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【讨论】有关转录问题

hongandwang 平时交流中,发现对DNA转录成RNA的片段长度问题不是很明朗。究竟起始密码子前多长的一段DNA可能被转录成RNA?而终止密码子后又是多长的一段DNA可能被转录成RNA?从现有分子生物学教材看,似乎应该是起始密码子前的DNA不被转录成RNA(注:假设离前后基因距离较远),转录仅从起始密码子开始;而终止密码子后的40-50bp左右可能被转录成RNA,直至茎环结构前停止转录。不知此理解是否正确,请 ...

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【求助】这些简写什么意思?

麻木尔杜斯戈里亚 某基因的T1065G多态性?1065T/1065T基因型频率?-48G/-48G?某基因的(ATTT)n?某基因的G-1251C?freecell This "T1065G" notation means that the presence of a Thymine DNA base (Thymine is referred to as "T") instead of a Guanine ("G") at the DNA base 1065 (this a number is reference to where on the gene this repla ...

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【求助】人类基因组计划

chenzhicheng 请问每个个体的基因都不完全一样,那人类基因组计划各国科学家测的是同一个体的基因序列吗?还是....知道的请解释,这个问题一直没明白zjubell chenzhicheng wrote:请问每个个体的基因都不完全一样,那人类基因组计划各国科学家测的是同一个体的基因序列吗?还是....知道的请解释,这个问题一直没明白每个基因,大家都是有的,只是会出现很多SNP、突变、还有些染色体异常(插入,重复,缺失等),除去 ...

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【求助】断裂基因的优点

怪盗小子 我找了很多网站,包括国外的网站都没有找到很多关于这个方面的知识。所以,就只好来求助各位大侠们了……希望能给提供一些图片或者是FLASH的说明,英文的也可以,我看得懂的。谢谢!!!在下只是个医学生,先谢过了!freecell Perhaps the major benefit of split genes is simply the opportunity they provide for making many different proteins from a single gene thr ...

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【求助】土壤微生物总DNA的提取及细菌16S rDNA的PCR扩增出问题了,寻求大家的帮助!

tyuanc 我用MO Bio的soil DNA Isolation Kit提取土壤总DNA,提取的DNA直接跑胶,看不见任何条带,采用细菌16S rDNA通用引物(27F和1492R)进行PCR扩增,也没有结果,有一次我将试剂盒提取的DNA50倍稀释后,进行细菌16S rDNA的PCR扩增,扩增出了目的条带,我所用的酶为Takara的LA Taq,用普通的Taq酶扩增不出来,但隔了一周后再去重复,什么条件都一样,却再也扩不出来了,我重新提取 ...

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【求助】基因转染是是什么意思啊?解释一下!

角色方向 我想问一下,基因转染是什么意思啊?例如Apt6i转染脊髓基质干细胞 能否详细解释一下?多谢!freecell 基因转染,通俗地说就是将核酸分子导入细胞。说得学究一点,就是将具有生物功能的核酸转移或运送到细胞内并使核酸在细胞内维持其生物功能。小舟儿 补充一点,我个人理解是:1.转染是把目的基因转入靶细胞(真核细胞)后,进而研究该基因功能的一种常见方法。2.与此过程相似的一个名词“转化”——把目的基因转入原核细胞后,进而研究该 ...

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【求助】请教关于基因启动子的查找问题

lantianshi 请教大家一下,如果我在ncbi上查找启动子时,发现基因有很多的mRNA joins和cd joins,那是不是说明该基因有很多的varient,那会有不同的启动子吗?我还是要取这个转录起始位点上游的序列来作为我的研究序列吗?初学者,敬待解答 ,说明一下我要查的这个基因没有相关文献报道过启动子的相关信息。阿呆硕士 基因的具体具有启动功能的序列并不是一定的,有启动功能的序列或许都有着启动功能,而且启动子的功能 ...

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【求助】请教这是用的什么方法进行基因分型?

zhangzhen66 在一篇文章中看到如下一段话,怎么看也没明白怎么测得基因分型,请教下Activity phenotype methodRates of POase activity and DZOase activity were measured spectrophotometrically in serum according to the method described by Richter and Furlong (24). Briefly, POase and DZOase activities we ...

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【求助】骨髓移植受体内LacZ基因的鉴定

pengchen628 各位前辈现有一个问题请教。我是将Tie2/LacZ小鼠的骨髓单个核细胞移植到FVB小鼠身上,现在骨髓移植已经成功。我想鉴定FVB小鼠身上是否有LacZ基因,应该采取什么方法?注:转基因的Tie2/lacZ小鼠可以在内皮细胞专有启动因子Tie2的转录调控下持续表达β-半乳糖苷酶,可与X-gal染色成蓝色,被广泛用于细胞谱系分析。十分感谢!wbald 你都已经说了,X-gal染色呗。pengchen6 ...

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【求助】全基因组测序的分析

海边海鸥 偶的题目大致是研究某一细菌产生ESBLs,其基因组中含有耐药基因,但是表型(药敏试验仍对该类抗生素敏感)阴性。可能存在某些机制使该耐药基因未表达。打算进行该两株的全基因组测序,想请教一下主要从哪几方面考虑未表达的可能性。谢谢大家:)海边海鸥 怎么没有建议呢?zhujoker 我来胡说2句吧,不知道细菌基因组有没有甲基化修饰,自己不做细菌,所以不能确定(但是偶刚才查一下的确好像有这个东西)。你的耐药基因存在不表达是不 ...

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【求助】做单核苷酸多态性位点分析时,要做Hardy-Weinberg平衡检验的原因是什么

euniceyeh 想请问一下各位大侠?:?)做单核苷酸多态性位点分析时,要做Hardy-Weinberg平衡检验的原因是什么?是证明这个抽样样本来自于一个符合Hardy-Weinberg平衡的群体吗?为什么做SNP分析,一定要确保人群符合Hardy-Weinberg平衡呢?另外,是不是只要对照需做Hardy-Weinberg平衡检验,病例组就不必了?hj841023 同问哦freecell 是为了说明研究所选取的样本具有群 ...

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【求助】请教如何看懂GenBank里的ATM基因DNA序列

hj841023 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/224514928?report=genbank&log$=seqview&from=11637691&to=11820525刚开始着手实验前期工作,有很多不懂的,请教论坛里各位高手,如何看懂GenBank里的ATM基因DNA序列,以上是相关链接。谢谢各位指教了。:)freecell 请参考这个帖子:http://www.dxy.cn/bbs/pos ...

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【求助】怎么做全基因组的基因knock-down

molrep 有哪位战友知道怎么做全基因组的基因knock-down,我听说有全基因组的shRNA文库,怎么用这个东西呢,谢谢bigbang_0_0 做转染,然后看你们所期待的表型有什么变化即可freecell 何不参考一下这篇文献?http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B8G3Y-4TT80P4-1&_user=10&_rdoc=1&_fmt=&_orig=sear ...

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【求助】求靶基因预测软件

山大真大 :):):)我最近在做一个ncRNA 的项目,希望大家能给我提供几款靶基因预测的软件我自己找过很多但都下不下来。。。最好能顺便提供教程zhujoker 呵呵,ncRNA可是一个大范围啊?你需要什么样的靶基因预测的软件?你做的是什么ncRNA,能否说的明确一点?山大真大 TargetScan miRanda DIANA2MicroT PicTar这之类的软件我在网上找的都不能用十分希望您能帮帮忙……zhujoker 直接在网上预测啊,好 ...

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【求助】如何有目的地突变镰刀菌等真菌内的某个基因?

gggchilly 想有目的地突变镰刀菌内的某个基因,有没有什么良策啊?包括合适的载体等等,急,不胜感激。也可以发我邮箱gggchilly @ yahoo.com.cnamberly 你要看看是什么菌种,然后在google上搜索该菌的isogenic mutation, vector,plasmid等关键词。一般地,如果该菌是可转化的话,应该是有发表的方法的。做法是把抗性基因(如Ampicillin)插入到你的目的基因内,然后转化某穿梭 ...

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【求助】如何利用文献的引物明确扩增序列的位置

Cherrybei 请问如何利用文献所提供的引物,来明确PCR扩增序列的位置,我利用Pubmed上的Blast,好像只能看到比对的结果是在哪一个染色体上,却不能知道扩增的序列是在哪一个外显子上,因此不能确定目标基因的SNP是否在扩增的序列上。期待高手们的指点,非常感谢!!!:)lmnsmu 我认为不应该与整个核酸库进行比对,你应该先找到你的目的基因序列,然后再用文献的引物去比对,确定扩增片段在那个区域。一点愚见,仅供参考。 ...

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【求助】有使细胞表达某种蛋白下降的质粒

28810789 请问有使细胞表达某种蛋白下降的质粒吗?如果有这种质粒,那么它与RNA干扰(siRNA)有什么区别?谢谢!freecell shRNA就是以质粒形式,转染细胞后使某种蛋白表达下降的。其与siRNA区别见图。vitrogene shRNA能使蛋白质下调的质粒,它主要是用来建稳转细胞株,而siRNA却不可以.版主freecell留言:请不要发布隐形广告!本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及 ...

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【讨论】外源性的癌基因DNA注入裸鼠就能生癌吗?

xiongsanxiao 比如说一个DNA片段,含癌基因,直接注射入裸鼠体内,它就会表达癌吗?要想使一个外源基因在体内顺利表达,需要哪些条件?高手赐教,洗耳恭听,谢谢。jiachengyou2007 路过 随便谈谈,希望拍砖一般来讲,要想看某癌基因的致癌性,需要把这段基因转到一个载体里,然后转染或感染到细胞里。经过筛选(稳定转染或用流式)后注射到动物体内,观察其是否有致癌性。如果直接把DNA片段注射入裸鼠体内,裸鼠虽无免疫系统, ...

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【求助】关于正义寡核苷酸、错义寡核苷酸(无意义寡核苷酸)

bahai 大家好,最近看文献,发现了 反义寡核苷酸、义寡核苷酸、错义寡核苷酸(无意义寡核苷酸),我知道反义寡核苷酸技术,但是什么叫义寡核苷酸、错义寡核苷酸(无意义寡核苷酸),查了一下没有搞清楚,请各位老师帮忙解释一下啊,非常感谢!freecell 还是举个例子说明吧。Stat3正义寡核苷酸序列:5’ AGAAACAGGATGGCCCAATGG 3’,即与原始DNA序列的正链;Stat3反义寡核苷酸序列:5’ CCATTGGGCCATCCTG ...

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【求助】请教各位老师,如何检测一个细菌中的已知序列后的一个功能基因

clarck7 请教各位老师,如果检测一个细菌中的已知序列后的一个功能基因说具体点,我用PCR扩得了一个IS的启动子,但想知道这个启动子的下游接的什么基因,请问如何实现?谢谢了!gingivalis 菌落杂交1 作 DNA cosmid 文库。2 PCR 扩增 IS 启动子,放射性同位素或者非放射性(地高新)标记做探针。3 plate hybridization. 找出阳性克隆,然后粘粒测序。或者1 PCR 扩增 IS 启动子,放射性同位素或者非放射性(地高新)标记做探针用。2 酶切细 ...

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