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G1 Phase and G1/S Transition: ANAPC2, CCND1, CCNE1, CDC25A, CDC34, CDK4, CDK6, CDKN1B (p27KIP1), CDKN3, CUL1, CUL2, CUL3, E2F1, SKP2.
S Phase and DNA Replication: ABL1, CDC6, MCM2, MCM3, MCM4, MCM5, WEE1.
G2 Phase and G2/M Transition: ANAPC2, BCCIP, BIRC5, CCNA2, CCNB1, CCNG1, CCNH, CCNT1, CDC25A, CDK5R1, CDK5RAP1, CDK7, CDKN3, CKS1B, CKS2, GTSE1, KPNA2, MNAT1, SERTAD1.
M Phase: AURKB, CCNB2, CCNF, CDC25C, CDC6, CDK1 (CDC2), CDC16, CDC20, MRE11A, RAD51, STMN1.
Cell Cycle Checkpoint and Cell Cycle Arrest: ATM, ATR, BRCA1, BRCA2, CASP3, CCNA2, CCNG2, CDC25A, CDC25C, CDC34, CDK1 (CDC2), CDK2, CDKN1A (p21CIP1/WAF1), CDKN1B (p27KIP1), CDKN2A (p16INK4), CDKN2B (p15INK4B), CDKN3, CHEK1, CHEK2 (RAD53), CUL1, CUL2, CUL3, GADD45A, HUS1, KNTC1, MAD2L1, MAD2L2, MDM2, NBN (NBS1), RAD1, RAD17, RAD9A, RB1, RBBP8, TP53, WEE1.
Regulation of Cell Cycle: ABL1, ANAPC2, ATR, AURKA, BCCIP, BCL2, BRCA2, CCNB1, CCNB2, CCNC, CCND1, CCND2, CCND3, CCNE1, CCNF, CCNH, CCNT1, CDC16, CDC20, CDC25C, CDC6, CDK1 (CDC2), CDK2, CDK4, CDK5R1, CDK6, CDK7, CDK8, CDKN1A (p21CIP1/WAF1), CDKN1B (p27KIP1), CKS1B, E2F1, E2F4, GADD45A, KNTC1, MKI67, RAD9A, RB1, SKP2, TFDP1, TFDP2, WEE1.
Negative Regulation of Cell Cycle: ATM, BRCA1, CASP3, CDKN2B (p15INK4B), RBL1, RBL2, TP53.
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文献和实验简介:什么是PCR芯片? 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内参基因,因此,每次实验只能检测少数几个基因的表达水平,若要检测大量基因,则工作量巨大,耗时长久。 通过简单的,经过优化的实时定量PCR体系,如SuperArray的RT2ProfilerTM
,或者用RNase-Free的DNase处理RNA样品。在这里我们介绍一些常用的RNA纯化试剂盒,特别是由Affymetrix公司推荐的QIAGEN RNA纯化系列。* RNeasy Protect Kit:一旦生物样品被收集分离,它的RNA会立刻变得非常不稳定,极易被降解。由于特异及非特异的RNA降解,或者由于应激反应产生新的RNA都会引起RNA状态的改变。对于生物芯片、基因表达矩阵分析(Array Analysis)、定量RT-PCR等实验来说,采样后立即稳定样品里的RNA以保存当时RNA的表达状态,是精确
结构的形成及自身复性。由于PNA-DNA结合更加稳定和特异,因此更有利于单碱基错配基因的检测。我们在这里简单介绍一些常用杂交试剂和消耗品。对于商品化的芯片和Array类产品,通常都有配套的杂交试剂以方便使用。例如:1. Clontech公司的Altas Glass Microarrays,产品已经包含GlassHyb™ Hybridization Solution和GlassHyb™ Wash Solution,能有效缩短杂交时间,提高信噪比。同时还提供了方便使用的Altas Glass
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