单细胞全基因组甲基化测序（scWGBS）

技术原理    伯豪生物  单细胞全基因组甲基化测序

技术简介

近年来，在肿瘤早筛和发育生物学研究领域，科学工作者对于 DNA 甲基化研究的关注度持续高涨。目前 DNA 甲基化的研究，大多数情况下依然是借助于亚硫酸氢盐修饰，而该过程会引起 DNA 的大量损失。所以需要对该过程加以优化以满足 DNA 甲基化超微量研究的需求。伯豪生物通过大量的实验测试，优化了该过程， 现在已经具备为客户提供单细胞甲基化研究服务的能力。 结合单细胞的 RNA 测序（Smart-seq），可以从多个维度深入了解生物体发育和分化过程中基因表达的动态变化。

scWGBS 的技术优势

• DNA 起始量要求低：超微量检测，仅需个位数的细胞量
• 生信分析：获取信息量大、可精细化分析
• 数据质量：mapping ratio，冗余度等接近正常 WGBS 数据。

单细胞全基因组甲基化测序（scWGBS）实验流程

样本要求

• 物种：人，大小鼠，其他物种需评估
• 类型：细胞系、原代细胞、新鲜组织、冻存细胞
• 数据量：PE 150bp, 15G
• 保存运输：单细胞样本 0.2ml 低吸附管收集，液氮保存，干冰寄送（或联系当地销售寄送保护液）。

应用领域

1、肿瘤异质性：揭示癌细胞的甲基化图谱；
2、细胞分化：绘制细胞分化调控表观图谱；
3、免疫微环境：免疫细胞激化、分化等过程的表观调控机制；
4、神经科学：神经细胞亚型分类、探究神经相关疾病的分子机制。

分析流程




                                  ▲圈图展示差异甲基化位点在不同染色体上的分布