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转录组测序实验
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上海达为科生物科技有限公司
一、转录组测序实验产品介绍
转录组测序(Transcriptome sequencing)是通过二代测序平台快速地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的的转录本及基因序列,可以用于研究基因表达量、基因功能、结构、可变剪接和新转录本预测等。目前,转录组测序已经被广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。上海剑钝生物利用标准化的实验流程、先进的测序平台和专业的信息分析,以高效率、高质量的科技服务赢得业内专业人士的良好口碑。
二、样品要求
1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。
2)样品的量:细胞样品请提供至少1×107个细胞,组织样品请提供至少300mg的组织块或切片,RNA样品请提供10μg以上的总RNA。
3)样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 8。
4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。
三、转录组测序实验操作流程
1. 全转录组总RNA提取;
2. mRNA分离和文库构建;
3. 高通量测序;
4. 数据处理与生物信息学分析;
5. 测序报告生成。
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