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1
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Transposase
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12个月
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圳华大智造科技有限公司
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文献和实验ATAC-seq利用转座酶研究染色质可接近性数据分析工具全面介绍
Assay of Transposase Accessible Chromatin sequencing(ATAC-seq)即利用转座酶研究染色质可接近性。ATAC-seq 自 2013 年开发以来广泛应用于研究有关染色质的生物学问题。根据 PubMed 上发表 ATAC-seq 有关文章可以看到,文章数量逐年上升,其中 2019 年发表文章数量最多,为 635 篇(图 1)。 图 1 识别和表征开放染色质区域有助于确定基因组调控元件的位置和深入了解转录调控。ATAC-seq 就是 用转座酶
干货 | CUT and Tag 核心酶 Hyperactive PA/PG-Tn5 Transposase 大解密
还可以和某些抗体的 Fab 和 F(ab’)2 段结合。 Tn5转座酶 转座酶是一大类细菌来源的蛋白,通过结合转座子序列末端并催化其转移到基因组上随机位置,实现“剪切-粘贴”或“复制-粘贴”型的 DNA 插入的作用。其中 Tn5 转座子因其转座的随机性好、稳定性高、插入位点容易测序等特点,已经成为分子遗传学及基因诊断学研究的热门工具。 Tn5 转座子是一种细菌转座子,全长约 5.8 kbp ,由编码三个抗生素(新霉素、博莱霉素、链霉素)的核心序列和两条倒置的 IS50 序列组成
for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing)是利用转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术,通俗来说就是基于染色质可及性的特点,将携带测序信息的Tn5转座酶插入染色质中,由于转座酶只能剪切染色质开放区域并标记DNA序列,再进行高通量测序就能获得相关基因信息。 什么是染色质可及性? 正常情况下,DNA与核小体缠绕折叠在一起形成染色质,但是DNA的复制、转录都需要将染色体的高级结构解开,然而解压并不需要打开全部染色体,只需要打开
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