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- 2025年07月14日
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Circadian Clock: ARNTL (BMAL1), ARNTL2, BHLHE40 (DEC1), BHLHE41, CLOCK, CSNK1E, CRY1, CRY2, NR1D1, NR1D2 (REV- ERB), PER1, PER2, PER3, RORA, TIMELESS.
Casein Kinases: CSNK1A1, CSNK1D, CSNK1E, CSNK2A1, CSNK2A2.
CREB Signaling: AANAT, CAMK2A, CAMK2B, CAMK2D, CAMK2G, CHRNB2, CREB1, CREB3, KCNMA1, HTR7, MAPK1, MAPK14, MAPK3, MAT2A, PRKACB, PRKACG, PRKAR1A, PRKAR1B, PRKAR2A, PRKAR2B, PRKCA, PRKCB, PROKR2.
Light Sensing Proteins: Melatonin Receptors: MTNR1A, MTNR1B.
Opsins: OPN3, OPN4.
Others: CHRNB2, CRX.
Circadian Regulated Transcription Factors: ALAS1, EGR1, EGR3, EPO, ESRRA, HLF, IRF1, MYOD1, NFIL3, NKX2-5, PAX4, POU2F1, RORB, RORC, SMAD4, SP1, SREBF1, STAT5A, TEF,
TFAP2A, TGFB1, WEE1, DBP, PPARA.
Other Common Circadian Regulated Genes: CARTPT, CCRN4L, FBXL21, FBXL3, HEBP1, NCOA3, NMS, NPAS2, NR2F6, PPARGC1A, PRF1, PTGDS, SLC9A3.
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文献和实验简介：什么是PCR芯片？ 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏，最可靠的方法。通过在试验过程中，实时监测荧光染料的信号变化，反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广（能达到5个数量级），因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是，由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内参基因，因此，每次实验只能检测少数几个基因的表达水平，若要检测大量基因，则工作量巨大，耗时长久。 通过简单的，经过优化的实时定量PCR体系，如SuperArray的RT2ProfilerTM
，或者用RNase-Free的DNase处理RNA样品。在这里我们介绍一些常用的RNA纯化试剂盒，特别是由Affymetrix公司推荐的QIAGEN RNA纯化系列。* RNeasy Protect Kit：一旦生物样品被收集分离，它的RNA会立刻变得非常不稳定，极易被降解。由于特异及非特异的RNA降解，或者由于应激反应产生新的RNA都会引起RNA状态的改变。对于生物芯片、基因表达矩阵分析（Array Analysis）、定量RT-PCR等实验来说，采样后立即稳定样品里的RNA以保存当时RNA的表达状态，是精确
结构的形成及自身复性。由于PNA-DNA结合更加稳定和特异，因此更有利于单碱基错配基因的检测。我们在这里简单介绍一些常用杂交试剂和消耗品。对于商品化的芯片和Array类产品，通常都有配套的杂交试剂以方便使用。例如：1. Clontech公司的Altas Glass Microarrays，产品已经包含GlassHyb™ Hybridization Solution和GlassHyb™ Wash Solution，能有效缩短杂交时间，提高信噪比。同时还提供了方便使用的Altas Glass
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