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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
53
- 英文名:
SYBRGreenIIRNA
- 保质期:
有效期2年
- 供应商:
上海谷研
- 保存条件:
-20°C
- 规格:
支
原则:不与DNA反应,对其无影响。
1.纯乙醇(二倍体积比);效率高,需要放置的时间短,在公司用Kit提取的时候,没有放置直接进行下一步;确定是价格相对昂贵。
2.95%乙醇,价格相对于纯乙醇便宜,但是会损失DNA;
3.异丙醇(0.6倍体积);
(1)普通细胞上清液体,静止15-30min即可沉淀;
(2)对于含量低,或者组织(比如我现在经常提取的小鼠的肝脏中的Total和cccDNA),则最好在-20℃放置2h或者以上,
本人提取肝脏组织DNA时候,最长时间放置了三天,对结果并无影响;上周提取细胞中cccDNA的时候,室温放置了15min,结果提出的DNA含量也挺高的,而且之后的Southern结果也很成功。我猜测可能是含量高,所以时间短点也可以,但是如果时间不是很着急,还是按照规定的时间来做比较保险。
产品名称:SYBR Green II RNA
别名:SYBRGreenIIRNA
英文名称:SYBRGreenIIRNA
储存条件:-20°C,有效期2年
单位:支
l AnalyzesmallaliquotsfromRNApreparationsbeforeNorthernblotting,start-sitemappingorcDNApreparationl Visualizethemigrationbehaviorof5SrRNAspeciesafterhigh-resolutiondenaturinggradientelectrophoresis(DGGE)l StainDNAinsingle-strandconformationpolymorphism(SSCP)l StainDNAbeforeamplificationbyPCRMaterialsContentsSYBRGreenIIstainisprovidedasa10,000XconcentrateinDMSOinthefollowingsizes:l 50μL(SY1040-50)l 500μL(SY1040-500)StorageUponreceipt,storethedyefrozenat-20°C,protectedfromlightinadesiccator.Whenstoredproperly,theSYBRGreenIIstainstocksolutioninDMSOisstableforsixmonthstooneyear.注:SYBRGreenII主要用于RNA和单链DNA电泳。是EB的替代品,无致癌性,超敏感性。用作常规电泳时,须将商品化的核酸MARKER作一定倍数的稀释(1/5-1/10),这样才能得到比较理想的结果。
作用及原理:
⒈溶液I—溶菌液:
溶菌酶:它是糖苷水解酶,能水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌的作用。当溶液中pH小于8时,溶菌酶作用受到抑制。
葡萄糖:增加溶液的粘度,维持渗透压,防止DNA受机械剪切力作用而降解。
EDTA:(1)螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时需要一定的金属离子作辅基);(2)EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。
⒉溶液II-NaOH-SDS液:
NaOH:核酸在pH大于5,小于9的溶液中,是稳定的。
但当pH>12或pH<3时,就会引起双链之间氢键的解离而变性。
SYBR Green II RNA在溶液II中的NaOH浓度为0.2mo1/L,加抽提液时,该系统的pH就高达12.6,因而促使染色体DNA与质粒DNA的变性。
SDS:SDS是离子型表面活性剂。它主要功能有:
(1)溶解细胞膜上的脂质与蛋白,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜。
(2)解聚细胞中的核蛋白。
(3)SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-…R+-蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。但是SDS能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,防止在下一步操作中(用RNase去除RNA时)受到干扰。
根据不同浓度的氯化钠溶液对DNA和蛋白质的溶解度不同原理,可以在提取不同类型DNA使用中加以利用。
1.Nacl是常用的盐析材料之一,盐析即在高浓度Nacl溶液中,蛋白质析出的现象。原理如下
(1)Nacl溶液与蛋白质争夺水分子,破坏蛋白质胶体颗粒表面的水膜;
(2)Nacl溶液大量中和蛋白质颗粒上的电荷,从而使水中蛋白质颗粒积聚而沉淀析出;
2.不同浓度下DNA分子构象(三维结构)不同,不同的构象溶解度也不同。
(1)当NaCl溶液的浓度为0.14mol/L时,DNA溶解度最小,因此改变NaCl溶液的浓度既能使DNA溶解也能使其析出;
(2)DNA在不同浓度的氯化钠溶液中随着氯化钠的浓度不断升高;
3.所以可以使用适当的高浓度Nacl溶液,使得蛋白质析出,而DNA溶解度较大,通过高速离心,取上清并去除沉淀,进而去除蛋白质。
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英文名称:Human MMP-9 ELISA KIT
反应性:Human
样品类型:Serum, plasma, Cell culture supernatant
灵敏度:30 pg/ml
检测目标:MMP-9
应用:Sandwich ELISA
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文献和实验SYBR Green Quantitative PCR Protocol
12μl of master mix for each well, plus some excess1 Rxn: 10μl SYBR Green Mix 52 Rxn: 520μl SYBR 0.4μl Forward Primer (10μM stock) 20.8μl F
REAL TIME PCR WITH SYBR GREEN I 建议PROTOCOL
1、反应体系 25ulCocktail 20 ul: Primer FP 1 ul + Primer RP 1u + 2 * SYBR GREEN I MIX 12.5 + H2O 5.5 ul cDNA 5 ul2、Primer 浓度,需要摸索,从200nM到700nm等,设置不同浓度。3、每个引物浓度,从well 1到12设置4个样本,阳性cDNA 1和2,NTC以及H2O,做triplicate。4、若用ABI7000或7700,所有的PCR条件可设置成一致的,减少麻烦,当然,引物
曲线分析. 依据PDs 和扩增产物的熔解温度( Tm) 特点,在通用的三步法的延伸步骤之后,增加一个短暂的(5 s) 恒温和荧光检测步骤,使这个步骤的温度高于PDs 的Tm ,但低于扩增产物的Tm ,简称该法为四步法. PDs 的Tm 通常高于72 ℃,但低于扩增产物的Tm . 将四步法第四步的温度设置在高于PDs 的Tm ,但低于扩增产物的Tm 时,四步法能够有效地消除PDs 的影响. 对三步法和四步法SYBR green Ⅰ实时定量RT-PCR 进行了比较,发现三步法根本不能用于RNA 的实时定量,而四
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