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- 2026年01月01日
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上海旭燃生物科技有限公司
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WGBS测序及数据分析
2、样本需求量低，通量高；
3、全基因组覆盖：最大限度地获取完整的全基因组甲基化信息，精确绘制甲基化图谱；
4、单碱基分辨率：可精确分析每一个C碱基的甲基化状态；
| 样本类型 | 建议送样量 | 保存、运输介质 |
| 组织 | ＞100mg | -80℃保存，干冰运输 |
| 细胞 | ＞4 x 10^6 | -80℃保存，干冰运输 |
| 血液 | ＞1ml | -80℃保存，干冰/4度（新鲜）运输 |
| FFPE | A.切片组织面积大于1cm2，切片表面无划痕，无干裂，均匀贴片的石蜡切片； B.切片组织细胞>30000个；有核细胞比例>80%；肿瘤细胞比例>20%，白片厚度5~ 10um，需3-5片，组织面积偏小或细胞核占比未达80%以上，需提供5-12片； C.石蜡块：厚度4mm以上，组织约绿豆大小以上； D.蜡卷：厚度25um左右，2-5卷 |
4℃或常温保存和运输 |
| gDNA | ＞2ug | -80℃保存，干冰运输 |
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文献和实验第一部分 基因组DNA的提取这一步完全可以购买供细胞或组织使用的DNA提取试剂盒，如果实验室条件成熟，自己配试剂提取完全可以。DNA比较稳定，只要在操作中不要使用暴力，提出的基因组DNA应该是完整的。此步重点在于DNA的纯度，即减少或避免RNA、蛋白的污染很重要。因此在提取过程中需使用蛋白酶K及RNA酶以去除两者。使用两者的细节：1、蛋白酶K可以使用灭菌双蒸水配制成20mg/ml；2、RNA酶必须要配制成不含DNA酶的RNA酶，即在购买市售RNA酶后进行再处理，配制成10mg/ml。否则可能
的反应液，使体系真正在所设定的温度下运行。 5：PCR仪：如果在某一个仪器上作出来了，最好一直用此仪器继续。不同的仪器“脾气”也不一样，但EP管必要和仪器内的插孔紧密结合方好，留有空隙，我认为会影响温度的传递。 这一部分有些�嗦，只是个人一些不成熟经验。有疑问处，请大家指出，交流。今天先到这里，现写一些内容，比较费劲，总是不能一挥而就。望见谅。歇息一会准备写最后蓝白斑筛选克隆这一部分。 如果做测序，请继续往下看。 第五部分 PCR产物的凝胶回收 这一步比较
的反应液，使体系真正在所设定的温度下运行。 5：PCR仪：如果在某一个仪器上作出来了，最好一直用此仪器继续。不同的仪器“脾气”也不一样，但EP管必要和仪器内的插孔紧密结合方好，留有空隙，我认为会影响温度的传递。 这一部分有些�嗦，只是个人一些不成熟经验。有疑问处，请大家指出，交流。今天先到这里，现写一些内容，比较费劲，总是不能一挥而就。望见谅。歇息一会准备写最后蓝白斑筛选克隆这一部分。 如果做测序，请继续往下看。 第五部分 PCR产物的凝胶回收 这一步比较
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