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circRNA PCR芯片

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      课程内容： 1.miRNA Sponge 研究窘境 2.circRNA 研究的重要科学问题 3.新兴的 circRNA 研究思路：修饰，翻译，结合蛋白等等

    • 环状RNA（circRNA）序列查询及引物设计

      列: AGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATCCTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAGAGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGACTATATGGACTGCTTATATAGATTTCAACACTACACTTGCACAATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGTCATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATGACCGTTTCTC 2.根据转换后的序列设计引物,引物设计可以使用Oligo、Primer等软件。 注意 ①引物在剪接点2端,即PCR产物跨越剪接点; ②产物长度在100bp左右。 3.利用NCBI的primer blast工具(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi?LINK_LOC=BlastHome)对设计的引物进行比对,比对结果应该显示引物无特异性扩增序列。 三、无circRNA编码(ID) 如果没有circRNA的编码(ID

    • circRNA 研究有哪些数据库？

      circRNA 的数据库还是很多的，以下几个可供参考：1. circBase网站链接：http://www.circbase.orgcircBase 收集包括以下 6 个物种的 circRNA 信息：人 (hg19)、小鼠 (mm9) 、秀丽线虫 (ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼 (latCha1)、腔棘鱼 (latCha1)。该数据库是目前相对收录信息比较全和完整的，数据也能下载，非常实用。2. Circ2Traits网站链接：http://gyanxet-beta.com

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