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        琼脂糖凝胶电泳法检测细胞凋亡(基于细胞核DNA变化检测细胞凋亡)

        相关实验:基于细胞核DNA变化检测细胞凋亡

        最新修订时间:

        简介

        琼脂糖凝胶电泳法检测细胞凋亡是提取凋亡组织或细胞的 DNA,经琼脂糖凝胶电泳,分离不同长度的 DNA 片段,再经 EB 染色,紫外灯下观察,可见特征性的梯状条带(ladder)。

        原理

        琼脂糖凝胶电泳法检测细胞凋亡的基本原理是凋亡出现时,细胞内源性的核酸内切酶被激活,将染色质 DNA 自核小体间降解,形成相差 180~200 bp的大小不等的寡核苷酸片段。

        提取凋亡组织或细胞的 DNA,经琼脂糖凝胶电泳,分离不同长度的 DNA 片段,再经 EB 染色,紫外灯下观察,可见特征性的梯状条带(ladder)。

        材料与仪器

        器材:

        ① 500 mL 的锥形瓶

        ② 1.5 mL Eppendorf 管

        ③ 移液器吸头

        ④ 10 mL 吸管

        ⑤ 吸管橡皮球

        ⑥ 水浴箱

        ⑦ 微波炉

        ⑧ 离心机

        ⑨ 电泳仪

        ⑩ 电泳槽

        ⑪ 紫外灯

        ⑫ 微量移液器

        ⑬ HeLa 细胞(或别的细胞)。

        试剂:

        ① 凋亡诱导剂(根据情况自定)

        ② 消化液(0.02% EDTA)

        ③ PBS

        ④ 裂解液

        (NaCl(100 mmol/L,pH8.0),Tris-Cl(10 mmol/L),EDTA(25 mmol/L,pH8.0),SDS(5 g/L))

        ⑤ 蛋白酶 K(20 mg/mL)

        ⑥ RNA 酶(10 mg/mL)

        ⑦ 苯酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)

        ⑧ 3 mol/L 乙酸钠(pH5.2)

        ⑨ 100% 乙醇

        ⑩ 70% 乙醇

        ⑪ TE 缓冲液

        ⑫ 电泳缓冲液(TAE)

        ⑬ 琼脂糖

        ⑭ EB(10 mg/mL)

        ⑮ 6 x 上样缓冲液

        步骤

        琼脂糖凝胶电泳法检测细胞凋亡的基本过程可分为如下几步:

        A 将 5 x 106 个已诱导凋亡的细胞收集至 1.5 mL Eppendorf 管中,600 r/min 离心 5 min,弃上清液。

        B 冷 PBS(4 ℃)重悬细胞,1000 r/min 离心,弃上清液。

        C 加入 497.5 μL 裂解液、2.5 μL 蛋白酶 K,重悬细胞。56 ℃ 水浴 3 h(或 37 ℃ 过夜),期间轻摇几次。

        D 加入等体积的苯酚-氯仿-异戊醇(500 μL),轻播 5 min,20000 r/min 离心 5 min,将水相移至一新 1.5 mL Eppendorf 管中。重复抽提一次。

        E 加入 1/10 体积的乙酸钠(3 mol/L),2.5 倍体积的 100% 乙醇,上下颠倒、混匀,冰浴 10~15 min。20000 r/min 离心 10 min 沉淀DNA,弃上清。

        F 70% 乙醇洗涤,晾干或真空抽干。

        G 加入 TE 缓冲液 30~50 μL、RNA 酶 5 μL,37 ℃ 水浴 30~60 min[可重复步骤(4)~(6),以去除 RNA 酶]。

        H 取 10 μL,加 2 μL 电泳缓冲液电泳于含 EB(终浓度为 0.5 μg/mL)的 1% 琼脂糖凝胶,电泳(电压为 ≤ 5 V/cm)。紫外灯下观察结果。

        注意事项

        1 苯酚有强腐蚀性,能引起烧伤。氯仿有致癌作用,对皮肤、眼睛、黏膜和呼吸道有刺激性。所以苯酚-氯仿-异戊醇相关的操作应戴手套、穿白大衣,在化学通风橱内操作。其废弃物应有专门的容器。

        2 EB 为强诱变剂,有中度毒性。提示学生操作时应戴手套。EB 污染物及废弃液应单独存放。

        来源:丁香实验

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