PIXUL 多样本超声破碎仪/ChIP实验细胞破碎/二代测序

PIXUL™多样本超声破碎仪

    ——升级到PIXUL，实现染色质，DNA，RNA和蛋白质的真正可重复剪切

 

NGS应用如ChIP-Seq，RNA-Seq，RIP-Seq，外显子测序和全基因组测序，需要精确的样品片段化（200-600 bp）处理才能与短读长的测序平台兼容。与酶切方法相比，物理超声剪切具有无序列偏好性和产生相对较窄的片段分布的优点，因此做为样品片段化处理的优先选择。

然而，目前市场上可用的大多数的超声处理系统与高通量样品处理不兼容，或者需要昂贵的专用耗材。 PIXUL是第一个也是唯一的可同时处理96个样本，并且产生稳定一致的剪切效果的多样本超声破碎仪。此外，PIXUL还具有操作简单快速，价格低廉的优点。

 

PIXUL多样本超声破碎仪

 

• 同时平行处理1-96个样本以消除NGS应用中样本高通量剪切处理的瓶颈

• 单个96孔板上最多可以同时运行12种不同的超声处理条件，从而可以同时处理多种类型样品，或者快速优化处理样品的超声条件

• 与纯化提取样品、细胞或组织的染色质、DNA、RNA和蛋白兼容

• 价格低廉的耗材使样品处理费用保持低水平

• 短至15分钟的耦合流体循环避免了冗长的水脱气过程，根据样本类型和应用的不同，PIXUL处理多达96个样品的超声时间仅需10-30分钟。

• 与PIXUL多样本DNA打断仪一起使用的低成本圆底板可直接与细胞培养和剪切兼容，从而消除了样品转移步骤带来的不方便和样本损失。

PIXUL 多样本超声破碎仪样本处理数据展示
 

数据1，PIXUL提供极其稳定一致的基因组DNA剪切效果

为了测试PIXUL 多样本超声破碎仪超声处理结果的一致性，将纯化的基因组DNA加到PIXUL 96孔板的所有孔中进行超声处理，处理结束后通过片段分布检查超声处理的一致性和效率。在整个96孔板上观察到高度一致的平均片段长度和标准差，如下图。

 

                          

 

数据2. PIXUL提供比竞争对手C更优质的染色质剪切效果

剪切片段大小分布相对较窄且稳定一致的剪切效果对ChIP-Seq研究是非常有帮助的，因为这样可以提高转录因子结合

位点或组蛋白翻译后修饰位置的分辨率。为了评估不同的多样本超声仪之间的染色质超声处理一致性，我们将PIXUL与领先的竞争对手C超声处理系统进行了比较。与竞争对手C相比，PIXUL在染色质剪切方面表现出更高的一致性。

 

数据3. 与竞争对手D相比，PIXUL可实现更一致的超声处理和更高的染色质回收率

PIXUL 96孔板可与细胞培养，固定和超声处理步骤兼容，因此无需将样品从培养板转移到超声板，并且无需担心样品丢失的风险。与竞争对手D相比，PIXUL在超声处理后显示出更紧密的染色质片段大小分布，以及更高的染色质回收率（数据未显示）。




数据4. 仅需要竞争对手C的小部分成本，PIXUL就能提供与之相当的外显子测序结果
在外显子测序实验中比较PIXUL与竞争对手C的表现。该实验需要首先进行DNA剪切。使用500 ng起始DNA，用PIXUL或竞争对手C剪切样品，构建文库，富集外显子并测序。分析的几种测序指标表明PIXUL仪器生产的外显子文库性能与竞争对手C相当，而PIXUL及耗材成本仅为竞争产品C的一小部分。





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