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文献和实验Methylation analyis using restriction enzyme digestion
. Since in eukaryotic DNA (or actually in mammalian DNA) only cytosine in CG context can be methylated, the restriction enzymes with CG sequences within their restriction sites come in question. Two classical enzyme pairs are HpaII - MspI (CCGG) and SmaI - XmaI (CCCGGG
Methylation analyis using restriction
µg of DNA overnight with a first enzyme,cutting out the fragment of interest in combination with HpaII,and another 10 µg with first enzyme in combination with MspI.Reaction volume should be about 50 µl. Inactivate the enzymes by heating (look
我的课题涉及到CYP1A1的多态,从文献上(cancer res等级别的文章,而且重复的人挺多)查到它的一个MspI多态位点引物为5’-CAG TGA AGA GGT GTA GCC GCT-3'和5’-TAG GAG TCT TGT CTC ATG CCT-3’,但我有扩增出了其他引物的条件都没有能扩增出这对引物的目标带,做梯度从48到65度都没有带出来。下面是所查的该引物的Blast的资料和该基因这个位点的基因序列资料,请高手帮忙分析一下到底这对引物可不可以扩出来 Blast资料
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