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PdiI (NaeI)

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  • Thermo scientific -fermentas
  • ER1521
  • 2025年10月03日
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      大量

    • - FastDigest®限制酶
    • - 推荐的缓冲液 : Tango™
    • - 孵育温度37°C
    • - 连接效率90%
    • - CpG甲基化可能影响DNA切割
    • - 热失活65°C, 20 min
    • - 基因组级别
    • - 重组酶
    • - 蓝/白鉴定
    • - LO合格
    Catalog# Size, concentration Supplied with: Certificate of Analysis MSDS
    10X Buffer Tango™
    ER1521 200 u (10 u/µl) 1.00 ml ER1521
    ER1522 1000 u (10 u/µl) 1.00 ml ER1522
    Reaction conditions
    Recommended buffer for 100% activity Optimal temperature Enzyme activity in Fermentas buffers, % Tango™ buffer for double digestion
    B (blue)
    1X
    G (green)
    1X
    O (orange)
    1X
    R (red)
    1X
    Tango™ (yellow)
    1X / 2X
    Tango™ 37°C 50-100 20-50 0-20 0-20 100 50-100 1X or 2X

    pBR322 DNA
    0.7%琼脂糖
    4 切割位点

    100%酶活性的反应条件
    1X 缓冲液Tango™:
    33 mM Tris-acetate (pH 7.9, 37°C), 10 mM Mg-acetate, 66 mM K-acetate, 0.1 mg/ml BSA。
    37°C酶切。

    保存缓冲液
    PdiI保存在:
    10 mM Tris-HCl (pH 7.5, 25°C), 500 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA, 0.15% Triton X-100和50% (v/v)甘油。

    连接和重新酶切
    50倍PdiI过量酶切后,超过90%的酶切产物可以连接和重新酶切。

    琼脂糖包埋DNA酶切
    至少需要20 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的pBR322 DNA。

    备注
    • PdiI很难切割pBR322的某些位点,其原型酶NaeI也是如此。
    • 底物为pBR322 DNA (#SD0041)。

    商业化同裂酶
    采用REsearch™软件寻找同功酶。

    双酶切
    采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。

    甲基化影响
    Dam: 无重叠 – 不影响。
    Dcm: 无重叠 – 不影响。
    CpG: 完全重叠 – 阻止酶切。
    EcoKI: 无重叠 – 不影响。
    EcoBI: 无重叠 – 不影响。

    Methylation type Sequence Cleavage effect
    CpG

    GCCGGC

    阻止酶切
    Cleavage efficiency close to the termini of PCR fragments
    bp from the recognition site to fragment end
    1 2 3 4 5
    0-20 50-100
    Number of recognition sites in DNA molecules
    Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
    1 0 1 4 0 0
    pTZ19R/U pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+) pBluescriptIISK(-/+) pACYC177 pACYC184
    1 1 1 1 0 5

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    图标文献和实验
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      请问有哪些原核表达载体的mcs含有以下三个以上以下的酶切位点。谢谢 AarI CACCTGC,4,8 MfeI C/AATTG AatII GACGT/C MluI A/CGCGT AccI GT/MKAC MmeI TCCRAC,20,18 AceII GCTAG/C MscI TGG/CCA AclI AA/CGTT NaeI GCC/GGC AfeI AGC/GCT NarI GG/CGCC AflII C/TTAAG NdeI CA/TATG AgeI

    • 内切酶列表:Enzymes Generating Blunt Ends

      I Gm6 A^TC DpnI GATNN^NNATC BseJI GCCC^GGGC SrfI GCC^GGC PdiI GCN^NGC Cac

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