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MIRNA芯片服务
上海鲸舟基因科技有限公司
Agilent miRNA芯片服务
技术特点
1)Aglent独特专利的探针设计(如图),保证只识别成熟miRNA
2)高度灵敏,可识别一个碱基差异,检测下限<0.1 amol
3)样品需求量低,只需要100ng Total RNA
4)不需要分离miRNA,避免丢失及引起误差
5)动态检测范围宽,检测丰度跨5个log,有利于检测到更宽丰度范围的miRNA
6)高重复探针,每个miRNA至少重复20次
7)平均CV<10%,R2﹥0.99
服务内容
生物信息分析
1. 基本数据分析
01)原始数据,归一化处理
02)盒型图(Box Plot)
03)样本聚类图
04)PCA图
05)样品相关性系数图
06)miRNA表达差异筛选
07)散点图
08)火山图
09)聚类热图
10)组间有差异的已知miRNA的靶基因预测(基于已有数据库)
11)组间有差异的miRNA的靶基因基因功能富集分析(Gene Ontology)
12)组间有差异的miRNA的靶基因信号通路富集分析(KEGG)
2. 高级数据分析
01)组间有差异的已知miRNA的靶基因预测(Miranda新预测)
02)组间有差异的miRNA与其靶基因的网络图展示(miRNA-target-network)
03)组间有差异的miRNA的靶基因功能调控网络图(miRNA-Pathway Network)
04)组间有差异的miRNA的靶基因功能调控网络图(miRNA-GO Network)
05)miRNA芯片结果与mRNA表达谱数据的共表达联合分析(需要有mRNA表达谱数据)
06)miRNA芯片结果与mRNA表达谱数据的靶基因负表达联合分析(需要有mRNA表达谱数据)
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