
长链非编码RNA(lncRNA)建库测序服务
- ¥11000
- 北京
- “基因组北方中心(诺赛基因)Illumina Hiseq平台的高通量测序最新潜心开发,推出基于全新的精品——长链非编码RNA(lncRNA)建库测序及痕量DNA基因组建库测序服务,为客户科研服务提供更加强有力的技术手段.
- 2025年07月14日
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 服务名称:
新一代高通量测序及生物信息学服务
- 提供商:
北京诺赛基因组研究中心有限公司
项目流程:
生物信息分析:
基础分析:
- 原始数据质控;
- LncRNA的鉴定;
- LncRNA表达水平分析;
- 差异LncRNA分析;
- 差异LncRNA靶基因预测;
- 差异LncRNA靶基因的GO分析;
- 差异LncRNA靶基因的pathway分析;
- 聚类分析。
高级分析:
- 预测新的LncRNA;
- 新的LncRNA的特征分析;
- 新的LncRNA靶基因预测;
- 新的LncRNA编码潜能预测;
- 新的LncRNA功能注释。
送样要求:
样本类型:RNA样本
样本量(一次):植物、真菌:≥20 ug;动物及原核生物:≥10 ug
样本浓度:植物、真菌:≥250ng/ul;人、大鼠、小鼠:≥65 ng/ul
其它类型动物:≥150 ng/ul;原核生物:≥65 ng/ul
样品纯度:真核:OD260/280=1.8~2.2;OD260/230≥2.0
RIN≥7.0(动物),RIN≥6.5(植物),28S/18S≥1.0;
昆虫样本无此指标
原核:OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.8
RIN≥6.0;23S/16S≥1.0;
技术优势:
- 通过高通量测序技术,可获得样本中几乎全部的lncRNA序列信息;
- 不局限于对已知lncRNA的研究,还可对未知的lncRNA进行预测;
- 除人和鼠外,还可针对其他真核物种进行LncRNA的测序、分析。
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文献和实验长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究表明,lncRNA参与了X染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录激活,转录干扰,核内运输等多种重要的调控过程,lncRNA的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。哺乳动物基因组序列中
长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作用,通过多种机制(如基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等)在多种层面上(如表观遗传学、转录调控及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA 参与多种生物学调控,在生命
还将N-BLR链接到包含motif反向补充的位点(‘target’partners)。所有这些联系意味着,在小鼠细胞中引入N-BLR(通过转染或工程)不太可能有助于研究其在人类环境中的作用:N-BLR的广泛的海绵和目标伙伴网络将缺席。值得注意的是,以前曾有关于mirna、蛋白编码基因及其伪基因的类似偶联的报道。pyknon框架将长链非编码rna和信使rna以大量的组合方式连接在一起。第二,以上的观察结果并不只适用于N-BLR。许多人类的pyknons要么是人类特有的,要么是灵长类特有的。回想一下
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