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- 2025年07月12日
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上海鲸舟基因科技有限公司
Agilent miRNA芯片服务
技术特点
1）Aglent独特专利的探针设计（如图），保证只识别成熟miRNA
2）高度灵敏，可识别一个碱基差异，检测下限<0.1 amol
3）样品需求量低，只需要100ng Total RNA
4）不需要分离miRNA，避免丢失及引起误差
5）动态检测范围宽，检测丰度跨5个log，有利于检测到更宽丰度范围的miRNA
6）高重复探针，每个miRNA至少重复20次
7）平均CV<10%，R2﹥0.99
服务内容
生物信息分析
1. 基本数据分析
01）原始数据，归一化处理
02）盒型图（Box Plot）
03）样本聚类图
04）PCA图
05）样品相关性系数图
06）miRNA表达差异筛选
07）散点图
08）火山图
09）聚类热图
10）组间有差异的已知miRNA的靶基因预测（基于已有数据库）
11）组间有差异的miRNA的靶基因基因功能富集分析（Gene Ontology）
12）组间有差异的miRNA的靶基因信号通路富集分析（KEGG）
2. 高级数据分析
01）组间有差异的已知miRNA的靶基因预测（Miranda新预测）
02）组间有差异的miRNA与其靶基因的网络图展示（miRNA-target-network）
03）组间有差异的miRNA的靶基因功能调控网络图（miRNA－Pathway Network）
04）组间有差异的miRNA的靶基因功能调控网络图（miRNA－GO Network）
05）miRNA芯片结果与mRNA表达谱数据的共表达联合分析（需要有mRNA表达谱数据）
06）miRNA芯片结果与mRNA表达谱数据的靶基因负表达联合分析（需要有mRNA表达谱数据）
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文献和实验相关专题 miRNA RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”，但越来越多的证据清楚的表明，RNA在生命的进程中扮演的角色远比RNA我们早前设想的更为重要。 RNA干扰（RNA interference）的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识，更因为可以简化替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具，因此格外引人注意，在2002年度Science评选的10大科学成就中RNAi名列榜首。 随着对小分子RNA研究的不断深入，研究人员开始认识到：小分子RNA的世界一点都不小
一、miRNA的靶基因寻找研究表明，一个基因可以受多个miRNA调控，而一种miRNA又可以参与调控多个靶基因，据预测，至少有30%的人类基因是miRNA的靶基因。这就足以显示出miRNA群体的重要性。而在人类疾病中多不同程度的表现出大量miRNA的上调和下调，这也足以显示miRNA在疾病发生过程中占据着非常重要的作用。而探讨miRNA的功能作用中最重要的一步就是高效准确的寻找到其所调控的靶基因。目前寻找靶基因主要是从以下两个方面入手。1．生物信息学方法miRNA靶基因的预测主要是根据生物
2004seedfive 各位仁兄！提取植物的miRNA哪家公司的试剂盒提取的质量好 谢谢 freecell 做核酸提取，Qiagen比较专业；其中做RNA的话，Ambion自称RNA技术公司，相对比较可靠。 艾博思 2004seedfive wrote: 各位仁兄！提取植物的miRNA哪家公司的试剂盒提取的质量好 谢谢
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