MIRNA芯片服务

Agilent miRNA芯片服务

       

技术特点

1）Aglent独特专利的探针设计（如图），保证只识别成熟miRNA

2）高度灵敏，可识别一个碱基差异，检测下限<0.1 amol

3）样品需求量低，只需要100ng Total RNA

4）不需要分离miRNA，避免丢失及引起误差

5）动态检测范围宽，检测丰度跨5个log，有利于检测到更宽丰度范围的miRNA

6）高重复探针，每个miRNA至少重复20次

7）平均CV<10%，R2﹥0.99  

 

服务内容

 

生物信息分析

1. 基本数据分析

01）原始数据，归一化处理

02）盒型图（Box Plot）

03）样本聚类图

04）PCA图

05）样品相关性系数图

06）miRNA表达差异筛选

07）散点图

08）火山图

09）聚类热图

10）组间有差异的已知miRNA的靶基因预测（基于已有数据库）

11）组间有差异的miRNA的靶基因基因功能富集分析（Gene Ontology）

12）组间有差异的miRNA的靶基因信号通路富集分析（KEGG）

 

2. 高级数据分析

01）组间有差异的已知miRNA的靶基因预测（Miranda新预测）

02）组间有差异的miRNA与其靶基因的网络图展示（miRNA-target-network）

03）组间有差异的miRNA的靶基因功能调控网络图（miRNA－Pathway Network）

04）组间有差异的miRNA的靶基因功能调控网络图（miRNA－GO Network）

05）miRNA芯片结果与mRNA表达谱数据的共表达联合分析（需要有mRNA表达谱数据）

06）miRNA芯片结果与mRNA表达谱数据的靶基因负表达联合分析（需要有mRNA表达谱数据）