菌种鉴定

 服务要求：

   1. 请提供基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。

   2. 基因组DNA的浓度≥10 ng/μl，总体积≥20 μl，且无明显降解；平板或斜面应长有分离的单菌落。

   3. 由于革兰氏阳性细菌或厌氧菌、放线菌等特殊菌株，请在服务委托书中加以说明。

   4. 如果测序结果出现如下套峰，视为样品不纯，本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。

 

服务基本流程：

   1. 进行引物设计合成；

   2. PCR扩增16S rDNA；

   3. PCR产物纯化；

   4. 测序，序列比对分析。

 

服务报告内容：

      实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图、以及剩余模板（可保存1个月）；

16S rDAN是编码原核生物核糖体小亚基rRNA（16S rRNA）的基因。 长度约为1500pb，是细菌分类学研究中最常用、最有用的"分子钟16S rRNA其大小在1,500 bp左右，所代表的信息量适中，因此是进行分类研究的理想材料。利用16S rDNA两端的引物PCR扩增未知菌株的16S rRNA基因，并进行DNA测序，与GenBank中的已知序列进行同源性比较后，判定细菌种类，将细菌划分到属或种

 

服务价格：

服务项目	说明	价格	周期
细菌16S rDNA菌种鉴定	16S rDNA全序列比对分析	400/样品	2周
细菌16S rDNA菌种鉴定	16S rDNA全序列扩增，克隆测序，比对分析	1000元/样品	2周

*价格不含DNA提取费用，如果样品多或者特殊，时间协商。

 

真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定

传统的真菌分类鉴定主要是按照真菌的形态、生长以及生理生化等特征对真菌进行分类。然而真菌的种类繁多，个体多态性明显，而且其生长、生理生化特征也会随着环境的变化而不稳定。因此，采用传统的方法对真菌进行正确的分类存在较大的困难。随着分子生物学技术的发展，核酸序列分析已被广泛的应用于真菌分类鉴定中，目前常用的技术包括18S rDNA、ITS（Internal Transcribed Spacer，ITS）及18S rDNA-ITS序列分析技术。

       18S rDNA是编码真核生物核糖体小亚基rRNA（18S rRNA）的DNA序列，序列中既有保守区又有可变区，保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系，而高变序列区域则能体现物种间的差异。由于18S rDNA在进化速率上比较保守，因此在系统发育研究中较适用于种级以上阶元的分类。内转录间隔区ITS位于核糖体rDNA 18S、5.8S及28S之间，由于不需要加入成熟核糖体，因此在进化过程中能够承受更多的变异，其进化速率为18S rDNA的10倍，属于中度保守的区域，利用它可研究种及种以下的分类阶元。另外，也可通过选择引物同时扩增18 S rDNA和ITS，通过分析18 S rDNA序列，先在较高级别上确定样品的归属，然后根据ITS 序列，将真菌归类到种或亚种水平

 

服务要求：

   1. 请提供基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。

   2. 基因组DNA的浓度≥100 ng/μl，总体积≥20 μl，且无明显降解；平板或斜面应长有分离的单菌落。

   3. 如果测序结果出现如下套峰，视为样品不纯，本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。

 

服务基本流程：

   1. 进行引物设计合成；

   2. PCR扩增18S rDNA/ITS；

   3. PCR产物纯化；

   4. 测序，序列比对分析。

服务报告内容：

   实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图、以及剩余模板（可保存1个月）

服务价格：

服务项目	说明	价格	周期
真菌18S rDNA菌种鉴定	18S rDNA全序列扩增，PCR产物测序，比对分析	450元/样品	2-3周
真菌18S rDNA菌种鉴定	18S rDNA全序列扩增，克隆测序，比对分析	1100元/样品	2-3周
真菌18S rDNA文库构建及真菌群落多样性分析	18S rDNA文库构建，RFLP等	咨询	30工作日
真菌ITS菌种鉴定	真菌ITS1，ITS4，ITS5全ITS序列扩增，PCR测序鉴定	450元/样品	2-3周
真菌ITS菌种鉴定	真菌ITS1，ITS4，ITS5全ITS序列扩增，连接T载体测序鉴定	1100元/样品	2-3周

 价格不含DNA提取费用，如果样品多或者特殊，时间协商.

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