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Myelination: CD9, HEXB, IFNG, MAL, MBP, NTF3, PLP1, PMP22, SOD1, TGFB1.
T Cell Activation/Signaling: APC, CD28, CD4, EGR1, FOXP3, ICAM1, IFNG, IL10, IL18, IL1B, IL2RA, IL6, IL6ST (GP130), MAPK1 (ERK2), SOD1, TGFB1, VCAM1.
Adaptive Immunity: C1S, CD40 (TNFRSF5), FOXP3, ICAM1, IFNG, IL10, IL18, IL1B, IL6ST (GP130), TGFB1, VEGFA.
Cytokine/Chemokine: CCL2 (MCP-1), CCL3 (MIP-1A), CCL5 (RANTES), CCL7 (MCP-3), CSF1 (MCSF), CXCL10 (INP10), CXCL11 (I-TAC/IP-9), CXCL9 (MIG), FASLG (TNFSF6), IFNG, IL10, IL18, IL1B, IL6, LTA (TNFB), TGFB2, TNF, VEGFA.
Inflammation: Regulation: CCL5 (RANTES), EDNRA, GPX1, IL6, IL6ST (GP130), JAK2, TNFRSF1A.
Response: C1S, CCL2 (MCP-1), CCL3 (MIP-1A), CCL7 (MCP-3), CCR1, CCR5, CD40 (TNFRSF5), CD44, CXCL10 (INP10), CXCL11 (I-TAC/IP-9), CXCL9 (MIG), FN1, HIF1A, IL10, IL13, IL1B, IL2RA, ITGB2, NFKB1, STAT3, TGFB1, TNF, TNFRSF1B.
Apoptosis: Neuronal: AKT1S1, BAX, BCL2, BCL2L1 (BCL-X), ERBB3, GPX1, JAK2, JUN, NTF3, SOD1, TGFB2, TNF.
General: IL10, MAPK1 (ERK2), TNFRSF1B, IL6ST (GP130), HDAC1, RAF1, APC, APP, CCL2 (MCP-1), CD28, FASLG (TNFSF6), IFNG, IL1B, IL2RA, IL6, ITGB2, MMP9 (Gelatinase B), NFKB1, TGFB1, TNFRSF1A, ADM, CD44, LTA (TNFB), MAL, VEGFA.
Cell Adhesion: APC, APP, BCL2, CCL2 (MCP-1), CCL5 (RANTES), CCR1, CD4, CD44, CD9, CSF1 (MCSF), CXCR3, ERBB3, EZR, FN1, ICAM1, IL18, IL1B, ITGB2, JAK2, MAG, MAP2K1 (MEK1), TGFB1, TGFB2, TNF, VCAM1.
Cellular Stress: ADM, BCL2, GPX1, HIF1A, IFNG, IL1B, JAK2, JUN, PTPN11, SOD1, TGFB2, TNF.
Receptors: CCR1, CCR5, CD28, CD4, CD40 (TNFRSF5), CD44, CXCR3, EDNRA, EPHA1, HLA- DRB1, ICAM1, IL2RA, IL6ST (GP130), ITGB2, NR2F1, TNFRSF1A, TNFRSF1B.
Transcription Factors: EGR1, FOXP3, HDAC1, HIF1A, JUN, MYC, NFKB1, NR2F1, STAT3.
Others: ASPA, EDC4, GFAP, GNAI2, GRB2, JAK1, PHGDH, RANGAP1, TOP1, TUBB4, YWHAH.
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文献和实验简介:什么是PCR芯片? 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内参基因,因此,每次实验只能检测少数几个基因的表达水平,若要检测大量基因,则工作量巨大,耗时长久。 通过简单的,经过优化的实时定量PCR体系,如SuperArray的RT2ProfilerTM
,或者用RNase-Free的DNase处理RNA样品。在这里我们介绍一些常用的RNA纯化试剂盒,特别是由Affymetrix公司推荐的QIAGEN RNA纯化系列。* RNeasy Protect Kit:一旦生物样品被收集分离,它的RNA会立刻变得非常不稳定,极易被降解。由于特异及非特异的RNA降解,或者由于应激反应产生新的RNA都会引起RNA状态的改变。对于生物芯片、基因表达矩阵分析(Array Analysis)、定量RT-PCR等实验来说,采样后立即稳定样品里的RNA以保存当时RNA的表达状态,是精确
结构的形成及自身复性。由于PNA-DNA结合更加稳定和特异,因此更有利于单碱基错配基因的检测。我们在这里简单介绍一些常用杂交试剂和消耗品。对于商品化的芯片和Array类产品,通常都有配套的杂交试剂以方便使用。例如:1. Clontech公司的Altas Glass Microarrays,产品已经包含GlassHyb™ Hybridization Solution和GlassHyb™ Wash Solution,能有效缩短杂交时间,提高信噪比。同时还提供了方便使用的Altas Glass
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