问一下，各位大侠。song333 possible, but the possibility is really low.each miRNA has its own target sequences, that mostly can be considered as sequence-specific targeting.maomao030119 应该会吧，个人观点本文由丁香园论坛提供， ...

cpubio 如题。当时把器官取了放在-20度，由于有别的事情，一直没有做，不知现在处理还行不行？谢谢！song333 of coursemaomao030119 应该没得问题的cpubio 谢谢楼上两位回答。我赶紧开展工作，争取俩星期内完成这个工作。maomao030119 看来你又拖了一天jerryri -20度RNA一般能稳定1个月,现在放了3个月了,降解比较严重zhcosa 够呛了吧。。。。。lim1896 RNA不好说！！！本文由丁香园论坛提 ...

zhl068 各位仁兄，小弟最近实验研究某基因在某种肿瘤中的表达情况，需要进行细胞系内RNAi，查阅文献，已经有人将该基因在别的器官的细胞系作过，那小弟在我要研究的细胞系中再做说明的问题能有意义吗，是否是重复实验，因实验数据将来要发SCI，特向各位求助，望赐教！！！先谢过了zhl068 freecell斑竹，谢谢你，但还是不太明白，能得出的结论无非也就是说这个基因在我要做的器官中是个癌基因或抑癌基因，和别人的结果一样，那 ...

andyzhoucang 本人想预测某一microRNA的靶标，通过targetscan，pictar 以及microrna这三个网站，每个网站预测出来靶标都有200多个，我想把其中共有的找出来，一定要一个一个对过去吗？有没现成的网站或软件可以把这三者的交集弄出来？吴佰霖 据我所知，是可以的。在DAINA这个网站里，楼主可以找一下onlove001 同问这个问题 请求指点。。谢谢。。。。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的 ...

leng724 如题：相应的人工合成物或mimics选择哪个作为发挥miRNA作用去转染比较好，这两个有什么区别。谢谢各位~~霍一刀hxs 现在做转染一般选择用mimics，即模拟剂。这个问题真没想过，估计人工合成物不能代表细胞中真正miRNA的表达情况吧。吴佰霖 人工合成物即文献mimics，序列应该与相应miRNA一致maomao030119 我觉的人工合成物与mimics应该都与目的基因序列一致吧dearest626 我 ...

霍一刀hxs miRNA靶基因相关预测网站中经常出现“7mer-m8”，其中“mer”表示什么意思？多谢高手指教。freecell The "-mer" suffix refers to the number of bases (monomer, 7-mer, oligomer, polymer...).霍一刀hxs 多谢版主freecell的指教，多谢。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixio ...

minicenter 已知一个microRNA，可以在ucsc上查找已知的TF结合位点，也可预测其潜在的TF结合位点。反过来，已知一个TF，如NFAT，怎样预测它可以调控哪些microRNA的表达？在此求助各位高手解答，多谢！minicenter 我不小心发了两个帖子，在生物信息学里面发的那个似乎人气稍多一点儿http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=73&id=16632525&sty=1&tpg= ...