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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
404
- 英文名:
DNAgreen, PCR Grade
- 保质期:
一年
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
常温运输、-20℃
- 规格:
0.1mL
特别提示:包括PCR级绿如蓝DNA染料在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:PCR级绿如蓝DNA染料
英文名称:DNAgreen, PCR Grade
产品货号:BTN70909
产品规格:0.1mL
第二代的非饱和型荧光染料(如SYBR Green I)在高浓度下会抑制荧光PCR,所以反应重复性很不稳定,并且不能用于要求严格的Tm分析。本产品跟SYTO9、LC Green、EvaGreen一样,是第三代饱和型荧光染料,在饱和浓度下也不抑制荧光PCR反应。
产品特点:
1. 饱和浓度不抑制PCR反应,因此得到的荧光信号更强。
2. 抗水解、抗热解和抗光解的能力强于目前最常用的SYBR Green I。
3. 饱和浓度下染料分子没有机会在DNA分子间发生移位,因此荧光强度跟DNA变性程度呈线性关系,可以用于精细的Tm 测定实验,如High-resolution melting curve analysis等。
4.跟目前常用的PCR 仪器(包括iCycler、LightCycler、ABI 测序仪)兼容。激发和发射光谱跟FAM和SYBR Green I 接近,可以使用SYBR Green I的光学设置参数。
5. 不能渗透进入细胞内,毒性和致突变性远低于SYBR Green I。
6.可以用于qPCR、高分辨DNA 溶解曲线分析(HRM、high-resolution DNA melt curve analysis)、毛细管电泳等研究。
储存条件:常温运输、-20℃避光保存,有效期一年。
使用方法:
先将本产品放置在室温融化,然后震荡10秒钟,短暂离心后待用。下面以50μL的标准PCR反应体系为例说明其使用:
1.在一干净的PCR 管中,加入下列成分:
| 试剂 | 加入量 |
| 10×PCR Buffer(No Mg2+) | 5μl |
| MgCl2 50mM | 2.5μl |
| dNTP 10mM | 1μl |
| 本产品(PCR级绿如蓝染料) | 2.5μl |
| Taq DNA聚合酶 | 1-5U |
| DNA模板 | 适量 |
| PCR引物 | 5-50 pmol each |
| 补水到 | 50μl |
2. 放入荧光PCR 仪中进行qPCR,并在退火或延长反应时记录荧光信号。使用的光学参数可以跟FAM或SYBR Green I 完全一样。
注意事项:
1. 如果使用iCycler,可以不加FAM;如果使用ABI系统,需要在Well Inspector选项下的非特异参照中选择“无”;使用LightCycler时,最好在PCR 体系中再加入终浓度为0.5mg/mL的BSA以降低仪器对染料和模板的非特异吸附。
2. 如果使用化学修饰过的Taq DNA聚合酶,可能需要减低KCl的浓度并提高Tris的浓度。
除了PCR级绿如蓝DNA染料,,我公司还供应以下相关产品:
名称:即用型荧光定量PCR试剂盒
货号:BTN90408
规格:1mL
本产品是基于荧光染料检测的即用型PCR试剂盒,可以对靶片段进行实时定量PCR分析。产品含有经过优化的缓冲液组分、Taq DNA聚合酶、dNTPs、MgCl2及新型荧光染料DNAgreen等所有实时定量PCR所需要的成分,用户只需加入模板和引物即可进行实时定量PCR反应和HRM分析,具有广泛的用途。
产品特点:
1. 方便,用户只需准备模板和引物既可以进行实时定量PCR实验和HRM(High Resolution DNA Melt Curve Analysis)分析。而基于SYBR Green I和LC Green染料的qPCR mix则不能同时用于上述两种实验。
2. 使用第三代饱和型荧光染料,信号强,不会抑制PCR反应。
3.快捷,即用型的预配液使加样操作步骤大大简化,避免了交叉污染,降低实验误差。
4. 各成分的浓度和比例都经过精心优化,反应的灵敏度高,特异性强。能检测到浓度为50拷贝/mL的靶分子。
试剂盒组成:
| 成分 | 规格 |
| Taq DNA聚合酶(5U/μL) | 100μl |
| 易错PCR Mix,10× | 300μl |
| 易错PCR专用dNTP,10× | 300μl |
| MnCl2,5mM | 300μl |
| 说明书 | 1份 |
储存条件:低温运输,-20℃保存,保存期限为6个月。
使用方法:
1.以20μl的qPCR反应体系为例:在一干净的PCR管中,加入下列成分:
| 反应体系成分 | 20μl体系 | 终浓度 |
| qPCR MagicMix,2× | 10μl | 1× |
| 自备引物一 | xμl | 0.1-0.5μM |
| 自备引物二 | xμl | 0.1-0.5μM |
| 自备模板 | xμl | |
| 自备ROX | 2μl | (可以不加) |
| 补超纯水到 | 20μl |
放入荧光PCR仪中进行扩增,并在退火或延长步骤中记录荧光信号。
注意:
a)通常引物浓度以0.2μm可得到较好结果,可以终浓度0.1-1.0μm作为设定范围的参考;通常DNA模板的量以10-100 ng基因组DNA或1-10 ng cDNA为参照,因不同物种的模板中含有的目的基因拷贝数不同,可对模板进行梯度稀释,以确定最佳的模板使用量。
b)ROX 校正染料:如果使用ABI公司的7500,7700和7900三种型号的荧光PCR仪器,则需用自备的ROX进行Ct值校正。对ABI 7700和7900,ROX的最佳浓度为1×(即在每20μl反应体系中加2μl 10×ROX)。对ABI 7500,ROX的最佳浓度为0.05-0.1×(每20μl反应体系加0.1-0.2μl 10×ROX;也可将10×ROX稀释到1×,然后每个反应体系加入1-2μl 1×ROX)。ROX会在溶解曲线中产生噪音,因此,如果出现了杂峰,将软件中“Passive Reference Dye”中的“ROX”选项取消打勾,然后重新分析数据。
对于iCycler IQ,MJ Opticon,MJ Chromo4,MX3000,MX4000,RotorGene3000,RotorGene 6000和LightCycler 480等型号的荧光PCR仪器,ROX不是必须的,但加入的话也不会影响整个PCR分析。
2. 循环步骤:根据扩增子的性质和仪器性能,从以下三个过程中任选一个进行扩增。
两步快速循环法:适用于引物Tm值设计为60℃的反应
| 循环步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 酶活化 | 95℃ | 10min | 1 |
| 变性 | 95℃ | 15s | 35-40 |
| 退火&延伸 | 60℃ | 1min |
注意:本产品所采用的热启动酶须在预变性95℃、10 min条件下实现酶的活化。退火温度请以60-64℃作为设定范围的参考,发生非特异性反应时,可提高退火温度。
三步快速循环法:适用于延伸步骤温度高于退火步骤的PCR(长引物PCR)
| 循环步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 酶活化 | 95℃ | 10min | 1 |
| 变性 | 95℃ | 10s | 35-40 |
| 退火 | 56-64℃ | 30s | |
| 延伸 | 72℃ | 32s |
注意:
·退火温度:建议采用两步法PCR,退火温度60℃进行反应。若提高反应特异性,可提高退火温度,以60-64℃作为设定范围的参考。若因使用Tm值较低的引物等原 因,得不到良好的实验结果时,可尝试进行三步法PCR扩增,三步法的退火温度请以56℃-64℃的范围作为设定参考。
·延伸温度:延伸温度设为72℃通常可以提高扩增效率。但是,对于AT含量大于70%的扩增子来说,延伸温度设为60℃为宜。
通用循环法:这种循环方法适用于几乎所有的荧光PCR仪,也适用于用快速循环法不能扩增的模版。
| 循环步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 酶活化 | 96℃ | 10min | 1 |
| 变性 | 96℃ | 15s | 35-40 |
| 退火&延伸 | 60℃ | 1min |
3. 数据采集
具体操作按所用仪器推荐的流程进行。本产品中所含的荧光染料在没结合DNA时,最大吸收光谱在471nm,结合DNA时的最大吸收光谱在500nm,最大发射光谱在530nm。
注意事项:
1. 如果使用iCycler,可以不加入FAM。
2. 如果使用Roche LightCycler的玻璃毛细管进行PCR,需加入终浓度为0.5mg/mL的自备BSA。
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文献和实验经验分享|动物活体光学成像实验——荧光成像(四)【染料推荐】
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