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其实我原来就想搜个文献，只是换了个搜文献的方法……嗯，这次用类似GO分析的本体论结构，来进行文献的搜索，用的就是这个：实际上，这是个RGD研发的文本挖掘搜索工具，平时大家也都是随便搜搜关键词，这次可以按照MeSH词并且通过MeSH词的本体论分类来筛选出更多的关键词：比如搜索基因，就搜一个P53看看：会显示出所有有P53字段的基因，直接搜索。搜索获得的文献，会按照不同的分类，来进行文章文本的MeSH词分类，并且在旁边 ...

7 月 15 日新疆开始发现最新确诊病例，这也是该地区数月来的首次确诊病例。一名 24 岁女性在出现症状后于 7 月 16 日经测试确诊，后来 3 名亲密接触者测试为阳性。新疆连续 3 日出现本土感染病例，疫情反弹引起社会各界关注。7 月 17 日上午，自治区新冠肺炎疫情防控工作指挥部召开视频会议，会议指出按 「应检尽检、愿检尽检」 原则，突出重点，分级实施，乌鲁木齐全市范围分批开展免费核酸检测。为提高乌鲁木齐市的核酸检测能力，国家卫健委组织 10 省市 10 支核酸检测医疗队 200 余人，赴乌市帮助开展 ...

在皮肤伤口愈合时感到瘙痒可能是大家都有过的体验，要命的是由于是伤口，感到痒还不能随便用手去抓。对于大多数伤口来说，痒是在愈合过程的后期出现的一种不愉快的症状。临床上，伤口越广（如烧伤），瘙痒就越严重和持续。那么这种瘙痒究竟是什么机制产生的呢？ 图片来源：网络2020 年 7 月 15 日，美国国家卫生研究院 NIH 的陈万军团队在 Immunity 上在线发表了题为 The Cytokine TGF-β Induces Interleukin-31 Expression from ...

Assay of Transposase Accessible Chromatin sequencing（ATAC-seq）即利用转座酶研究染色质可接近性。ATAC-seq 自 2013 年开发以来广泛应用于研究有关染色质的生物学问题。根据 PubMed 上发表 ATAC-seq 有关文章可以看到，文章数量逐年上升，其中 2019 年发表文章数量最多，为 635 篇（图 1）。 图 1 识别和表征开放染色质区域有助于确定基因组调控元件的位置和深入了解转录调控。ATAC-seq 就是 用转座酶 Tn5 获取 ...

又是一个愉快的周末即将结束，小编特地为大家推荐分享多篇顶级期刊研究，持续关注我们的「三句话」栏目，开阔视野，文章赶超「小学生」不是梦！ 1，冷冻生发 —— 让人产生「鸡皮疙瘩」的细胞类型竟然还能调控毛囊干细胞「鸡皮疙瘩」真名立毛反应（piloerection），主要由毛囊、竖毛肌（APM）、交感神经的协调反应产生，涉及了上皮细胞、间充质细胞和神经细胞的交互作用。7 月 16 日发表在 Cell 的文章发现，毛囊通过毛囊干细胞（HFSC）分泌音猬因子（Son ...

过去的十年见证了DNA测序技术的惊人发展。从这些进步中受益匪浅的一个领域是微生物学领域，因为现在有可能以以前难以想象的深度来描述微生物群落(“微生物群”)。因此，微生物群的研究目前正在蓬勃发展，由许多最近大规模的、全球性的项目领导，如人类微生物群项目、MetaHIT和地球微生物群项目，这些项目利用测序的力量试图了解微生物群落是如何影响它们周围的环境的。与人类有关的微生物群落，例如存在于肠道、口腔和阴道中的微生物群 ...

孤儿药，即治疗罕见疾病的药物的数量正在急剧增长。这些药物往往与高药价有关。成本效益研究可以用来检验增加成本的比率和新干预的效果。Tim Kanters和他的同事最近在《孤儿网罕见疾病杂志》上发表了一项针对成人庞贝病（一种孤儿病）的酶替代疗法的成本效益研究。庞贝病(或II型糖原病)是一种罕见的遗传性进行性肌肉疾病，由缺乏酸-葡萄糖苷酶引起，属于糖原和溶酶体储存障碍。该疾病的特点是具有连续的临床表型。渐进的，古典的婴儿式 ...

胰岛素类似物是与常规胰岛素非常相似的分子，但有改进的药代动力学参数。这些化合物被糖尿病患者用来调节他们的血糖水平。长期和短期作用的胰岛素类似物已经被开发出来，因此这些水平可以在白天精确地调节，并且在体力活动或食物摄入后不会有太多的波动。胰岛素类似物(以及正常的胰岛素)是生长因子，除了预期的代谢效应，也触发细胞分裂。这种对细胞分裂的不利影响是一个主要的安全问题，如果胰岛素类似物触发细胞分裂活性的显著增加，可能导 ...

从塑料袋到尼龙再到燃料，乙烯是各种生产过程中的关键成分。这种广泛的使用使乙烯成为世界上产量最大的有机化合物。化学工业需要乙烯，而这种需求目前通过化石燃料的生产得以抑制。化石燃料是有限的。此外，这一过程在气候变化中也发挥了作用;把锁在地下的碳释放到大气中。乙烯生产是化学工业中排放二氧化碳最多的过程。情况很清楚。我们需要一条可再生的途径来生产乙烯——以满足不断增长的全球需求，并减少对环境的重大影响。乙烯是由植物和一 ...

碳水化合物活性酶主要存在于真菌中，包括白腐病、褐腐病和植物病原真菌。这些微生物降解植物细胞壁中含有木质素、半纤维素、纤维素、多糖和果胶的复杂基质。自1998年以来，CAZy数据库精心整理了五个碳水化合物活性酶家族的数据:糖苷水解酶(GH)、糖基转移酶(GT)、多糖裂解酶(PL)、碳水化合物酯酶(CE)和碳水化合物结合模块(CBM)。最近发现，一些成员的CBM和GH酶家族共同的作用模式，即裂解多糖单氧合酶(LPMO)，已促使C ...

咳嗽药里的葡萄味让你更容易咽下去。葡萄汽水之所以能有这种味道，是因为它含有同样的。甜味分子。这种熟悉的粘甜感觉在食物化学中有一个有趣的起源，现在我们正在解开它的基因基础，它是一种自然产生的水果味道的因素，甚至是那些我们认为尝起来不像葡萄的水果，比如草莓。食物中常见的“葡萄”味道是由一种名为邻氨基甲酸甲酯(MA)的化合物散发出来的。它首先被合成并用作一种人造葡萄香精，是水果味饮料、香水和其他普通消费品中常见的成分。 ...

CRISPR / Cas的美丽编辑系统,虽然单指南RNA (sgRNA),简单的设计和合成,是决定整个工具的目标属性,Cas9——一个稳定的,不变的元素——只负责一件事:切割DNA链的地方它是引导。我们常常过于关注单一引导rna的优点和局限性，以至于忘记了Cas9本身有一个重要的限制:只有在sgRNA识别的DNA序列旁边存在所谓的protospacer邻近motif (PAM)时，它才会切断该序列。PAM是一种特殊的短序列:最常用 ...

2017年6月4日，印第安纳波利斯一名2岁的小女孩死于落基山脉斑点热。生病前五天，她和家人去野营，很可能被虱子咬了。她很快就发了高烧和皮疹，链球菌试验呈阳性，所以她的医生最初对她进行了治疗。不幸的是，她的病情继续恶化。在又两次去看医生后，她被诊断为落基山斑疹热。虽然这种疾病在感染的早期很容易用强力霉素治疗，但此时她的身体已经不堪重负，无法恢复。如果医疗专业人员认识到她的疾病和她生病前的野营旅行之间可能存在的联系， ...

在池塘植物的根茎中发现了一种蚊虫产卵引诱剂。这一发现可以补充现有的病媒控制策略。病媒控制-防治疟疾的重要策略病媒控制是预防疟疾传播的一种极为成功的方法，杀虫剂处理过的蚊帐仍然是最被接受的预防战略。其他的病媒控制方法包括在人类住所周围喷洒杀虫剂，清除可以产卵的水池，以及在含有蚊子幼虫的水池中添加杀虫剂。这些方法往往是基于杀虫剂的应用。问题在于，如果杀虫剂使用不当或剂量过低，蚊虫对这种化学品产生抗药性的风险就会 ...

我们发现，黄体链球菌能够在重金属严重污染的土壤中生存和茁壮成长。体外筛选表明，黄体霉培养出了适应高浓度锌(Zn)、镉(Cd)和铜(Cu)的分离株。我的博士研究集中在对耐锌黄体菌分离株的调查上，因为已经证明这些分离株能够保护其寄主植物免受金属胁迫。这一特性使它们成为植物稳定应用的有趣候选材料。所以这里已经有了第一个答案，为什么研究对外来生物的适应是有用的:微生物，包括真菌，可以用于环境友好的生物修复目的。虽然主要研究 ...

生活方式、肥胖和肠道微生物组是代谢异常的重要危险因素。肠道菌群与糖尿病之间也有着许许多多的关联。微生物学家赵立平教授曾经说过，我们体内的基因，一部分来自于我们的父母，还有一部分是我们身体中共生微生物从环境中带到身体中来的基因，这些基因环境互作一起在影响着我们的生老病死。人类的肠道菌群十分复杂，糖尿病与肠道菌群的关系，近些年来也一直是研究的热点。2020 年 7 月 2 日，慕尼黑工业大学 Sandra Reitmeier 等科研人员在 Cell 子刊 ...

上午工作时，同事小黄低头从标本架上拿出一管血，看了一下，然后说道：「唉，又是溶血，这管血做不了了。」 我接过采血管一看，血清颜色都变成了暗红色，不用检测也能看出明显溶血了。于是我拨通了相应科室电话，询问抽血护士在采血过程中是否有什么异样。 采血护士想了一下说：「当时患者是有反映说止血带扎得过紧了，说有点疼。我当时也没多想，还以为是患者娇气，采完血就送过来了。」 我顿时心里有数了，又是一起因为采血导致的溶血。好在，在护士的解释和道歉下， ...

一种新的治疗超级细菌艰难梭状芽胞杆菌的方法今天发表在《微生物群系》的发行版上。加拿大研究人员开发了一种“超级益生菌”，一种名为RePOOPulate的合成粪便，作为粪便移植的替代品。该样品由33种不同的菌株组成，这些菌株是从圭尔夫大学一名41岁健康女性的粪便中分离出来的。细菌在琼脂板上纯化，通过rRNA测序鉴定，然后以固定比例聚集在一起形成回原液。加拿大金斯顿总医院(Kingston General Hospital) ...

当前的全球变化影响着所有的生物群。有些物种可以利用这些变化，而有些物种则很难应对人类引发的变化。入侵者是赢家之一，对本地物种构成了严重威胁。减轻与入侵者有关的问题引发了人们对预测哪种入侵物种和基因型可能成为入侵者的兴趣。然而，入侵往往是入侵者的特征与居民社区的特征相互作用的结果。因此，人们应该记住，在变化的世界，人为的变化不仅影响入侵者，而且影响社区的组成。此外，不同的地区有不同种类的物种聚集。因此，我们有必要问 ...

PubMed已经是更新好了，夏老师已经在很久之前就告诉你们要怎么样来装修自己的PubMed了。但当时好多傻孩子，还美滋滋地觉得，没事啊，老版的还能用啊，没问题啊……现在估计就已经跟不上了。现在随便搜一个文献的话，夏老师界面差不多是这样的：嗯，可以用My NCBI的Filter了，但是还是一样，4000字符是限额，其实就是PubMed觉得字符串太长太耗他们服务器内存，所以限缩了。但现在差不多还能有这样的结果：你会发现，只 ...