相关产品推荐更多 >
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 询价记录
- 文献和实验
- 技术资料
- 服务名称:
扩增子测序
- 提供商:
威斯腾生物
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目的区域,通过检测目的区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。
二、扩增子测序的优势:
采用目前Illumina HiSeq最长测序平台,可以满足16S 1~2个高变区的测序分析。3天内同时完成3,000个16S样本的测序,测序准确度较MiSeq平台提高10%,而拼接效率较MiSeq平台提高25%,以此获得更全面的菌群信息。
三、扩增子测序操作步骤:
1、研究对象的选取;
2、提取基因组DNA,DNA浓度需要达到5ng/ul,总量需要大于等于150ng;
3、构建PCR-free文库;
4、PE250测序;
5、信息分析 分析内容=标准分析+高级分析,基于目的区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和群落差异性。
四、服务周期:
45天左右
五、威斯腾生物服务流程:

六、威斯腾生物服务项目:
| 分子生物学类 | 蛋白质与免疫学 | 动物实验 |
| 实时荧光定量PCR | 单克隆抗体制备 | 帕金森疾病模型 |
| 免疫共沉淀(Co-IP) | 多克隆抗体制备 | 抑郁症动物模型 |
| ELISA(酶联免疫吸附法)技术 | Western-blot 实验服务 | 脊髓损伤模型 |
| 生化指标检测 | 蛋白双向电泳实验服务 | 脑外损伤模型 |
| 双荧光素酶报告基因检测 | 原核蛋白表达纯化 | 骨神经损伤模型 |
| 染色质免疫共沉淀(ChIP) | 真核蛋白表达纯化 | 心肌缺血模型 |
| GST pull Down | ITRAQ定量蛋白质组学 | 心力衰竭模型 |
| SLAC蛋白组学 | 肺动脉高血压动物模型 | |
| 高血压模型 | ||
| 病毒类 | 实验课题整体外包 | 粥样动脉硬化模型 |
| 过表达/干扰慢病毒包装纯化 | 整体课题外包 | 大脑中动脉阻塞模型 |
| 过表达/干扰腺病毒包装纯化 | 细胞整体实验外包 | 慢性之气管炎模型 |
| 逆转录病毒包装纯化 | 动物整体实验外包 | 过敏性哮喘模型 |
| 腺相关病毒包装纯化 | 肺炎大鼠模型 | |
| 肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
| 蛋白芯片 | 原代细胞培养 | 肝纤维化模型 |
| 细胞因子芯片 | 骨髓间充质干细胞培养 | 胆结石模型 |
| 生长因子芯片 | 脂肪干细胞培养 | 急性胰腺炎模型 |
| 信号通路磷酸化水平检测芯片 | 心肌成纤维细胞培养 | 急性肾衰竭模型 |
| BioPlex悬浮芯片 | 软骨细胞培养 | 体内血栓模型 |
| 生长因子芯片 | 血管内皮细胞培养 | 关节炎模型 |
| 炎症因子芯片 | 神经元细胞培养 | I型和II型糖尿病模型 |
| 血管生成因子芯片 | 内皮组细胞原代培养 | 裸鼠成瘤 |
| 凋亡因子芯片 | 基因编辑动物 | |
| 趋化因子芯片 | 电生理相关服务 | 动物整体实验服务 |
| HuProt TM 20K人类蛋白组芯片 | 膜片钳实验 | |
| 细胞生物学 | 高通量测序 | 代谢组学 |
| 细胞原代培养 | mRNA测序 | 气相色谱GC/MS |
| MTT检测 | LncRNA测序 | 液相色谱LC/MS |
| 细胞凋亡检测 | 全基因组测序 | 核磁共震NMR |
| 细胞周期检测 | RNA-Seq测序 | |
| 细胞克隆形成实验 | 外显子测序 | 影像学相关实验 |
| Transwell细胞迁移/侵袭 | 16s扩增子测序 | Micro-CT |
| 流式分选 | Small RNA测序 | 小动物活体成像 |
| CCK8/XTT检测 | 宏基因组测序 | 核磁共振 |
| 台盼蓝检测细胞活性 | 单细胞测序 | PET-CT |
| 药物筛选细胞学实验 | circleRNA测序 | |
| 细胞粘附性检测 | 甲基化测序 | 基因编辑动物 |
| 细胞划痕实验 | 条件性敲除小鼠/大鼠 | |
| 细胞生物学整体实验 | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
| 细胞成管实验 | ||
| 病理类 | CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
| 扫描电镜 | 基因定点突变细胞系 | LncRNA芯片 |
| 透射电镜 | 单基因敲除细胞系 | miRNA芯片 |
| HE染色 | 多基因敲除细胞系 | mRNA芯片 |
| 免疫组化 | 目的基因敲入细胞系 | 甲基化芯片(限人和小鼠来源样本) |
| Tunel(原位末端凋亡法)检测 | 报告基因敲入细胞系 | SNP芯片(限人和小鼠来源样本) |
| 激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除细胞系 | |
| 免疫荧光 | ||
| Masson染色 | CRISPR/Cas9动物敲除/敲入 | 科研方案设计与SCI相关服务 |
| 原位杂交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | 科研文献论著翻译 |
| 荧光原位杂交 | 基因敲入大鼠/小鼠 | SCI论文翻译润色服务 |
| 特殊染色(PSA、茜素红、阿尔新蓝等) | 临床实验/科研实验设计方案指导 | |
| 行为学检测 | 药物筛选服务项目 | 药效学评价 |
| 水迷宫实验 | 高通量自动药物筛选平台 | 神经系统药物药效学评价 |
| 旷场实验 | 细胞高内涵药物筛选平台 | 抗肿瘤药物药效学评价 |
| 重复性刻板行为检测 | 蛋白质组学靶标研发平台 | 心血管系统药物药效学评价 |
| 动物跑台检测 | 分子药理研究平台 | 泌尿系统药物药效学评价 |
| 强迫游泳 | 生物膜片钳药物筛选平台 | 内分泌系统药物药效学评价 |
| 常规药物体外筛选 | 抗炎免疫药物药效学评价 |
【本平台合作项目】
分子生物学、细胞生物学、基因敲出/入、模式动物、SPF动物保种、病理学检测、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、SiRNA与纳米载药、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!
风险提示:丁香通仅作为第三方平台,为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全,合理判断,谨慎选购商品,商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品,请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
- 作者
- 内容
- 询问日期
文献和实验高阶菌群标志物怎么筛选?试试「多组学联合标志物+验证实验」!
(1)实验规模再度提升,纯数据分析更是如此:纵观近期发表的疾病标志物筛找的实验,实验规模和样本量都是比较大的。一般自主实验的研究样本量至少也要达到几百之上,而纯数据分析的实验,通过集合已发表文章的数据进行分析,因此样本数量至少上千。 (2)标志物的寻找从菌属到菌种再精确到菌株,方法从16S向宏基因组转变:从上两篇文章和近期发表的高分文献当中即可看出,微生物测序的方法已经从16S测序转变为宏基因组,因为宏基因组测序可以将菌种分类做的更好,同时得到代谢功能基因的信息
和4个月样本中,细菌DNA已经占主导地位,到达3.1×108/克(图1c)。通过宏基因组测序,新生儿样本多为人类基因组DNA,1个月和4个月样本中,细菌的丰度和多样性很高。更重要的是,通过对病毒颗粒中DNA与RNA病毒的测序。婴儿1个月大时,检测到病毒种类也开始增加,能够识别到大多病毒样颗粒为噬菌体家族(可以感染细菌的病毒)(图1d和1e),4个月大时,真核病毒(Adenoviridae, Anelloviridae, Caliciviridae和Picornaviridae.)变得更为显著(图1e
高纤维植物饮食 vs. 发酵食物饮食,哪种饮食方式更健康?Cell 最新研究告诉你答案
变化。此外,当与每个参与者消耗的膳食纤维总量相关联时,alpha 多样性也没有明显变化。与此不同,作者发现从基线阶段到维持阶段高纤维饮食组中每克粪便中微生物蛋白的相对丰度有所增加。尽管高纤维饮食组的微生物群多样性或组成没有普遍变化,但粪便中微生物蛋白质百分比的增加表明,纤维可能会促进擅长纤维降解的细菌的生长。宏基因组测序显示 11 种不同碳水化合物活性酶(CAZymes)的相对丰度有所增加;在 10 个推定的非歧义底物预测中,所有预测都表明会降解植物细胞壁碳水化合物。而具有 CAZyme 的菌种
技术资料暂无技术资料 索取技术资料









