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NovoNGSTM DNA Library FlashPre

p Kit for Illumina®
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  • ¥6500
  • 近岸蛋白(Novoprotein)已认证
  • 2025年11月16日
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    产品概述:
             NovoNGSTM DNA Library FlashPrep Kit for Illumina®是针对Illumina高通量测序平台开发的专用试剂盒,可将基因组DNA制备成Illumina高通量测序平台专用的测序文库。该试剂盒采用新型体外转座技术,只需5分钟即可一步实现DNA片段化与接头连接,实验操作快速简单,无需经过传统文库制备时的片段化、末端修复、接头连接等繁琐步骤,并经工艺优化,PCR扩增前无需磁珠纯化,更加省时省力。使用本试剂盒建库时,起始DNA量更灵活,有50ng20ng5ng1ng四种规格可选(目录号分别为:N231N232N233N234

    特点:
            1、快速简单,流畅高效,90分钟完成文库制备;
           2DNA起始量1ng起,可用于微量样本测序,包含四种起始规格,有效避免DNA起始量不足的情况

    质量控制:
            试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证文库质量的稳定性和重复性。

    适用范围:
             适用于将DNA制备成Illumina高通量测序平台专用文库。

    产品组成:
    Component 24 rxns 96rxns
    Transposon Mix 48μl 192μl
    5×Reaction Buffer 120μl 480μl
    5×Stop Buffer 135μl 540μl
    AmpliMix 600μl 2400μl

    保存条件:
            -20℃保存,有效期一年


    建库原理及流程:

           
    转座复合体在55℃条件下孵育5min便能一步实现基因组DNA的片段化与加接头两个过程。片段化产物经N5/N7引物(NovoNGSTM Index Kit for Illumina®,提供8N5引物及12N7引物的选择,目录号:N237)扩增后,再经过磁珠分选,便可得到测序文库。建库原理及流程示意图如下:
    产品细节图片1


    文库结构:
    5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC-Index2(i5)-TCGTCGGCAGCGTCAGAT

    GTGTATAAGAGACAG-xxxxxxxxx-CTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGAC-Index1(i7)-ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG-3’

    Adapter:转座复合物中包被的接头,共两种,分别带有N5/N7引物识别序列及转座酶识别序列,文库打断的同时会添加到DNA片段两端
    i5i7:分别代表Index2(i5)Index1(i7)均为8 bp其中Index2(i5)8种,Index1(i7)12
    N5N7:分别携带Index2(i5)Index1(i7)的引物
    -xxxxxxxxx-: 插入序列


    流程简示:
     
    产品细节图片2
    注:SB代表5×Stop Buffer

    实验耗材及要求:
    1、实验耗材准备
    新鲜配制的80%乙醇、灭菌超纯水、低吸附EP管和PCR管、磁力架、PCR仪、磁珠。
     
    2、起始DNA的准备与要求
    纯化过的DNA溶于灭菌纯水或10mMTris-HCl(pH8.0),吸光度260/2801.8~2.0之间。因为转座体用量与DNA起始量密切相关,所以准确测定DNA浓度是实验成功的关键。推荐使用Qubit或荧光染料PicoGreen进行浓度测定,请勿使用以吸光度为基础的任何测定方法。
     
    3、实验流程:
    Step1DNA片段化
    1. 于室温融解5×Reaction buffer5×Stop buffer,轻柔混匀后备用;从4℃取出磁珠,室温静置30min备用。
    2. 在灭菌PCR管中依次添加各反应组分:
    3. ddH2O To  20μl
      5×Reaction buffer 4μl
      DNA 50ng(20ng5ng1ng)       
      Transposon Mix 2μl
      使用移液器轻轻吹打20次,充分混匀。十分重要!
       
    4. 将样品置于PCR仪中,反应程序设置如下:
    5. 105℃ 热盖
      55℃ 5min
      10℃ 10min
       
    6. PCR仪中取出样品,加入5μl Stop Buffer, 移液器轻柔吹打混匀后再次放回PCR仪,55孵育5min后取出。
    7. Step2PCR扩增
      a.将灭菌PCR管置于冰浴中配制55μl反应体系,依次添加各反应组分:
      Step1产物 25μl
      N5引物(81 2.5μl
      N7引物(121 2.5μl
      AmpliMix 25μl
       
      b.移液器轻轻吹打,充分混匀。
       
      c.PCR扩增程序如下:
      72℃*         3min
      98℃       30sec
      98℃       30sec
      60℃       30sec        4-13cycles
      72℃      120sec
      72℃       2min
      10℃       Hold
       
      *: 72℃孵育3min为链置换反应,此步骤不可省略。
      PCR循环数多则文库产量高,但对应Duplication会增多,请根据测序需要进行选择。每种试剂盒,不同循环数对应的文库产出请参照附表一。
      Step3:扩增产物长度分选
      如对文库长度分布无特殊要求,可直接使用1.0×磁珠纯化文库扩增产物,不需进行片段分选。
      以下为采用磁珠两步分选法对扩增产物进行长度分选的步骤,请优选NovoNGSTM DNA Screen Beads(货号:N240)如使用其他品牌磁珠,使用方法请以该品牌说明书推荐的体系为准
      文库平均总长度 ~350bp ~450bp ~550bp ~680bp
      文库平均插入长度 ~220 bp ~320 bp ~420 bp ~550bp
      第一轮磁珠用量V1 0.7× 0.6× 0.55× 0.45×
      第二轮磁珠用量V2 0.2× 0.15× 0.15× 0.15×
       
      举例:“0.7×”代表磁珠与PCR产物的体积比,若PCR产物体积为50μl,则第一轮磁珠用量0.7×50μl =35μl,第二轮磁珠用量为:0.2×50μl=10μl
      注意:由于PCR过程中水分蒸发导致PCR产物体积小于50μl,请务必用ddH2O补齐至50μl,否则会导致分选长度和预期不一致。
      片段筛选:
    8. 涡旋振荡混匀磁珠后,吸取V1体积磁珠加入50μl PCR产物中,使用移液枪轻轻吹打充分混匀,室温孵育5 min
    9. 将反应管短暂离心后置于磁力架,使磁珠与液体分离(约5 min,溶液澄清后),小心转移上清至干净的EP管中,丢弃磁珠;
    10. 涡旋振荡混匀磁珠后,吸取V2体积磁珠至上清中,使用移液枪轻轻吹打充分混匀,室温孵育5 min
    11. 将反应管短暂离心后置于磁力架,使磁珠与液体分离(约5 min,溶液澄清后),小心移除上清;
    12. 加入200μl新鲜配制的80%乙醇漂洗磁珠,室温孵育30sec后,小心移除上清,此过程仍保持反应管置于磁力架中;
    13. 重复步骤(5)一次;
    14. 保持反应管置于磁力架中,打开管盖,室温晾干约7min,使乙醇充分挥发,切记磁珠不要干燥过度;
    15. 将反应管从磁力架上取下,加入22μl无菌超纯水洗脱,吹打混匀或涡旋混匀后室温孵育3min
    16. 将反应管短暂离心后置于磁力架,使磁珠与液体完全分离(约2 min,溶液澄清后),小心吸取20μl上清至新的无菌PCR管内中,-20℃保存。
    17.  
    18.  
    19. 附表一:
      N231(50ng DNA 起始) 扩增循环数:
      N232(20ng DNA起始) 扩增循环数:
      N233(5ng DNA 起始)   扩增循环数:
      N234(1ng DNA 起始)   扩增循环数:
      4
      6
      8
      11
      5
      7
      9
      12
      6
      8
      10
      13
      7
      9
      11
      14
      文库产出(不进行片段分选,ng): 400 600 1000 1500
       
      文库长短分布检测及长度分选效果:
    20. 产品细节图片3
    21. Agilent 2100 Bioanalyzer文库质量分析
     


     

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