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锐博生物
长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA 分子(不含rRNA),长度在200bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控,尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色,如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA的诱导分子干扰基因的表达等。目前,lncRNA已经成为继信使RNA(mRNA)、小RNA(microRNA、piRNA、siRNA等)之后功能基因组学最火热的研究领域,但是绝大部分lncRNA的功能目前仍不清楚。
锐博生物已推出长链非编码RNA测序(lncRNA seq)服务。本服务利用去rRNA法构建文库,使用目前最先进的HiSeq 3000平台测序,突破了常规lncRNA芯片检测技术的使用范围限制,可一次性获得样本中几乎全部转录产物序列,通过先进的生物信息学分析, 可以更加高效地获取lncRNA序列信息,助力研究者对新的lncRNA进行预测及分析。
无物种限制:无需了解物种的基因或基因组信息,便可直接对任意物种进行最全面的转录组分析。可检测未知基因,发现新的转录本。
高精确度:数字化信号,可精确检测到基因家族中相似基因以及可变剪切造成的不同转录本的单碱基差异。
高覆盖度:新一代高通量测序技术的高深度覆盖,可以检测到低丰度的稀有转录本。
实验流程

测序模式
HiSeq 3000/2500
PE150/PE100 测序模式
>10G clean data( 去rRNA法).
信息分析
个性化数据分析
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文献和实验质的修饰水平 5. 与mRNA配对结合,影响翻译,剪切,mRNA的稳定性(类似miRNA功能) 作用 1. Co-location,也称cis作用 2. Co-expression, 也称trans作用 • LncRNA研究基本技术 1. 芯片或测序寻找新的lncRNA 2. 生物信息学分析 3. lncRNA定位 4. 过表达或敲减功能验证 5. lncRNA互作机制研究 • LncRNA的生物信息学分析 1. 基本处理 Ø
研究背景: 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200 bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控,尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色,如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA的诱导分子干扰基因的表达等。随着高通量测序技术的发展,越来越多的lncRNA被注释
了作为一条 RNA 的使命,我这颗静如止水的心也按捺不住了,我也渴望被发掘,我也渴望被研究,我也渴望完成我的使命,让大家深入的了解我。终于,机会来了,一位年轻的科研工作者从众多的 RNA-SEQ 的数据中发现了我们,进行不同时期的实时荧光量 PCR 的检测之后,他决定对我这条期特异性表达的非编码 RNA 进行研究。我终于守得云开见月明,有了被研究的价值。由于我的长度大于 200bp,所以我的主人称我为长链非编码 RNA,简写为 lncRNA。我很喜欢我的名字。然而研究的过程并非一帆风顺。我的主人首先需要
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