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- 染色质免疫沉淀技术（Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是将样品中同抗体靶蛋白相互作用的DNA随免疫复合物沉淀，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，利用该技术不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰以及转录因子与基因表达的关系。
- 2026年01月29日
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- 详细信息
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- 文献和实验
- 技术资料
- 服务名称：
染色质免疫沉淀技术（CHIP）
- 提供商：
武汉金开瑞生物工程有限公司
服务介绍
染色体免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）是用来研究蛋白质与DNA是否在体内存在相互作用，这项技术帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰。利用抗体抗原特异性结合，将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来，能够真实地反映结合在DNA序列上的调控蛋白。
服务优势
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高灵敏度和特异性：能够准确测量特定基因或区域的结合情况，具有较高的灵敏度和特异性。
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适用于小样本量：可以在少量样本的情况下进行分析，适用于资源有限或样本稀缺的研究。
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直接定量分析结合位点的丰度：可以直接测量结合位点的丰度，提供定量分析的能力，可用于比较不同样本之间的差异。
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特定基因或区域的分析：可以针对特定基因或区域进行分析，有助于深入研究感兴趣的结合事件。
- 可与其他实验技术结合使用：如免疫共沉淀、Western blot等，以获得更全面的信息和验证结果。
服务流程
客户提供
需检测的样品，ChIP检测专用抗体（也可以选择由金开瑞提供）。
送样要求：
离体后迅速超低温处理并-80℃冻存的组织样品，干冰运输。
细胞： 尽量提供细胞由我方培养，若培养好细胞、最好先交联再干冰寄送，＞2x107个细胞
组织：动物不少于1 g，植物不少于4 g
最终交付
完整的实验报告、有代表性的图片、测序结果等原始数据。
服务内容
| 服务名称 | 服务内容 | 交付内容及标准 | 服务周期(工作日) |
| ChIP-qPCR | ChIP前蛋白提取+WB | 1个泳道 | 20 |
| ChIP富集 | 富集2次：IgG、IP各1次 | ||
| qPCR实验 | IgG，IP，input各1次 |
案例展示
相关技术服务
● RIP-qPCR ● DNA pulldown ● CoIP
● RNA pulldown ● 酵母单杂交 ● CUT&Tag
相关资源
1、ChIP技术的实验步骤
● 交联：将细胞或组织交联，以固定蛋白质与DNA的相互作用。通常使用甲醛进行细胞或组织的交联。
● 细胞核提取：将交联后的细胞或组织进行细胞核提取，以获得染色质蛋白质复合物。
● DNA剪切：使用限制性酶、酶切酶或超声波等方法将染色质剪切成适当的片段。这样可以将特定蛋白质结合的DNA片段保留下来。
● 免疫沉淀：将剪切后的染色质蛋白质复合物与特定抗体进行免疫反应，使蛋白质与抗体结合。这样可以选择性地富集与特定蛋白质结合的DNA片段。
● 洗涤：将免疫沉淀复合物进行多次洗涤，以去除非特异性结合的DNA和其他杂质。
● 解交联：去除细胞或组织中的交联，使DNA片段恢复到原始的非交联状态。
● DNA纯化：从免疫沉淀复合物中纯化富集的DNA片段。这可以通过酚/氯仿提取、柱层析或商业DNA纯化试剂盒等方法完成。
● DNA分析：对纯化的DNA片段进行进一步的分析，如定量PCR、实时荧光PCR、测序或芯片芯片分析等。
2、ChIP-qPCR技术的应用
● 确定特定转录因子与基因启动子的结合：ChIP-qPCR可以用于验证特定转录因子与目标基因启动子的结合，从而确定转录因子对该基因的调控作用。
● 研究表观遗传修饰和染色质状态：ChIP-qPCR可以用于分析特定表观遗传修饰标记（如组蛋白修饰）与染色质区域的结合情况，揭示染色质状态和基因表达调控之间的关系。
● 验证转录因子结合位点的功能：通过ChIP-qPCR分析不同转录因子结合位点的富集程度，可以确定这些结合位点在基因调控中的功能重要性。
● 研究疾病相关基因的调控：ChIP-qPCR可以用于研究疾病相关基因的调控机制，例如确定转录因子与致病突变基因的结合情况，了解其对基因表达的影响。
3、ChIP-qPCR技术、ChIP-seq和ChIP-chip技术的对比区别
| 技术 | ChIP-seq | ChIP-chip | ChIP-qPCR |
| 概念 | 通过测序分析确定蛋白质与染色质上特定 | 利用芯片技术检测蛋白质与染色质上特定 | 利用定量PCR分析蛋白质与染色质上特定 |
| DNA序列的结合情况。 | DNA序列的结合情况。 | DNA序列的结合情况。 | |
| 优势 | - 高通量分析 | - 适用于小样本量 | - 高灵敏度和特异性 |
| - 可全基因组范围的研究 | - 成本相对较低 | - 适用于小样本量 | |
| - 高灵敏度和特异性 | - 结合位点鉴定和分析 | - 特定基因或区域的分析 | |
| - 不依赖先验知识 | |||
| - 结合位点鉴定和分析 | |||
| 劣势 | - 数据分析复杂 | - 有限的基因覆盖范围 | - 无法进行全基因组范围的研究 |
| - 需要大量测序深度 | - 需要先知道结合位点的区域 | - 仅限于已知的目标基因或区域分析 | |
| - 依赖参考基因组的质量 | |||
| 应用领域 | - 转录因子结合位点鉴定 | - 转录因子结合位点鉴定 | - 转录因子结合位点鉴定 |
| - 基因调控机制研究 | - 表观遗传学研究 | - 基因调控机制研究 | |
| - 表观遗传学研究 | - 疾病相关研究 | - 疾病相关研究 | |
| 举例 | - 确定转录因子X结合位点在肿瘤细胞中的分布情况 | - 分析组蛋白修饰酶在不同发育阶段的结合位点 | - 研究转录因子Y在疾病模型中的结合位点变化 |
金开瑞-提供核酸和蛋白的整体研究方案：
武汉金开瑞生物工程有限公司是一家专业致力于为全球制药企业、诊断试剂企业、科研试剂研发企业、高校和科研院所以及大型医院提供蛋白及相关研究技术服务的高新技术企业。金开瑞极其注重平台技术提升，现已有多项自主知识产权和软件著作权专利，并已通过ISO9001质量管理体系认证，2018获批“千企万人”支持计划。公司以“细胞外囊泡”研究中心、基础生物医学实验中心、蛋白抗体中心和分子生物学中心为依托，提供核酸和蛋白的整体研究方案，与众多科研单位携手开展了大量的探索项目。截止到目前，已支持客户发表科研论文达1000+篇，累计影响因子6000+。
基因服务平台——引物合成、基因合成、DNA提取、载体构建、定点突变；
分子互作研究平台——双萤光素酶报告系统、RNA pull down、RIP/RIP-seq、EMSA等；
蛋白表达平台——提供从基因合成到蛋白表达的一站式服务；
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文献和实验单杂交系统等。但这些方法都有一定的局限性，不能充分反映生理情况下DNA与蛋白相互作用的真实情况，而且很难捕捉到在染色质水平上基因表达调控的动态瞬时事件。染色质免疫沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，简称ChIP）是研究体内蛋白质与DNA相互作用的一种技术。它利用抗原抗体反应的特异性，可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。特别是近年来由于该技术不断的发展和完善，其应用范围已经从研究目的蛋白与已知靶序列间的相互作用，发展到研究目的蛋白与整个基因组的未知
抗体基础实验学习视频系列之三染色质免疫共沉淀实验（CHIP）视频教程，详细演示从裂解液制备到 DNA 定量的全过程。
糖凝胶上检测分析。如图一所示 图一：2.2 超声破碎后，8000g，30秒，4°C,离心。将上清移入新的管子中。开始准备进行染色质免疫共沉淀（IP）。2.3 每份超声样品取50ul，这时的样品标记为INPUT，用于定量DNA浓度和作为PCR的空白对照。超声后的染色质应立刻冻入液氮中或者储存于-70°C可储存2个月。避免多次反复冻融。3检测DNA浓度1INPUT样品用于为后来的IP样品计算DNA浓度。DNA可采用PCR纯化试剂盒（加入70ul洗脱液，接着进入3.2a）或者采用酚/氯仿抽提（加入350ul
