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这篇文章来自美国威斯康星大学麦迪逊分校的研究人员，分析了从乌干达基贝尔国家公园的9只黑白疣猴（colobus guereza）身上发现的新猴免疫缺陷病毒（siv）。由于非人类灵长类动物的分类和地理取样有限，特别是在东非，这项研究对SIV的多样性提出了有趣的见解。研究人员使用“无偏”深度测序技术对每种病毒的整个编码区进行测序，这种方法不依赖于与先前鉴定的病毒的遗传相似性。作者鉴定了两种不同的siv，它们只有72%的核 ...

到 2020 年，全球每人每秒将创建约 1.7 兆字节的数据，假设全球人口为 78 亿，相当于每年产生约 418 ZB（大约 4180 亿个 1 TB 硬盘）的数据量。在这一趋势下，地球上的传统存储介质的容量只能满足一个世纪的需求。图片来源：站酷海洛 Plus对此，生物学家们开始探索能否利用 DNA 的碱基序列信息作为替代传统存储的方案。随着研究的不断加深，「DNA 存储系统」的技术也日臻成熟。12 月 9 日，在 Nature Biotechnology 杂志上发表的一项研究《A DNA-of-things st ...

古老的发现一两千年来，他们互相抱着。他们的拥抱表明，即使在文明的曙光中，我们也并不孤单。这只小狗肯定有一个名字——一个被人喊出来的名字，有时是深情的，有时是严厉的，这个人的古老的指骨被发现包裹着它。今天这样的声音很常见。当时，它们预示着一种伙伴关系的开始，这种关系将界定这两个物种。这些遗骸出土于以色列北部艾因·马拉哈（Ain Mallaha）史前定居点的一座坟墓中，属于纳图菲文化。他们的定居点提供了证据，证明一个民族从狩 ...

接近一种疾病的一个关键方面是了解它的病因，而这往往被牙周炎所忽视。牙周治疗仍然主要依靠机械去除牙菌斑和牙石，基于他们是导致这种疾病进展的主要因素的假设。为什么牙周炎在某些病人身上出现，而在其他病人身上却没有出现，但是大多数人都不知道，更重要的是，人们忽略了这一点。因此，如何调节宿主的反应以阻止牙周组织的损伤仍然是临床医生无法掌握的。从骨生物学到牙周病的高级概念的转移，很像氧化应激对牙槽骨丢失的影响，是一个最近 ...

长期以来，研究者们致力于开发针对 HIV-1 的疫苗。然而，由于 HIV 具有类似于流感病毒的高变异特性，因此疫苗的开发往往无疾而终。其中代表性的例子是 2009 年在泰国进行的 RV144 临床试验 1。在为期十几年的研究之后，科学家们发现 RV144 的保护效果仅仅是「暂时的」，而且保护效果也不会随着后期疫苗的补充接种而得到增强。在此之后，研究者们将重点转移到了如何开发「诱导产生广谱性中和抗体」的疫苗。所谓广谱性中和抗体，是指能够识别不同 HIV-1 突变株表面 ...

个性化医疗的目标之一是利用数据科学工具指导医疗决策。在这里，Cihan Oguz和他的同事在BMC系统生物学的系统医学专题系列的一篇文章中描述了他们如何使用机器学习工具来开发冠心病的预测模型。在普通人群中，个体之间患冠心病的风险有很大的差异。像低密度脂蛋白胆固醇和收缩压这样的临床变量并不总是能说明一个人患冠心病的风险。过去的研究表明，患者的冠状动脉钙（CAC）水平是冠心病以及致命心脏事件（如心脏病发作）的有力预 ...

很久以前，当我们仍然使用限制性内切酶来识别多态性，而“表观遗传”一词被用来驳斥那些不遵循“DNA使RNA产生蛋白质”这一中心教条的古怪数据时，我们曾经认为基因是垃圾DNA海洋中碱基的线性序列。十多年前，就在人类基因组测序项目即将完成之际，“表观遗传”一词仅限于基因表达变化的稳定有丝分裂遗传的实例，而这些变化不能归因于核苷酸序列的变化。DNA甲基化和组蛋白修饰与基因表达变化有关，大多数表观遗传学研究涉及DNA甲基 ...

自 19 世纪以来，在技术进步的推动下人类的预期寿命大大增加。要维持更长的寿命就需要了解影响寿命的潜在机制。目前大多数的研究都集中在基因与环境，但即使是在特定的环境条件下饲养相同基因型动物，个体寿命之间也存在超过 50 倍的差异。这提示了可能有更多的随机因素影响寿命。2019 年 12 月 4 日来自密歇根大学 Ursula Jakob 教授团队合作在 Nature 上在线发表题为《Developmental ROS individualizes organismal str ...

一首由DNA制成的歌曲不太可能高居排行榜首位，但将DNA序列转换成音符，可能会识别出原本可能被遗漏的突变。最近发表在BMC生物信息学上的一篇文章研究了六种不同的算法，它们可以将DNA转换成音符，并强调了声波发现特定DNA特性的能力。基因组学的研究者们已经习惯于看到DNA序列以A、T、C和Gs的长序列来表示，但是有没有更好的方法来分析这些数据呢？西悉尼大学（Western Sydney University）的马克坦普 ...

基因组生物学最近的一期关于基因组编辑见解的专刊强调了利用一系列强大的基因组编辑工具从工程基因组中获得的宝贵见解。中国双胞胎婴儿出生的突发新闻，其CCR5基因被编辑以保护他们免受艾滋病毒感染，再次将基因组工程置于热议的中心。人类和农业基因组工程一直是许多研究人员以及决策机构关注的焦点，然而，基因组编辑工具不仅可以用于产生具有某些期望特征的生物体，而且还可以用于了解更多关于特定生物机制的知识。植物病原菌抗性一 ...

嵌合抗原受体 T 细胞免疫疗法（Chimeric Antigen Receptor T-Cell Immunotherapy, CAR-T），是近年来发展迅速的细胞治疗技术，可特异性识别肿瘤相关抗原，使效应 T 细胞具有更高的靶向性、杀伤性和持久性，并可克服肿瘤局部免疫抑制微环境，并打破宿主免疫耐受状态。虽然 CAR-T 在实体瘤中疗效不佳，但在肿瘤治疗领域仍具广泛前景。然而，因 T 细胞耗竭导致 CAR-T 细胞功能障碍，严重地阻碍了 CAR-T 治疗的进展。2019 年 12 月 4 日，美国斯坦福 ...

Discussion 是一篇 SCI 论文中最难写的部分，该部分需要作者对比领域前人所做的研究，结合本研究，并对未来方向进行科学展望，Discussion 是作者科研水平的直观体现。Discussion 的好坏很大程度上决定 SCI 能否被接收。本文以 2019 年 8 月 13 日发表在 JAMA 上的一篇文章为例，和大家分享下 SCI 论文中 Discussion 的写作套路。图片来源：JAMADiscussion 原文Higher residential concentrations of O3, ...

众所周知，qPCR 从来就不是让人省心的实验。小心翼翼的提 RNA，宝贝一样的呵护起来；兢兢业业的摸索最佳温度梯度，生怕引物探针一言不合就「罢工」；好不容易跋山涉水来到最后一关，拿到了一大堆 Cq 值，可大神级的 SPSS、R 语言听起来就头大，更惶论轻松掌握了，不擅长统计分析的你是不是欲哭无泪？终于，福音出现了 —— SATQPCR 1全称：short for Statistical Analysis Tool for Quantitative PCR Data它是免费的网页版 ...

近年来，世界各地悄然兴起一股让人忧心忡忡的的风潮 ——「反疫苗运动」。世界卫生组织（WHO）曾报道：从 2017 年开始，包括发达国家在内，全球的麻疹病例呈现激增的趋势。现阶段出现的「疫苗犹豫」（尽管有疫苗可用，但不愿接种或拒绝接种的现象）或许会成为全球健康的最大威胁之一。实质上，疫苗接种是保证人口健康，预防疾病传播的最重要和有效的干预措施之一。在 21 世纪的今天，疫苗接种已经成为公共卫生的重要一环，接种疫苗，可能关乎整个国家乃至整个世界 ...

造血干细胞，是一种具有自我更新能力及可分化产生红细胞、白细胞、血小板等各种类型的血细胞的干细胞。因此，造血干细胞移植也是目前治疗血液系统恶性疾病最有效的方式之一。尽管造血干细胞移植的治疗策略已经在过去几十年里挽救了无数生命，但其也有明显的局限性。首先，找到 HLA 完全匹配的骨髓捐献者很难，而 HLA 不匹配又是发生移植后免疫疾病的重要原因；脐带血移植可在一定程度上缓解 HLA 不匹配的难题，但是脐带血中的较少数量的造血干细是影响移 ...

随着生活水平的提高，肥胖已经成为一种常见的慢性疾病。据统计，仅在我国就已经有超过 3 亿人属于超重和肥胖人群。机体的过度肥胖除了会诱导多种肥胖并发症比如糖尿病，高血压和心血管类疾病的发生，还会促进肝癌的发展。然而肥胖是否会影响其他类型癌症比如乳腺癌的发生发展目前还不清楚，肥胖是否影响机体的抗肿瘤免疫反应也有待进一步研究。2019 年 11 月 21 日，来自美国希望之城综合癌症中心的 Hua Yu 教授团队和 Saul Priceman 教授团队合作在 Cell M ...

发表在《血癌杂志》上的一项新研究提供了多发性骨髓瘤和慢性淋巴细胞白血病之间的遗传相关性的证据，使人们能够洞察这些血癌的共同遗传基础。我们经常谈论从我们的家庭传下来的特征——无论是我们父亲的发际线，我们祖母的鼻子，还是我们叔叔的音乐天赋。这些特征可能受我们的环境或遗传组成的影响。我们可以量化我们的基因构成对某些性状的“遗传力”的影响。这种遗传力是用一个量表来衡量的，0表示“遗传没有影响”，1表示“完全是遗传造成的”。除 ...

在2019年INSAR的主题演讲之前，我们与凯瑟琳·罗德教授讨论了她的研究。今年的国际自闭症研究学会（INSAR）年会将于5月1日至4日举行。会议开幕时将发表一个主题演讲，题为“编码和非编码区域的新变化：我们可以从凯瑟琳·罗德教授关于病因途径的数据中学到什么”。罗德教授是卡内基梅隆大学（Carnegie Mellon University）的副教务长兼统计学和计算生物学教授。除了获得2013年珍妮特·L·诺伍德奖、1997 ...

据世界卫生组织报道，截至 2018 年底，全球估计有 3790 万艾滋病毒感染者，与艾滋病相关的死亡人数达到 77 万人。其中非洲地区受到的影响最大，2018 年有 2570 万艾滋病毒感染者，占到全球艾滋病毒新发感染总数的近三分之二。图片来源：世界卫生组织官网艾滋病在中国1985 年 6 月，北京协和医院首次报告我国境内第一例艾滋病病人，此人为来中国旅游的美籍阿根廷人，发病后 5 天死亡，其并发症状为卡氏肺囊虫肺炎感染。之后的艾滋病病例报告也均是来华外国人和海外 ...

由于与机体发育、器官大小调控、组织稳态和肿瘤发生密切相关，近些年来，关于 Hippo 信号通路的研究也越来越受到重视。先前的研究表明，Hippo 信号通路实质上是一个激酶级联反应介导的生长抑制信号通路。在感知多种信号刺激时，比如细胞连接、细胞极化、血清饥饿和溶血磷脂酸（LPA）缺乏，Hippo 信号通路中的关键激酶 MST1/2 和 MAP4Ks 会磷酸化活化 LATS1/2 激酶，后者诱导 YAP/TAZ 磷酸化，抑制 YAP/TAZ 入核启动靶标基因表达，从而阻断 YAP 的 ...