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- 详细信息
- 技术资料
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 库存:
459
- 英文名:
Mycoplasma PCR Detection Kit
- 规格:
20μL×250次
特别提示:包括支原体检测试剂盒(巢式PCR法)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:支原体检测试剂盒(巢式PCR法)
英文名称:Mycoplasma PCR Detection Kit
产品货号:YT986
产品规格:20μL×250次
本试剂盒利用两对引物通过巢式PCR法特异性扩增支原体基因组DNA片段,从而实现对支原体的高灵敏度特异性检测的。原核生物的rRNA碱基序列非常保守,而rRNA操纵子上编码rRNA的DNA间隔区(space region)在各种生物种间的碱基序列差别很大,如16S和23S之间的间隔区。这个间隔区的DNA序列及长度在支原体各个种属间既有非常保守的部分,也有较大差异的部分。在编码16S和23S的保守区DNA上设计一对F1/R1引物,用于扩增16S和23S之间的间隔区,这就是巢式PCR的第一轮PCR(1st PCR),用于初步鉴定是否有支原体污染;然后在编码16S和23S rRNA的DNA间隔区的保守区上设计一条F2引物,在编码23S rRNA的DNA上设计一条R2引物进行巢式PCR的第二轮PCR(2nd PCR)。通过巢式PCR可以大大提高检测的特异性和灵敏度。本产品的检测原理请参考图1。
图1.支原体检测试剂盒(巢式PCR法)的检测原理图。
试剂盒可快速、有效、高灵敏度地检测支原体污染。
本试剂盒提供了阳性对照Control template,便于确定PCR检测是否能正常工作,及样品中是否存在抑制PCR反应的物质。
如果发现有支原体污染,建议更换无污染的细胞进行培养。如果有必要预防或去除支原体,可以使用专用的支原体预防或去除试剂
试剂盒组成:
| 组分 | 规格 |
| 1st PCR Primer Mix(50X) | 100μL |
| 2nd PCR Primer Mix(50X) | 100μL |
| Control template | 100μL |
保存条件:-20℃保存。
注意事项:
1.由于PCR反应非常灵敏,可以扩增目的基因序列超过1000万倍,在使用Taq酶时请注意避免微量待扩增DNA的污染,并尽量考虑设置不加模板的空白对照以确认是否有待扩增DNA的污染。
2.一般情况,1st PCR可以初步鉴定是否有支原体污染,但建议进行2nd PCR以进一步确认。
3.本试剂盒不能检测出人肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae)。
4.本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
5.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用说明:
1.实验前的准备工作:
a.需要用户自己准备的器材
(a)PCR扩增仪。
(b)琼脂糖凝胶电泳装置。
(c)微量离心机。
(d)无菌PCR管、离心管、枪头及移液枪。
b.试剂和检测样品准备
(a)双蒸水或超纯水。
(b)2×PCR Master Mix(货号:YT378)、2×PCR Master Mix(含染料)(货号:YT382/YT383/YT384)或者其它Taq酶及PCR所需的dNTP等。
(c)琼脂糖凝胶、电泳缓冲液、DNA分子量标准、电泳染料。
(d)样品:用于检测支原体污染的样品是细胞接种后培养了3-6天的培养上清液,或者是培养液、血清;如果使用细胞悬液做样品,则需要提取DNA后再进行PCR。加入量一般为反应体系1/10的量或更少。
2.1st PCR反应:
a.融解并混匀PCR反应所需的各种溶液。将2×PCR Master Mix,例如2×PCR Master Mix(YT383)置于冰浴上或冰盒内。参考下表在冰浴上设置PCR反应:
| 试剂 | 终浓度 | 20μL体系 | 50μL体系 |
| 双蒸水或超纯水 | - | 7.6-9.2μl | 19-23μl |
| 检测样品(DNA)或Control template | 0.2pg/μl -20ng/μl | 0.4-2μl | 1-5μl |
| 1st PCR Primer Mix(50X) | 1X | 0.4μl | 1μl |
| 2×PCR Master Mix(YT383) | 1X | 10μl | 25μl |
| 总体积 | - | 20μl | 50μl |
注:Control template的推荐用量为1μl。
b.PCR反应参数的设置可以参考如下示例:
STEP1(起始变性):94℃ 30sec
STEP2(变性):94℃ 30sec
STEP3(退火):55℃ 2min
STEP4(延伸):72℃ 1min
STEP5(循环):Go To STEP2 for 30-35 cycles
STEP6(最终延伸):72℃ 5min
STEP7(临时保存):4℃ forever
3.2nd PCR反应:
a.参考下表在冰浴上设置PCR反应:
| 试剂 | 终浓度 | 20μL体系 | 50μL体系 |
| 双蒸水或超纯水 | - | 9.4μl | 23.5μl |
| 1st PCR产物 | 0.2pg/μl -20ng/μl | 0.2μl | 0.5μl |
| 2nd PCR Primer Mix(50X) | 1X | 0.4μl | 1μl |
| 2×PCR Master Mix(YT383) | 1X | 10μl | 25μl |
| 总体积 | - | 20μl | 50μl |
b.PCR反应参数的设置可以参考如下示例:
STEP1(起始变性):94℃30sec
STEP2(变性):94℃30sec
STEP3(退火):55℃2min
STEP4(延伸):72℃1min
STEP5(循环):Go To STEP2 for 30 cycles
STEP6(最终延伸):72℃5min
STEP7(临时保存):4℃forever
4.扩增产物的电泳分析:
a.反应结束后,取1st PCR及2nd PCR的反应产物各10μl,进行电泳确认扩增有无片段及片段大小。琼脂糖凝胶电泳结果示意图请参考图2。如果实验目的只是确定是否有支原体污染,1-2%的琼脂糖凝胶电泳均可;如果需要确定片段大小并据此大致推测污染支原体的种类,优先推荐使用2%的琼脂糖凝胶电泳。
图2.使用本支原体PCR检测试剂盒进行PCR检测时扩增产物的琼脂糖凝胶电泳示意图。1、2、3是1st PCR产物;1#、2#、3#是相应的2nd PCR产物。各泳道的模板分别是:1和1#,Control template;2和2#,支原体污染的细胞上清;3和3#,超纯水。M为DNA
b.以不同种属的支原体为模板,1st PCR及2nd PCR的反应产物的条带大小不同,具体扩增片段大小可参考下表。
本试剂盒确定可以扩增的支原体种类及1st PCR和2nd PCR扩增产物长度参考表:
| 种属 | GenBank编号 | 1st PCR(bp) | 2nd PCR(bp) |
| Mycoplasma arginini | JN935883 | 370 | 145 |
| Mycoplasma arthritidis | AY973560 | 408 | 157 |
| Mycoplasma capricolum | AY800346 | 415 | 221 |
| Mycoplasma fermentans | AY816338 | 492 | 195 |
| Mycoplasma hominis | AY738737 | 370 | 148 |
| Mycoplasma hyopneumoniae | JN935889 | 682 | 238 |
| Mycoplasma hyorhinis | AY973572 | 452 | 211 |
| Mycoplasma neurolyticum | AY796063 | 502 | 196 |
| Mycoplasma orale | AY737010 | 424 | 179 |
| Mycoplasma pulmonis | JN935865 | 477 | 190 |
| Mycoplasma salivarium | AY786574 | 403 | 151 |
| Ureaplasma urealyticum | AY741673 | 482 | 154 |
注:本试剂盒主要用于检测是否有支原体污染,但也可以通过1st PCR和2nd PCR扩增产物长度大致预测所污染的支原体种属。如果有必要,也可以对PCR产物进行常规测序以确定具体的支原体种属。
5.关于阳性对照反应:
a.一方面阳性对照Control template可以单独使用,以确定PCR反应体系是否能正常工作。另一方面,阳性对照Control template也可以添加到样品中,以确定样品中是否含有抑制PCR反应的物质。Control template是人工合成的DNA片段,使用Control template时,1st PCR的反应产物是810bp,2nd PCR的反应产物是590bp。
b.如果阳性对照Control template单独使用时没有获得扩增片段,提示PCR检测体系存在问题,需要考虑更换PCR反应相关试剂。
c.如果阳性对照Control template单独使用时获得了预期的扩增片段,而阳性对照Control template添加到样品一起进行PCR扩增反应时没有获得任何PCR扩增产物,提示PCR体系工作正常,但检测样品中存在抑制PCR反应的物质。此时建议将检测样品进行DNA抽提,再用提取的DNA作为模板进行扩增。也可以尝试将样品用超纯水或PBS适当稀释后再进行测试,此时如果样品中支原体的污染程度比较高,基本上不会影响检测,但如果样品中支原体的污染程度比较低,很可能会导致检测灵敏度显著下降。
d.如果阳性对照Control template单独使用时获得了预期的扩增片段,而阳性对照Control template添加到样品一起进行PCR扩增反应时可能仅获得支原体的PCR扩增产物或仅获得阳性对照Control template的扩增产物,也可能同时获得支原体和阳性对照Control template的扩增产物。其中一种模板量比较多时,通常更容易扩增获得哪种模板的PCR扩增产物。其中一种模板特别多时,另外一种模板可能检测不到明显的扩增。
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