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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
大量
- 英文名:
FS Mix Direct for tissue
- 保质期:
-20℃保存2年
- 供应商:
上海泽叶生物科技有限公司
- 保存条件:
-20℃
- 规格:
盒
产品简介
FS™ Mix Direct for Tissue是适合组织样本扩增的2×浓缩快速高效PCR预混合溶液,含有FS™ Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、缓冲液等PCR扩增必需组分(模板与引物除外)。使用时,仅需在扩增体系中加入简单处理后的样本处理液和引物即可进行PCR,从而可以极大地简化操作过程,缩短操作时间,降低污染(加样次数减少)。FS™ Mix Direct for Tissue的反应体系经过优化处理,高灵敏度的FS™ Taq DNA聚合酶确保处理液中的微量样本得到高效扩增。本产品不用进行繁琐的DNA提取,最大限度减少实验误差和交叉污染;同时依靠特殊的缓冲体系增强PCR扩增的特异性,保证扩增效果与DNA模板扩增效果同样可靠。
FS™ Taq DNA聚合酶是根据蛋白工程原理,以Taq DNA聚合酶为基础,研发设计的新一代DNA聚合酶。本产品具有类似KOD酶的快速扩增能力,延伸速度为20s/kb(70~75℃,简单模板可达5s/kb)。是普通Taq DNA聚合酶的3倍,可缩短一半以上的扩增时间;同时具备Taq DNA聚合酶扩增效率高、适应性广等优点。FS™ Taq DNA聚合酶使用方法与普通Taq DNA聚合酶基本相同,只需注意适当缩短延伸时间。该酶具有5'→3'聚合酶活性,无3'→5'外切酶活性。扩增产物具有3'-dA突出端,可直接用于TA克隆。
产品组成
| Component |
ZY2071b |
ZY2072b |
| 2× FS™ Mix Direct for Tissue |
1 ml |
1 ml× 5 |
| 超纯水 |
1 ml |
1 ml× 5 |
| Neutralization Solution |
1 ml |
5 ml |
| Extraction Solution |
10 ml |
40 ml |
本产品分体系中包含溴酚蓝、不含溴酚蓝两类。体系中包含溴酚蓝的产品,PCR扩增产物可直接电泳检测。这两类产品的扩增性能无差异。如无特别说明提供体系中包含溴酚蓝的包装。
保存条件
-20℃保存2年。
质量控制
纯度检测:经质量检测,产品不含脱氧核糖核酸内切酶、脱氧核糖核酸外切酶和核糖核酸酶污染。
功能检测:PCR方法检测无宿主残余DNA,能有效扩增人基因组中的单拷贝基因。
应用举例
1. 处理样品
组织:取3-5mg组织置于1.5ml离心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分涡旋振荡,95℃温浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分涡旋振荡,5,000rpm离心2min,取0.5-2 μl上清进行扩增。
头发:取两根带毛囊的头发,剪下带毛囊的发根放入1.5ml离心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分涡旋振荡,95℃温浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分涡旋振荡,5000rpm离心2min,取0.5-2 μl上清进行扩增。
口腔拭子:取样前30min内请勿进食及饮水,使用无菌棉签在口腔内擦拭10次。将棉球剪下置于1.5ml离心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分涡旋振荡,95℃温浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分涡旋振荡,5,000rpm离心2min,取0.5-2 μl上清进行扩增。
培养细胞:如果是悬浮培养细胞直接取1×103-104当量的细胞加入到50 μl PCR反应体系中即可。如果是贴壁培养细胞,取3-5mg细胞组织置于1.5ml离心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分涡旋振荡,95℃温浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分涡旋振荡,5,000rpm离心2min,取0.5-2 μl上清进行扩增。
血液、淋巴液DNA病毒:取100 μl血清或淋巴液至1.5ml离心管中,加入180 μl Extraction Solution,充分涡旋振荡,95℃温浴10min。加入20 μl Neutralization Solution,充分涡旋振荡,12,000rpm离心10min,取0.5-2 μl上清进行扩增。
2. 配制反应体系
请于冰上配置反应体系,体系大小与组分用量与添加顺序可调整:
| Ordinal |
Component |
Volume (50 μl reaction volume) |
Final concentration (50 μl reaction volume) |
| 1 |
2× FS™ Mix Direct for Tissue |
25 μl |
1× |
| 2 |
upstream primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 μM |
| 3 |
downstream primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 μM |
| 4 |
处理液上清 |
0.5-2 μl |
<1μg |
| 5 |
超纯水[2] |
To 50 μl |
- |
| optional |
MgCl2(MgSO4)/PCR Enhancer[3] |
Variable |
- |
[1] 引物终浓度建议范围:0.1-1 μM。特异性差时可降低浓度,效率低时可提高浓度。
[2] 可单独订购超纯水。
[3] 可单独订购25mM MgCl2和PCR Enhancer。
3. 设定反应程序进行PCR反应
大多数模板的快速扩增条件:
| Stage |
Temperature |
Time |
Number of Cycles |
| Initial Denaturation |
94℃ |
3 min |
1 |
| Denaturation |
94℃ |
30 sec |
28-40 |
| Annealing |
55-68℃[1] |
30 sec |
|
| Extension |
72℃ |
Variable[2] |
|
| Final Extension |
72℃ |
2 min |
1 |
[1] 退火温度应根据Tm值较低的引物来设。
[2] 延伸时间按20 sec/kb来设最佳。
1kb简单模板的快速扩增条件:
由于1kb简单模板的二级结构简单,且长度较短,可同时缩短变性、退火时间至15s,延伸时间20s,以实现快速扩增。
4. 分析结果
反应产物可直接进行琼脂糖凝胶电泳,通过凝胶成像设备观察目的条带的扩增情况。如有需要,可进行割胶回收。无产物或产物量少的改进措施有:1调整退火温度;2减少抑制剂的影响,如提取的基因组DNA中含有抑制扩增的成分,需要高倍稀释(1: 10000)后使用;3采用乙醇沉降洗脱,提高模板DNA的纯度;4使用PCR添加剂,如PCR Enhancer、MgCl2等可提高产量。
操作注意事项
处理的组织样本往往不会完全溶解,这是正常现象。溶解在处理液中的组织样本足够满足FS™ Mix Direct for Tissue扩增的需要。
室温下FS™ Taq DNA聚合酶有一定的活性,为避免发生非特异性扩增,请于冰上配置反应体系,并且最后添加模板DNA。
延伸时间视片段长度而定。一般情况,≤500bp目的片段延伸15s,500bp-1kb延伸20s,>1kb延伸时间按20s/kb计算。
FS™ Taq DNA聚合酶具有脱氧核苷酸转移酶活性,因此在PCR产物3’末端通常会加上一个多余的脱氧腺嘌呤核苷,可进行TA克隆。
FS™ Mix Direct for Tissue也可采用常规程序扩增。
引物设计注意事项
引物长度一般在15-30个碱基之间;上下游引物3’末端避免互补,避免出现3个以上重复的G或C,或出现发夹结构,否则会产生非特异性扩增;GC含量控制在40-60%,且上下游引物GC含量尽量接近;Tm值控制在55-65℃之间,且上下游引物Tm值尽量接近,额外附加序列(酶切位点、修饰等)是非模板匹配序列,不参与Tm值计算。
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文献和实验Direct tissue explant method for derivation and study of extravillous trophoblas
can be stimulated to assume a migratory phenotype by growth factors. TGFb1 inhibits outgrowth.Explant culture of first trimester placental tissue for de novo generation of extravillous trophoblastThe protocols described include explant on either collagen
Direct tissue explant method for derivation and study of extravillous trophoblast
columns. The resulting cells can be stimulated to assume a migratory phenotype by growth factors. TGFb1 inhibits outgrowth. Explant culture of first trimester placental tissue for de novo generation of extravillous trophoblast The protocols
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