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文献和实验了一线技术支持常被问到的问题,希望这篇纯干货能帮助大家顺利升级打怪,早日驾驭 IP、co-IP。 IP、co-IP、pull-down 简介 IP(Immunoprecipitation),免疫沉淀:是利用固定在磁珠或琼脂糖树脂等基质上的特异性抗体对抗原进行小型亲和纯化的一种方法 Co-IP(co-Immunoprecipitation),免疫共沉淀: co-IP 是一种常用的鉴定蛋白-蛋白相互作用的方法,其基本实验流程和IP类似,通过使用诱饵蛋白(IP 中的抗原,bait protein)特异
免疫复合物的纯化。 2. 将 DynabeadsproteinA 振荡混匀,吸取 100μl 磁珠于 Ep 管中,置于磁铁架(Dynal MPC)上,磁珠吸附到管壁上,弃上清。 3. 加 500μl 0.1M Na-phosphate (pH 8.1 ) 至 Ep 管,轻柔搓动管子约 2~3min,将Ep 管置于磁铁架上,磁珠吸附到管壁上,弃上清。 4. 重复 2 步骤两次。 5. 清洗完磁珠后,加 500μl 预处理后的裂解物,反复摇动管子,室温下反应10~20min。
拖尾的存在,特别是在较低分子量下,表明RNA降解(图 4B)。 一些方案需要核酸样品的片段化,例如在为染色质免疫沉淀(ChIP)和下一代测序(NGS)准备样品输入时 ,以获得适合下一步的片段大小。样品碎裂的效率可以通过凝胶电泳检测(图 4C)。 合成后,由于 图 4.通过凝胶电泳确定样品纯度、完整度和片段化。(A)在分开的凝胶上分析提取的基因组 DNA 和总 RNA。红色箭头分别代表污染 RNA 和基因组 DNA。污染 RNA 仅在电泳运行开始时(≤ 5 分钟)能被检测到。(B)通过 28S 和 18
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