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真菌总RNA提取

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  • ¥100 - 2000
  • xuanya
  • 中国/美国
  • XY-TE-0043
  • 2026年01月30日
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    • 详细信息
    • 文献和实验
    • 技术资料
    • 保存条件

      常温运输和保存

    • 保质期

      两年

    • 英文名

      Column Fungal RNAOUT

    • 库存

      100

    • 供应商

      上海烜雅生物科技有限公司

    真菌总RNA提取产品及特点:
    本产品是在xuanya真菌RNAout基础上改进的柱式产品,跟真菌RNAout相比,它具有下列特点:
    1. 柱式操作,更加简单快捷,整个过程只需要约30分钟。
    2. RNA纯度高,OD260/280一般都在2.0左右,可直接用于RT-PCR、 Norther杂交、microarray hybridization、cDNA合成等。
    3. RNA产量高,一般在20-70ug/mL酵母培养物(约2.0 ×107个细胞)。
    4. 非酶细胞破裂法,适用于各种形态和各个种属的真菌及革兰氏阳性细菌,包括 Candida albican、Saccharomyces cerevisiae、Schizosaccharomycespombe、Pichiapastoris、Bacillus subtilis、Staphylococcusaureus 等。
    产品细节图片1
    真菌总RNA提取运输及保存:
    常温运输,4℃保存,有效期一年。
    自备试剂:氯仿。

    真菌总RNA提取使用方法
    1. 将 50 mg 左右的干菌丝(或 100 mg 左右的鲜菌丝、或适当数量的真菌 菌落)转移到 1.5 mL 塑料离心管中。如果是液体真菌培养物,则直接将 1-10 mL 液体真菌在 1.5 mL 塑料离心管中 12000-15000 g 离心 1 分 钟,并弃尽液体培养基(可以分多次离心)。
    2. 加入 0.4 mL 溶液 A 并充分吹打混匀。如果 A 溶液存放时产生沉淀,请 置于 65℃融化,用前充分摇晃均匀。
    3. 加入 0.4 mL 溶液 B,剧烈振荡 30 秒。
    4. 65℃保温 5 分钟。
    5. 室温 12000-15000 g 离心 3-5 分钟,转移上清到一干净的 1.5 mL 塑 料离心管中。
    6. 再加入 0.1 mL 溶液 B 和 0.1 mL 自备氯仿,振荡混匀 30 秒。
    7. 室温12000-15000 g离心3-5分钟,转移上清到一自备的、干净的5 mL 塑料离心管中。
    8. 加入相当于上清 3 倍体积的溶液 C(约 1.2-1.5 mL)和 1 倍体积的溶 液 D(约 0.4-0.5 mL),充分混匀。
    9. 将 混合 液(约 2.5mL)分 3-4 次转 移 到 离心 吸 附 柱 中。 每次 13000-15000 g 室温离心半分钟,弃收集管中的穿透液。
    10. 用 0.5 mL 通用洗柱液到离心吸附柱中,室温离心半分钟,弃收集管中 的穿透液。
    11. 一次洗涤一般足够去除杂质。但如果样品 OD260/280 比值不高,可以 再用 0.5 mL 通用洗柱液重复此步一次。
    12. 室温离心半分钟。此步十分重要,否则残留的洗柱液会影响 RNA 的使用。
    13. 将离心吸附柱转移到一自备的 RNase-free 1.5 mL 塑料离心管中,加入 30-100 uL RNA 洗脱液。
    14. 室温离心半分钟,离心管中溶液即为 RNA 样品,可以立即使用或存放于 -80℃待用。
    15. RNA 完整性的电泳检测: 如果需要做 Northern 杂交,强烈建议用户使用甲醛变性胶进行 RNA 电 泳,因为非变性胶不能分离所有的 RNA 分子(BioTechniques,28: 414,2000)。如果是简单检测,可以使用 TAE 或xuanya的 SuperBuffer-2 DNA/RNA 两用快速电泳液,但文献报道必须使用变性 上样液(BioTechniques,9:558,1990)。普通 DNA 上样液不含变性 剂,也没经过去 RNase 处理,所以最好不要使用。 尤其需要注意的是不 要使用 TBE 进行 RNA 电泳,因为 TBE 所含 是研究多糖的经典方法----络合法中的关键成分,通过与 RNA 核糖中的羟基发生络 合反应,形成 RNA 分子内或 RNA 分子间的络合复 合物,使同样长度的 RNA 具有不同的泳动速度,电泳条带弥散,同时有 大的 RNA 络合复合 物迟留在加样孔中(一般会误以为是基因组 DNA 污 染)。RNA 分子内或 RNA 分子间的络合物的形成的多少和比例又与 与 RNA 的数量比例 有关,而 RNA 样品中污染的其他多糖也会参与此反 应,使对 RNA 电泳的影响更复杂,所以 TBE 对 RNA 电泳的影响 没有规律性和重复性。 有的样品可以使用有的又不行,最好是避免使用。
    16. RNA 产量产率测定: 将 5-10 μL RNA 溶于 TE 缓冲液中(pH7.5-8.2 之间)检测其在 OD260 的光吸收。通过光吸收可以得出 RNA 浓度(1 OD260 的 RNA=40 , μg/mL),进而计算出 RNA 的产量(浓度 X 体积)和产率(RNA 产量/细 菌用量)。注意不要将 RNA 稀释在 DEPC 水中检测 OD260 和 OD280, 否则光吸收比在 TE 中测得的低 10%-15%。
    17. RNA 纯度测定: 无污染的总 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8-2.1 之间(具体数值与 其碱基组成和溶液成分等多种因素有关),OD260/OD230 一般在 2.0-2.3 之间,如果低于或高于此范围则分别表示样品可能有蛋白质或 多糖的污染,但一般不影响 RT-PCR 等反应。蛋白质污染可以通过酚/ 氯仿抽提一次然后酒精沉淀去除,DNA 和多糖污染可以分别用xuanya的 DNA Erasol 和 PS Erasol 去除。测 OD 时 RNA 不能过度稀释 使 OD 读数低于仪器的有效范围。

    真菌总RNA提取疑难解答
    Q:为何从酵母中提取的总 RNA 有 3 条小带?
    A:它们分别是 70 bp 左右的 tRNA, 120 bp 左右的 5 S RNA, 160 bp 左右 的 5.8 S RNA。

    Q:上样孔里的红色荧光物一定是污染的基因组 DNA 吗?
    A:不是。用 TAE 或 TBE 电泳液和非变性胶电泳 RNA 时容易产生此现象, xuanya初步研究发现大部分红色荧光物是变性不充分的单链 RNA 通过 碱基互补或通过络合(如果使用 TBE 作电泳液的话)形成的复合物 加 RNase 处理后,这些红色荧光物一般会消失。为避免此现象,建议最 好使用甲醛变性胶电泳。如果需要使用非变性胶,也必须在上样前使 RNA 变性。使用xuanya优化的上样/变性/染色三用溶液 RNAON 可以使 RNA 在非变性胶上电泳时也有较好分辨率。使用非变性胶时,可以使用 TAE 或超快电泳液 SuperBuffer-2,最好不要使用 TBE 缓冲液,因为 TBE 中 的能与 RNA 的多羟基形成复合物,RNA 很难形成锐利的条带。

    真菌总RNA提取Q:如何确认和去处除污染的基因组 DNA?
    A:如果怀疑有 DNA 污染,可以用 RNase 处理 RNA 样品,然后再电泳。如 果上样孔里的红色荧光物不消失,则表示是基因组 DNA 污染。进一步确认可以使用 PCR 扩增法。去除污染的 DNA 可以使用非酶的 DNA 去除剂 DNA Erasol 或 RNase-free DNase,由于 RNase-free DNase 一般都有残留的 RNase 污染,所以必须严格按照厂家提供的使用手册进行操作。

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