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连锁分析芯片(Linkage Analysis)

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  • 2025年07月15日
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      连锁分析芯片(Linkage Analysis)

    连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具,可以从家系基因型表现型和单基因型连锁不平衡中发现连锁关系。目前有人类及小鼠共4款芯片可选择。

    HumanLinkage-24 Beadchip
    每张芯片可检测24个样品,覆盖6090个SNP位点,位点信息来源于HapMap数据库,两个SNP平均间距441Kb。人类连锁分析芯片成功率为99.8%,重复性>99.9%。
    HumanLinkage V Panel Set
    该芯片覆盖染色体区域内6056个SNP标记,两个SNP 标记平均间距482Kb,用于检测重组。经过8个欧裔家系样本的检测证明Linkage V Panel 涵盖了全基因组中93.7%的信息,在任何一个染色体的区域的信息量都不会低于81%。
    Mouse LD Linkage
    最适合N2和F2 小鼠株系,对于其它任何株系或杂交系有平均85%的覆盖度。377个位点,基因组中每27Mb约有4个SNPs,并均匀覆盖了整个基因组。
    Mouse MD LinkageBeadchip
    主要在10种最常用的小鼠纯株系基因组总挑选出来的,1449个位点,密度为5Mb大约3个SNP,并均匀覆盖了小鼠的整个基因组。

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    相关实验
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    • 罗特分析 Rot analysis

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    • Cell cycle analysis of Escherichia coli cells

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