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pBeloBAC11

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  • LSM Bio
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  • PVT10574
  • 2025年09月20日
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      pBeloBAC11

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      LSMBIO

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      2ug

    pBeloBAC11

    PVT10574    2ug

     

    pBeloBAC11  Information

    Replicon: OriS

    Plasmid size: 7507bp

    Prokaryotic resistance: chloramphenicol Chl

    Clone strain: Escherichia coli DH5 alpha

    Culture conditions: 37 C, aerobic, LB

    Remarks: bacterial artificial chromosome BAC plasmid

     

    pBeloBAC11 Description

    Bacterial artificial chromosome锛孊AC is a kind of bacterial chromosome cloning vector constructed on the basis of F-plasmid, named pBACs. Its capacity is between 50-300 kb. All kinds of pBACs are single-copy in E. coli.

    BAC is a synthetic carrier based on the F factor of Escherichia coli. Factor F, also known as plasmid F, is a "plasmid" that transfers natural host genes to another host cell. F factor replication in E. coli is strictly controlled and maintained at a low copy, usually 1-2 copies per cell. Its parB gene can reject the exogenous F plasmid in the cell, restrict the rearrangement of plasmids between molecules, and reduce the level of drainage and chimerism of exogenous DNA in the recombinant BAC. In addition, F factor has the potential to carry 1 Mbp insert fragment, which makes it possible to construct a large-capacity cloning BAC vector.

    BAC carriers mainly include oriS, repE (control F plasmid replication) and parA, parB (control copy number) and other components. BAC-based vectors have been widely accepted by the scientific community for their low frequency of chimerism, high conversion efficiency, and circular structure in bacteria, which is easy to isolate and purify. At present, it is mainly used in the construction of large fragment genomic library and the study of large gene cluster, and plays an important role in various biological genome projects.

     

    pBeloBAC11 Sequence

    LOCUS       Exported                7507 bp ds-DNA     circular SYN 19-MAY-2017
    DEFINITION  Single-copy E. coli plasmid vector designed for constructing 
                Bacterial Artificial Chromosomes (BACs).
    ACCESSION   U51113
    VERSION     .
    KEYWORDS    pBeloBAC11
    SOURCE      synthetic DNA construct
      ORGANISM  synthetic DNA construct
    REFERENCE   1  (bases 1 to 7507)
      AUTHORS   New England Biolabs
      TITLE     Direct Submission
              
    FEATURES             Location/Qualifiers
         source          1..7507
                         /organism="synthetic DNA construct"
                         /lab_host="Escherichia coli"
                         /mol_type="other DNA"
         CDS             complement(56..436)
                         /codon_start=1
                         /gene="lacZ (fragment)"
                         /product="LacZ-alpha fragment of beta-galactosidase"
                         /note="lacZ-alpha"
                         /translation="MTMITPSYLGDTIEYSSLHACRSTLEDPRVPSSNSPYSESYYNSL
                         AVVLQRRDWENPGVTQLNRLAAHPPFASWRNSEEARTDRPSQQLRSLNGEWRLMRYFLL
                         THLCGISHRIWCTLSTICSDAA"
         primer_bind     289..305
                         /note="M13 fwd"
                         /note="common sequencing primer, one of multiple similar 
                         variants"
         promoter        312..330
                         /note="T7 promoter"
                         /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase"
         misc_feature    333..389
                         /note="MCS"
                         /note="pUC18/19 multiple cloning site"
         promoter        complement(396..414)
                         /note="SP6 promoter"
                         /note="promoter for bacteriophage SP6 RNA polymerase"
         primer_bind     complement(432..448)
                         /note="M13 rev"
                         /note="common sequencing primer, one of multiple similar 
                         variants"
         protein_bind    456..472
                         /bound_moiety="lac repressor encoded by lacI"
                         /note="lac operator"
                         /note="The lac repressor binds to the lac operator to 
                         inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be 
                         relieved by adding lactose or 
                         isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside (IPTG)."
         promoter        complement(480..510)
                         /note="lac promoter"
                         /note="promoter for the E. coli lac operon"
         CDS             complement(766..1425)
                         /codon_start=1
                         /gene="cat"
                         /product="chloramphenicol acetyltransferase"
                         /note="CmR"
                         /note="confers resistance to chloramphenicol"
                         /translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL
                         KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS
                         LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM
                         DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQGGA"
         promoter        complement(1426..1528)
                         /note="cat promoter"
                         /note="promoter of the E. coli cat gene"
         rep_origin      2455..2674
                         /note="ori2"
                         /note="secondary origin of replication for the bacterial F 
                         plasmid; also known as oriS"
         CDS             2765..3520
                         /codon_start=1
                         /gene="repE"
                         /product="replication initiation protein for the bacterial 
                         F plasmid"
                         /note="repE"
                         /translation="MAETAVINHKKRKNSPRIVQSNDLTEAAYSLSRDQKRMLYLFVDQ
                         IRKSDGTLQEHDGICEIHVAKYAEIFGLTSAEASKDIRQALKSFAGKEVVFYRPEEDAG
                         DEKGYESFPWFIKRAHSPSRGLYSVHINPYLIPFFIGLQNRFTQFRLSETKEITNPYAM
                         RLYESLCQYRKPDGSGIVSLKIDWIIERYQLPQSYQRMPDFRRRFLQVCVNEINSRTPM
                         RLSYIEKKKGRQTTHIVFSFRDITSMTTG"
         misc_feature    3523..3773
                         /gene="incC"
                         /note="incC"
                         /note="incompatibility region of the bacterial F plasmid"
         CDS             4099..5274
                         /codon_start=1
                         /gene="sopA"
                         /product="partitioning protein for the bacterial F plasmid"
                         /note="sopA"
                         /translation="MFRMKLMETLNQCINAGHEMTKAIAIAQFNDDSPEARKITRRWRI
                         GEAADLVGVSSQAIRDAEKAGRLPHPDMEIRGRVEQRVGYTIEQINHMRDVFGTRLRRA
                         EDVFPPVIGVAAHKGGVYKTSVSVHLAQDLALKGLRVLLVEGNDPQGTASMYHGWVPDL
                         HIHAEDTLLPFYLGEKDDVTYAIKPTCWPGLDIIPSCLALHRIETELMGKFDEGKLPTD
                         PHLMLRLAIETVAHDYDVIVIDSAPNLGIGTINVVCAADVLIVPTPAELFDYTSALQFF
                         DMLRDLLKNVDLKGFEPDVRILLTKYSNSNGSQSPWMEEQIRDAWGSMVLKNVVRETDE
                         VGKGQIRMRTVFEQAIDQRSSTGAWRNALSIWEPVCNEIFDRLIKPRWEIR"
         CDS             5274..6245
                         /codon_start=1
                         /gene="sopB"
                         /product="partitioning protein for the bacterial F plasmid"
                         /note="sopB"

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