转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验

染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation, ChIP )的基本原理是特异性抗体沉淀拟研究的目标蛋白，富集在细胞内与此蛋白相结合的DNA片段并分析该片段序列。

为保持蛋白质-DNA复合物的稳定，在裂解细胞前，需要先用化学交联试剂将细胞内原有的蛋白质-DNA复合物固定。细胞裂解后，将高分子染色质随机切断为一定长度范围内的小片段，然后通过免疫学方法沉淀这些蛋白质-DNA复合体，再利用PCR技术特异性地富集目的蛋白所结合的DNA片段，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。

通过鉴定所获得的DNA片段，可确定该种蛋白在细胞内所结合的DNA序列；同时还可以对复合物中蛋白质分子的结构及化学修饰进行鉴定。图解示意如下17-3。

转录调节蛋白与 DNA 的结合分析实验的常用应用领域如下：

转录调节蛋白与相应的 DNA 顺式作用元件的结合。