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识别位点 在不同反应缓冲液中的活性
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文献和实验wj1989113 最近在构建一个质粒。 根据我的目的基因序列,筛了两个酶切位点,而且只有这两个酶切位点能用,XbaI和EcoRI, 设计引物时XbaI 加了两个保护碱基,EcoRI 加了三个保护碱基。根据takara公司的说明,选择了共用Buffer1xM,酶切,连接,转化之后挑克隆,抽质粒酶切鉴定,发现都是空载体。网上说XbaI对甲基化敏感,有什么对策?因为我别无他选,只能用这两个酶。 不胜
酶的活性也是影响克隆成败的关键因素: 1)如果限制性内切酶因为保管不当,导致酶失活或部分失活,那么依据DDDesigner计算出来的酶量就不能保证完全酶切。 2)如果制备的质粒DNA的质量不好(如细菌培养时间过长,质粒制备时裂解不充分或裂解时间过长等),那么对这种质粒DNA进行酶切时,即使酶活性正常,酶量足够,也不能实现完全酶切,因为其中很多质粒DNA已经变性,不能被切开。 下面是一个简单的实验设计,可以用于分析各种可能的问题。 如:拟用NEB的EcoRI
用于克隆筛选).因为引物上带了EcoRV位点,又可以进一步做成T载体,再把基因克进去,如此反复... 关键是T载体要制备的好,筛选的时候多挑几个克隆,如果需要定向克隆基因的话可利用载体上的引物筛选之,然后利用基因内部合适的酶切位点来验证... 欢迎交流! qianjing930 我做过三段重复片段的串联,用的是pBV220载体. 第一对引物为EcoRI_KpnI_____BamHI;第一段单体插入pBV220载体中的EcoRI
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