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吉凯基因
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每样
TMT是Thermo Fisher Scientific 开发的一种多肽体外标记技术。
通过对不同样品中的肽段采用不同通道的TMT 试剂进行标记,然后进行LC-MS/MS 分析,
通过TMT 标记信号的强度值实现样本蛋白组之间的相对定量。
2.服务内容:蛋白质组学研究全流程,包括蛋白质抽提、酶切、标记、质谱分析、数据库比对、生物信息学分析以及多层次的质量控制。实现不同样本中蛋白质组表达水平的比较。
3.适用范围:细胞、组织、胶、血清血浆、体液、亚细胞结构、FFPE等。
4.服务流程:蛋白质抽提、酶切、标记、质谱分析、数据库比对、生物信息学分析以及多层次的质量控制。
上海吉凯基因医学科技股份有限公司
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文献和实验本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括:(1)以MS数据为例,系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。(2)介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。(3)以免疫沉淀(IP)数据为例,展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。(4)以数据为例,展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。
共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白组学分析、SILAC/Dimethyl标记定量蛋白组分析、SWATH定量蛋白组学、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白组学分析。下面介绍两种比较常见的定量蛋白质组学技术。 iTRAQ定量蛋白质组学分析 iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation) 技术是由美国应用生物系统公司ABI研发的一种多肽体外标记技术。该技术采用4种或8种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,而后进
基于MS强度或计数的数据依赖法非标记定量蛋白质组学的蛋白质互作分析(一)
本期要介绍到的是基于MS强度或计数的数据依赖法非标记定量蛋白质组学的蛋白质互作分析。 在试验中使用不同的同位素标记(某些情况下等压标记)是一种行之有效的肽和蛋白质定量方法。通常,分析之前,标记样品和未标记样品是混合在一起的,这时可以通过测量相应的峰值强度来直接确定化合物比率。标记大致可以分成这些共价附着在肽上的标记,包括同位素编码的亲和标签、ICAT或iTRAQ、通过酶反应合成(例如通过胰蛋白酶合成18O)或通过代谢合成(例如在细胞培养中用氨基酸标记稳定同位素)、SILAC等。在蛋白质互作
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