肿瘤类

基于患者来源肿瘤类器官模型开展癌症治疗靶点研究的系统化思路和验证思路！

本文从肿瘤类器官模型开展癌症治疗靶点研究思考出发，涵盖靶点初筛与临床验证、类器官模型构建、靶点定向调控、生物学功能验证、治疗转化潜力评估及机制探索六大核心环节。   候选靶点的生物信息学初筛与临床相关性验证 核心原则是：临床相关性优先，生物学功能支撑，分为两个核心步骤：   1. 多维度生物信息学大数据初筛 首先通过公共肿瘤基因组与转录组数据库，完成候选靶点的初步锁定： ① 差异表达分析：通过 GEPIA、TCGA、GEO、Oncomine 等数据库，分析目标基因在肿瘤

Nature Cancer I 生物标志物多参数评估mTLS预测实体瘤免疫治疗效果

知名制药企业，CRO 公司，研究所等多家著名机构以多重免疫荧光整体方案为主要方法，对三个不同类型癌症患者的独立样本进行大规模回顾性分析，发现： (1) 较高密度的三级淋巴结构 (TLS) 的高密度性与 CD8+ T 淋巴细胞肿瘤浸润密度相关，是细胞杀伤性免疫反应激活的特征; (2) B 细胞和成熟 TLS 可预测接受免疫检查点抑制剂治疗的患者的预后; (3) 泛肿瘤/“肿瘤不可知”生物标志物：TLS 在 11 种不同肿瘤类型中的存在与 PDL-1 轴阻断功效相关； (4)为了更可靠地评估

手把手教你用 CCLE 看基因在肿瘤细胞系的高低表达

个，点开红色方框的 egot，进入下一步。第一张图是基因在组织中的高低表达，第二张图是基因在细胞系中的高低表达。鼠标放在各种肿瘤上你就可以看到各个细胞系的高低表达了。同时下载表达数据，点开红色方框，就可以下载 excel 的数据。将 excel 表格的数据从横向排列变成纵向排列。CCLE 总共收集了 1 036 种细胞系，涉及十几种肿瘤类型。根据想要的肿瘤类型选择细胞系，例如乳腺癌（breast cancer），在 A 列中，全选，然后在「排序和筛选」，接着「筛选」。选择「确定」就可以看到所有乳