从福尔马林固定石蜡包埋的样本(FFPE)中获得临床材料是一种常见的、行之有效的方法。但是固定和保存样本的方法会损伤和破坏到样本里核酸质量。因此,想要从样本获得更多有用信息,包括高质量的序列数据就变得具有挑战性,尤其是当样本总量有限时。NEBNext FFPE DNA 修复混合液是由多种酶按照一定的配方混合而成,经过优化和验证可以用来修复 FFPE 样本 DNA。FFPE DNA 修复混合液能提高文库产量,没有偏嗜性,从总体上提高建库成功率。
表格 1:FFPE DNA 的损伤类型及 NEBNext FFPE DNA 修复混合液的修复能力
图 1:FFPE DNA 修复混合液对文库产量的影响。在构建文库之前,用 FFPE DNA 修复混合液处理胃癌 FFPE DNA,然后将处理过的样本和未处理的样本同时建库,并用 Agilent Bioanalyzer ® 进行建库分析,结果显示:产量提高 101% - 458%。