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pYM39-EYFP

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  • PVT4016
  • 2025年09月24日
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    • 英文名：

      pYM39-EYFP

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      100

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      LSMBIO

    • 规格：

      2ug

    pYM39-EYFP

    Search name

    pYM39-EYFP,Plasmid pYM39-EYFP,pYM39-EYFP vector

     

    pYM39-EYFP Multiple cloning site

     

    pYM39-EYFP Information

    Promoter: SP6, TEF, T7

    Replicon: ori

    Terminator: ADH1

    Plasmid classification: yeast series, Pichia pastoris expression vector

    Plasmid size: 4946bp

    Plasmid tagging: EYFP

    Prokaryotic resistance: Amp

    Clonal strain: DH5 alpha

    Culture conditions: 37 C, aerobic LB

    Expression host: yeast cells

    5'sequencing primers: T7:TAATACGACTCACTATAGGG

    Primers for 3'sequencing: primers designed based on sequences

     

     

    pYM39-EYFP Sequence

    LOCUS       Exported                4946 bp ds-DNA     circular SYN 19-SEP-2016
    DEFINITION  synthetic circular DNA
    ACCESSION   .
    VERSION     .
    KEYWORDS    Untitled 10
    SOURCE      synthetic DNA construct
      ORGANISM  synthetic DNA construct
    REFERENCE   1  (bases 1 to 4946)
      AUTHORS   .
      TITLE     Direct Submission
      JOURNAL   Exported Monday, September 19, 2016 from SnapGene Viewer 3.2.1
           
    FEATURES             Location/Qualifiers
         source          1..4946
                         /organism="synthetic DNA construct"
                         /mol_type="other DNA"
         CDS             79..795
                         /codon_start=1
                         /product="enhanced YFP"
                         /note="EYFP"
                         /note="mammalian codon-optimized"
                         /translation="MSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLK
                         FICTTGKLPVPWPTLVTTFGYGVQCFARYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDG
                         NYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKV
                         NFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSYQSALSKDPNEKRDHMVLLE
                         FVTAAGITLGMDELYK"
         CDS             802..828
                         /codon_start=1
                         /product="HA (human influenza hemagglutinin) epitope tag"
                         /note="HA"
                         /translation="YPYDVPDYA"
         terminator      861..1048
                         /gene="S. cerevisiae ADH1"
                         /note="ADH1 terminator"
                         /note="transcription terminator for the S. cerevisiae 
                         alcohol dehydrogenase 1 (ADH1) gene"
         gene            1123..2479
                         /note="kanMX"
                         /note="yeast selectable marker conferring kanamycin 
                         resistance (Wach et al., 1994)"
         promoter        1123..1466
                         /note="TEF promoter"
                         /note="Ashbya gossypii TEF promoter"
         CDS             1467..2276
                         /codon_start=1
                         /gene="aph(3')-Ia"
                         /product="aminoglycoside phosphotransferase"
                         /note="KanR"
                         /note="confers resistance to kanamycin"
                         /translation="MGKEKTHVSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYGKP
                         DAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTA
                         FQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASD
                         FDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIAD
                         RYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF"
         terminator      2282..2479
                         /note="TEF terminator"
                         /note="Ashbya gossypii TEF terminator"
         promoter        complement(2584..2602)
                         /note="T7 promoter"
                         /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase"
         rep_origin      complement(2860..3448)
                         /direction=LEFT
                         /note="ori"
                         /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 
                         replication"
         CDS             complement(3619..4479)
                         /codon_start=1
                         /gene="bla"
                         /product="beta-lactamase"
                         /note="AmpR"
                         /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and
                         related antibiotics"
                         /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI
                         ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS
                         PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW
                         EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA
                         LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS
                         LIKHW"
         promoter        complement(4480..4584)
                         /gene="bla"
                         /note="AmpR promoter"
         promoter        4930..2
                         /note="SP6 promoter"
                         /note="promoter for bacteriophage SP6 RNA polymerase"
    ORIGIN
            1 gaacgcggcc gccagctgaa gcttcgtacg ctgcaggtcg acggatccgg agcaggtgct
           61 ggtgctggtg ctggagcaat gagcaagggc gaggagctgt tcaccggggt ggtgcccatc
          121 ctggtcgagc tggacggcga cgtaaacggc cacaagttca gcgtgtccgg cgagggcgag
          181 ggcgatgcca cctacggcaa gctgaccctg aagttcatct gcaccaccgg caagctgccc
          241 gtgccctggc ccaccctcgt gaccaccttc ggctacggcg tgcagtgctt cgcccgctac
          301 cccgaccaca tgaagcagca cgacttcttc aagtccgcca tgcccgaagg ctacgtccag
          361 gagcgcacca tcttcttcaa ggacgacggc aactacaaga cccgcgccga ggtgaagttc
          421 gagggcgaca ccctggtgaa ccgcatcgag ctgaagggca tcgacttcaa ggaggacggc
          481 aacatcctgg ggcacaagct ggagtacaac tacaacagcc acaacgtcta tatcatggcc
          541 gacaagcaga agaacggcat caaggtgaac ttcaagatcc gccacaacat cgaggacggc
          601 agcgtgcagc tcgccgacca ctaccagcag aacaccccca tcggcgacgg ccccgtgctg
          661 ctgcccgaca accactacct gagctaccag tccgccctga gcaaagaccc caacgagaag
          721 cgcgatcaca tggtcctgct ggagttcgtg accgccgccg ggatcactct cggcatggac
          781 gagctgtaca agtaaggatc ctatccatat gacgttccag attacgctgc tcagtgctag
          841 ggcgcgccac ttctaaataa gcgaatttct tatgatttat gatttttatt attaaataag
          901 ttataaaaaa aataagtgta tacaaatttt aaagtgactc ttaggtttta aaacgaaaat
          961 tcttattctt gagtaactct ttcctgtagg tcaggttgct ttctcaggta tagtatgagg
         1021 tcgctcttat tgaccacacc tctaccggca gatccgctag ggataacagg gtaatataga
         1081 tctgtttagc ttgcctcgtc cccgccgggt cacccggcca gcgacatgga ggcccagaat
         1141 accctccttg acagtcttga cgtgcgcagc tcaggggcat gatgtgactg tcgcccgtac

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