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- CUT&Tag
- 全国
- 2025年09月02日
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
杭州开泰生物
- 服务名称：
CUT&Tag
CUT&Tag—DNA-蛋白质相互作用研究技术
- CUT&Tag技术是一种研究蛋白质-DNA互作的新方法。该技术使用磁珠吸附活细胞，洋地黄皂苷打开细胞膜的通透性；pA-Tn5转座酶在抗体引导下精确结合靶蛋白附近的DNA序列，由于Tn5连有测序接头，可以直接在片段化的 DNA 两端添加接头，最终通过PCR扩增获得完整的文库。
CUT&Tag建库原理图
应用方向
1、DNA组蛋白修饰研究（组蛋白甲基化、乙酰化及新组蛋白修饰：乳酸化、磷酸化等）；2、DNA-转录因子互作研究（探究转录因子结合位点的分布规律、转录因子之间的合作规则；基因转录调控的具体机制）；
3、增强子/超级增强子分析（鉴定超级增强子、结合转录组测序结果确定所调控的靶基因）；
4、组学验证手段（通过其他组学找到潜在结合的转录因子或是组蛋白修饰后进行验证）；
信息分析
CUT&Tag测序项目，通过对获得的高质量reads，进行Peak calling及motif分析，高效预测相关基因， 进行功能富集分析、预测特异蛋白的功能，组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰。| 分析内容 | 解决问题 |
|---|---|
| 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据，保证数据质量 |
| 参考序列比对分析 | 唯一比对的 reads 分布统计 |
| peak calling | 定位组蛋白修饰/转录因子结合位点 |
| peak注释 | 鉴定目标组蛋白修饰/转录因子潜在调控的靶基因 |
| 差异 peak 分析 | 分析DNA-蛋白互作在不同处理条件下的差异 |
| 相关基因功能分析 | Peak/差异 peak 相关基因 GO、KEGG 富集分析 |
| motif 分析 | 目的转录因子结合的Motif序列 （转录因子对应的已知Motif & 转录因子对应的新的Motif） |
关联分析
| CUT&Tag与RNA-seq关联分析 |
1. 整体层面的关联 |
|---|---|
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1.1 整体信号分布展示 |
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1.2 不同表达⽔平基因的CUT&Tag 信号分布展示 |
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1.3 所有基因的CUT&Tag 信号热图 |
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1.4 所有基因启动子区域CUT&Tag信号与基因表达量关联密度散点图 |
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| 2.差异表达基因对应表观信号分布 | |
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2.1 差异表达基因的CUT&Tag 信号 |
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2.2 差异表达基因的RNA-seq和CUT&Tag 信号热图 |
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2.3 差异表达基因上的CUT&Tag 信号累计分布图 |
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| 3.差异峰区域相关的基因表达变化情况 | |
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3.1 CUT&Tag 信号变化与表达变化的热图 |
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3.2 差异峰相关基因的FPKM累计分布图 |
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| 4. 差异峰区域与差异表达基因的关联 | |
| 4.1 CUT&Tag 和RNA-seq的四象限图 | |
| 4.2 差异峰基因和差异表达基因的韦恩图 | |
| 4.3 GO富集分析 | |
| 4.4 KEGG富集分析 |
送样建议
| 样本类型 | 样本状态 | 送样建议 |
|---|---|---|
| 细胞样本 | 冻存 | 每份≥40万，冻存前活性＞90%，建议送备份 |
| 新鲜 | 每份≥20万，冻存前活性＞80%，建议送备份 | |
| 动物组织 | 新鲜/冻存 | 常见组织≥40 mg 心、肾、神经等组织≥50mg |
| 植物组织 | 新鲜/冻存 | 幼嫩组织叶片≥0.3g 种子、根等组织0.5～1g |
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一抗建议：
请选择ChIP级别的一抗，提供未稀释的一抗原液。送样前请联系销售提供一抗的说明书，以方便后续项目进行。具体的送样要求请详询各地区销售技术人员。
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文献和实验1. CUT&Tag 适用于什么物种？如果需要做植物 CUT&Tag ，需要怎么操作？ CUT&Tag 适用于哺乳动物细胞的蛋白-DNA 互作研究，酵母、植物等细胞需要经过(破除细胞壁或者提取细胞核)来进行实验。CUT&Tag 在哺乳动物细胞系上的应用比较成熟，动物组织经过处理得到悬浮单个细胞同样可以进行实验。植物进行 CUT&Tag 操作可以参照 Low-input chromatin profiling in Arabidopsis
and attenuates host antitumor immunity[J]. Nature Immunology, 2020: 1-11. 【3】 Tao X, Feng S, Zhao T, et al. Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton using CUT&Tag[J]. Plant Methods, 2020, 16(1): 1-15. 文章图文来源：诺唯赞生物
干货 | CUT and Tag 让 ChIP-Seq更简单高效！
CUT&Tag 技术原理及应用 CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是替换传统的 ChIP-Seq 用以研究蛋白质-基因组互作的新技术，与后者相比，它具有信噪比高、可重复性好、实验周期短（1 天实现从细胞到文库构建）、细胞投入量低等显著优势，尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。 图 1. CUT&Tag 实验原理 CUT
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