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伯豪生物
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单细胞核RNA测序(snRNA-seq)/单细胞核转录组测序
伯豪生物单细胞核转录组测序技术服务来了,单细胞核测序snRNA-seq

伯豪生物单细胞核转录组测序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是从组织抽提细胞核,然后在单个细胞核水平上对转录组进行高通量测序分析的一项新技术,通过检测单个细胞核的基因表达状态,进而揭示细胞间的异质性。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务,snRNA-seq
伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞测序技术服务
冷冻样本和难消化样本的完美解决方案
1、适用于冻存组织样品;克服新鲜样品时效性限制;
2、适用于难以制备单细胞悬液的组织样品;
3、减少解离偏差,能更好地保留细胞类型多样性;
4、不需要酶促消化,真实反映细胞的组分。
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伯豪生物优势
1、高质量抽核:抽核经验丰富,针对不同组织优化了解决方案;
2、标准化内控:丰富的实操经验构建了标准化的内控体系;
3、流程化分析:完善的分析流程,准确快速解析单细胞核转录组数据;
4、专业化团队:资深的技术团队具有多年项目方案设计、实验操作、售后分析等经验;
5、全流程服务:提供组织抽核、单细胞核捕获、反转录、建库测序及数据分析的全套服务。
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送样要求
1、组织用量:黄豆粒大小 1 块;
2、样本处理:组织液氮速冻,-80℃保存;
3、质量要求:组织 RNA 无降解,RIN≥7;
4、运输方式:干冰运输。
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应用方向
冷冻样本;通过消化难拿到高质量的单细胞悬液的组织类型。
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研究成果
图 人松果体单细胞核
图 小鼠大脑皮层单细胞核
图 小鼠心脏组织细胞核 RNA 质检(RIN=8.9)
图 PCR 验证组织与细胞核、组织与消化细胞的差别(0 为相同)
【单细胞转录组测序】VS【单细胞核转录组测序】结果对比
1、随着测序深度的不断增加,单细胞核转录组测序(snRNA-seq)和单细胞转录组测序(scRNA-seq)得到的基因数相近;
2、单细胞核转录组测序在细胞分群上与单细胞转录组测序没有区别;
3、单细胞核转录组测序可有效挖掘稀有细胞类型(单细胞核转录组测序可以减少组织消化引起的偏差);
4、单细胞核转录组测序结果中发现较少压力相关基因的表达;
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参考文献
[1]Habib, Naomi, Avraham-Davidi, Inbal, Basu, Anindita, et al. Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq[J]. Nature Methods, 2017, 14(10):955-958.
[2] Wu, Haojia, Kirita, Yuhei, Donnelly, Erinn L, 等。Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis[J]. Journal of the American Society of Nephrology, 2018.
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伯生物在线客服 伯豪生物提供 单细胞测序、单细胞基因表达专业技术服务解决方案
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文献和实验伯豪生物客户项目发文
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【样本】骨软组织 【服务】单细胞核RNA测序 | An advanced comprehensive muti-cell-type-specific model for predicting anti-PD-1 therapeutic effect in melanoma | Theranostics | 12.4 | 2024年 | 疾病机制 |
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【样本】大脑组织 【服务】单细胞核RNA测序 | Radiotherapy-Induced Astrocyte Senescence Promotes anImmunosuppressive Microenvironment in Glioblastoma to Facilitate Tumor Regrowth | Advanced Science | 15.1 | 2024年 | 疾病机制 |
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操作演示
单细胞测序悬液老是制备失败?别担心,单细胞核测序来拯救你的样本了
越多的被应用到各种研究中。 这篇文章对17名死于COVID-19的人进行临床解剖时收集了11个器官的组织,形成了一个约有420个标本的组织库。通过对肺、肾、肝和心脏等组织的单细胞测序(sc-RNA-seq)和单细胞核测序(snRNA-Seq),得到了SARS-CoV-2感染后不同组织全面的单细胞图谱;可见单细胞核测序已经被运用于各种不同的组织类型。 目前吉凯已经积累了各种不同类型样本的单细胞核测序(snRNA-seq)经验,并且在单细胞核抽提方面也是一如既往的发挥了吉凯强大且专业的单细胞
-seq利用的Tn5转座酶没有偏好性,它能够完整地将整个开放区域的序列直接捕获下来,所需的细胞数量少(最少500个起始细胞),能够在短时间内使用微量样本获得大量有效信息,且灵敏度高、实验的重复性较好。 scATAC-seq能做什么? ATAC-seq是把所有实验细胞看作了一个整体,获得所有细胞混合的基因信息。scATAC-seq是在ATAC-seq的基础上,进行细胞核的分选和标记,通过barcode识别细胞核,解决了不同细胞群体的异质性的问题,能够检测出混杂样品测序所无法得到的异质性信息。相较











