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上海研匠生物科技有限公司
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外泌体转录组,microRNA和lncRNA组学
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周期2周
外泌体转录组,microRNA和lncRNA组学
周期:2周包分析1. 背景:
外泌体天然适于运输蛋白质、mRNA、miRNA、各种非编码RNA、线粒体DNA以及基因组DNA。本实验采用 illumina Hiseq 测序平台的单端50bp测序模式对样本进行高通量测序。原始数据需经过引物与adaptor序列去除,并经过对测序片段碱基的质量检验和长度筛选,最终选择质量可靠的测序片段。然后统计小RNA(sRNA)的种类(用unique表示)及数量(用total表示),并对小RNA做长度分布统计,一般来说,小RNA的长度区间为18~30nt,长度分布的峰能帮助我们判断小RNA的种类,如miRNA集中在21或22nt,siRNA集中在24nt,piRNA集中在30nt。此分析报告来自于 云计算 (云计算资源由 Cloud 提供)。
2. 实验和分析:
microRNA 是一类重要的内源性短非编码RNA,涉及癌症,细胞发育,应激响应 等重要生物学过程,并常具有微量高效的作用特点。使用 fastx_clipper 对原始数据进行接头序列的去除,筛选掉低质量序列,选取长度在14~40(nt)的序列用于下游分析,并对整个筛选过程进行相关统计。
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文献和实验该产品被引用文献
1. Exosomes: From Garbage Bins to Promising Therapeutic Targets. International journal of molecular sciences,18(3),538.
2. Exosomes in cancer development,metastasis,and immunity. Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer,1871(2),455–468.
3.The potential of exosomes as theragnostics in various clinical situations.Exosomes,467–486.
4. Review of the Isolation, Characterization, Biological Function, and Multifarious Therapeutic Approaches of Exosomes.Cells,8(4),307.
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外泌体转录组,microRNA和lncRNA组学
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