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生物信息技术服务——基因组分析、转录组分析、蛋白质组分析、系

统生物学分析
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  • 北京
  • 2025年12月10日
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      生物信息技术服务——基因组分析、转录组分析、蛋白质组分析、系统生物学分析

    • 提供商

      西农生(北京)生物技术有限公司

    提供以下服务:基因组分析、转录组分析、蛋白质组分析、系统生物学分析等,
    详见公司网站


    、基因组分析

    重测序分析:

    寻找SNP,indel 插入缺失分析,CNV拷贝数变异分析,群体遗传学等

    转录位点分析

    SNP芯片分析

    基因组功能注释与分析

    通过生物信息学的方法解读微生物的基因组信息,使人们迅速得获得一个微生物的大部分基因功能信息;利用获取的信息与已知的近缘微生物基因组进行比较分析,进一步挖掘序列背后的生物学意义,为生物学家提供指导。

    功能基因组注释
    l 基因预测
    l 基因功能注释
    l 蛋白质功能分类
    l 蛋白质亚细胞定位
    l rDNA和tRNA基因预测
    l IS element和Prophage预测

    功能基因组分析
    l Paralog和Ortholog计算
    l 代谢通路的构建
    l 基因岛和水平转移基因的发现
    l 基因组多态性的分析
    l 基于同源基因的DN/DS计算的进化分析



    二、转录组分析

    服务介绍

    1. RNA-Seq分析:差异表达,时间序列表达分析等。

    2.miRNA表达分析

    3.基因表达芯片分析

    蛋白质组分析


    标准分析A:(包含必选的基础分析模块和基于公共数据库分析的订制模块)
    A1. 差异蛋白的综合注释。
    A2. 基于注释结果的聚类分析。
    A3. 基于Gene Ontology的差异蛋白的富集分析(生物学途径/细胞学功能/亚细胞定位等)。
    A4. 显著激活通路的富集分析及可视化分析。
    A5. gene-phenotype-disease关联分析。
    可选分析B:(包含基于专业/商业化数据库系统所提供的出版级数据分析,为高级别杂志所广泛采用的深入型分析)
    B1. 差异蛋白的潜在调控模式分析(miRNA/Transcription Factor/Target )。
    B2. 差异蛋白的相互作用网络分析。
    B3. 基于GeneMania/IPA数据库的系统生物学分析,药物处理后表型相关子网络及其调控模块分析。
    这部分为我们所推荐的特色分析,供您选择。
    我们会根据你的具体需要和研究背景,在分析过程中调整重心,做更有针对性的靶向分析(例如细胞骨架/凋亡/自噬的相关调控模式和新靶点分析)





    四、系统生物学分析

    Gene Ontology分析
    Pathway 通路分析
    基因网络构建
    数据整合
    功能模块发现
    关联分析(Association Study)

    详见公司网站 http://www.scilongs.com

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    • 蛋白质组学生物信息分析内容介绍与产品选购建议

      讲师介绍: 夏红蕾 毕业于上海交通大学,有多年的科研技术服务经验,专注于蛋白组学、代谢组学研究领域。在课题设计、技术应用和问题处理方面具有多年丰富的实战经验,服务过 300 多家单位,协助客户发表多篇文章。 课程介绍: 1. 科研服务平台:GRP 平台。 2. 蛋白质组学实验流程和分析内容。 3. 不同蛋白质组学技术路线如何选择? 4. 典型的蛋白质组学研究思路:客户案例分享。

    • 各种各样的「组学」定义

      今天科学的行话变得越来越难以理解了,在进入蛋白质组的大舞台之前,需要了解一些定义。先从一些与公认的传统有冲突的概念开始,这些概念秘密地潜入了现代科学的前沿阵地。 生物学粗糙的术语,或者太多的「组学」(omks)把人们引向「荒诞」(comics)。 全能的上帝给了人们现在的「组学」 基因组学——所有能找到的基因。 转录组——所有那些行动自由自在的信使们(估计超过 100 000 个)。 蛋白质组学——国王的所有子民和他所有的战马(一支军队:估计 1 000 000 个)。 代谢组学——

    • Nat Commun:结直肠癌致癌突变 RNF43_pG659fs 对 PI3K/mTOR 抑制剂敏感

      结直肠癌的发病率和死亡率仍处于所有类型癌症的前列,并呈现年轻化趋势。尽管针对结直肠癌已开展了广泛的基因组分析,但由于相关突变的致癌作用仍未明确,导致目前基因变异在结直肠癌治疗决策中的应用仍然非常有限 1。因此,亟须研究结直肠癌突变基因的分子机制,以开发更有效的治疗方法。 近日,哈佛大学医学院 Dana Farber Cancer Institute 的 Marios Giannakis 团队和中山大学附属第八医院方丽珊副研究员在 Nature Communications 期刊上发表题为

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