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CUT&Tag测序服务

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  • 2026年01月03日
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      表观生物

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      CUT&Tag测序服务

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    产品细节图片1
     

    CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation),即靶向剪切及转座酶技术,是一种利用酶锚定技术进行高效、高分辨率的DNA测序文库构建方法,适用于蛋白质—DNA互作研究,样本所需的细胞量少,能够揭示更多染色质的特征以及在调控基因表达方面的重要作用。

    表观生物CUT&Tag服务作为一种颠覆以往繁琐复杂的蛋白质—互作研究方法的革命性技术,将协助客户掀起表观遗传学研究领域新的风暴!

    技术原理
    将特异的抗体(如H3K27ac),与染色质蛋白原位结合,然后锚定到A-Tn5转座融合蛋白。Tn5转座酶活性被激活,仅将抗体靶蛋白结合的染色质片段化,高效产生高分辨率、低背景的片段文库。

    产品细节图片2
    CUT&Tag技术原理:一抗染色质上的目的蛋白结合,二抗与一抗结合,随后A-Tn5转座体与抗体结合;激活转座体,将目的蛋白结合的的DNA片段化


    技术应用

    1. 挖掘蛋白质—DNA相互作用
    2. 检测基因组上的组蛋白修饰,鉴定超级增强子
    3. 检测基因组的开放性、转录因子结合图谱,鉴定超级增强子
    4. 绘制核小体、RNAPII等蛋白的染色质图谱


    技术特点

    1. 样本量仅需20万个细胞
    2. 操作便捷,一管完成所有步骤
    3. 信噪比高(背景低),重复性好

    分析内容
    1. 基因组比对分析
    2. 基因组富集分析
    2.1   富集区域基本信息
    2.2   富集区域分布特征
    2.3   Peak相关基因GO分析
    2.4   Peak相关基因KEGG分析 
    2.5   差异Peak相关基因GO,KEGG分析 
    3. 富集区域motif分析
    4. 超级增强子分析(H3K27ac抗体、BRD4抗体)


    送样要求

    样本类型:活细胞,2x105 ~5 x105 个细胞/样本
    样本物种:仅限人、大小鼠,其他物种需评估。


    表观生物实测数据

    产品细节图片3
    图1 表观生物CUT&Tag文库质控图
    产品细节图片4
    图2 表观生物利用CUT&Tag检测组蛋白修饰H3K27me3的读长覆盖图,显示CUT&Tag H3K27me3 peaks(第二行),与文献数据对比(第一行)[1]

    产品细节图片5
    图3   表观生物利用CUT&Tag检测H3K27me3的TSS分布热图(左列),与文献数据对比(右列)[1]
     
    案例  Nat Commun:CUT&Tag 高效分析小样本和单细胞的表观基因组学[1]
    本研究对比了ChIP-seq、CUT&RUN、CUT&Tag三种方法检测多种组蛋白修饰、RNAPII、转录因子、染色质开放性的效果。通过相同的数据量(8M Reads)进行比较分析发现,三种方法检测结果基本一致,但是ChIP-seq需要更高的测序深度才能达到去背景噪音的效果,而CUT&Tag有最低的背景噪声和最强的信号。
     
    产品细节图片6
    图1  三种方法检测H3K4me1修饰,CUT&Tag检测灵敏且信噪比高

    产品细节图片7
    图2  三种方法检测H3K4me1修饰的重复性相关矩阵,显示CUT&Tag的重复性较好。

    产品细节图片8
    图3. 三种方法检测转录因子CTCF的读数,CUT&Tag结果出色。

     

    产品细节图片9   新品限时优惠!

    从即日起至2020年3月31日
    CUT&Tag技术服务测三送一!

    CUT&Tag服务可免费提供以下ChIP级抗体:

    H3K4me1,H3K4me3,H3K27me3,H3K27ac,H3K9me3,CTCF,Brd4。

     

     

     

     

     

     

     

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    图标文献和实验
    该产品被引用文献

     [1] Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930.

    相关实验
    • 重磅 | CUT and Tag 成功应用于植物领域!

      and attenuates host antitumor immunity[J]. Nature Immunology, 2020: 1-11. 【3】 Tao X, Feng S, Zhao T, et al. Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton using CUT&Tag[J]. Plant Methods, 2020, 16(1): 1-15. 文章图文来源:诺唯赞生物

    • 干货 | 蛋白质-DNA 互作研究那些你不知道的技术更迭!

      , T. D., Henikoff, J. G., ... & Henikoff, S. (2019). CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature communications, 10(1), 1930. [5] Wang, Q., Xioong, H., Ai, S., Yu, X., Liu, Y., Zhang, J., & He, A. (2019

    • PRODUCTION OF COMPLETELY ES CELL-DERIVED FETUSES BY AGGREGATION WITH TETRAPLOID

      of aggregation plate Materials:       Dissecting microscope;       Sterile tissue culture dishes (Easy Grip 35 x 10 mm, Falcon 3001-3);       1 ml syringe with 26 G 1/2 needle of KSOM medium;       light mineral oil (EMBRYO TESTED) (e.g. Sigma: M8410);       

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