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CIRCRNA芯片服务
上海鲸舟基因科技有限公司
þSinomics 非编码RNA芯片近年来大量研究表明非编码RNA在人类疾病调控中扮演重要角色。为开发疾病诊断标志物和筛选新药靶标带来新方向。同时,越来越多的新的转录组实验结果表明,基因组非编码序列有绝大部分是可以表达的。越来越多的事实证明转录出来的非编码RNA具有重要的生物学功能。相关系列芯片服务:Sinomics lncRNA芯片、Sinomics circRNA芯片、Sinomics ceRNA芯片
² circBase: http://www.circbase.org/该数据库收录了包括人、小鼠、线虫、果蝇等在内的上万多条circRNA信息。²CircInteractome:该数据库可以检索circRNA的基本信息之外,还可以预测RBP是否能和某个circRNA结合,预测circRNA可以结合的miRNA。此外,该数据库可以对接设计circRNA的RT-PCR引物,可以设计siRNA干扰探针及鉴定潜在的核糖体结合位点(IRES)。²CSCD (Cancer-specific circRNAs database):http://gb.whu.edu.cn/CSCD/该数据库收集了87个肿瘤细胞系样本的高通量测序数据,以4中不同的主流circRNA分析方法(CIRI、find_circ、circRNA_finder、circexplorer)进行分析,对肿瘤特异性的circRNA进行了归类和注释(包含272,152个肿瘤特异circRNA)。
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